一种类孟买血型FUT1236delG等位基因及其检测方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种类孟买血型FUT1 236delG等位基因及其检测方法和应用，所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因为Hh血型系统变异型FUT1基因编码区域由起始密码子第236位碱基缺失了1个G。还提供了FUT1基因突变检测制品和检测方法，利用突变基因与野生型基因在突变点碱基序列的差异设计出序列特异性引物，并通过基因扩增方法对携带突变基因的个体进行鉴别；该检测制品和检测方法可高灵敏度且高精度检测掺杂于基因库中该突变基因的有无。不仅可用于特定个体的FUT1基因鉴别及(类)孟买血型鉴定，而且由于筛选成本低、操作简单，还可用于大量样本的筛选，为(类)孟买血型患者提供相合的血液。合的血液。合的血液。

【技术实现步骤摘要】
一种类孟买血型FUT1 236delG等位基因及其检测方法和应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学分析检测
，涉及一种类孟买FUT1236delG等位基因及其检测方法和应用。

技术介绍

[0002]血型系统是指根据红细胞膜上抗原的差异而对血液进行分型。截止至2021年2月，国际输血协会(ISBT)确认了人类红细胞血型系统共有43个。Hh血型系统又称为孟买血型系统，是根据红细胞表面是否存在H抗原而对血液分型的人类血型系统。H抗原是每个ABO血型抗原的前体。决定H抗原的FUT1基因在19号染色体上，长度超过5000个碱基对，含有4个外显子。FUT1基因有两个等位基因H和h，H等位基因编码岩藻糖转移酶，使岩藻糖与糖链末端的半乳糖相连形成H抗原，而h等位基因无法编码具有活性的岩藻糖转移酶。hh纯合子个体在人类中非常罕见，主要包括孟买型(H抗原完全缺失的非分泌性)和类孟买型(H抗原部分缺失)。类孟买血型在我国极其罕见，由于类孟买血型的个体无法合成A抗原、B抗原，以及这两种抗原的前体物H抗原，同时由于天然免疫，体内会产生抗A、抗B和抗H抗体，因此他们不能接受任何ABO血型的血液。在ABO血型的常规检测中，类孟买血型者往往会被误认为O型，若未经进一步详查，误输入O型血，抗H免疫球蛋白激活补体级联反应，将会导致红细胞溶解，引发急性溶血性输血反应。为了保障患者输血安全，对类孟买血型进行检测具有非常重要的临床价值。即使明确患者为(类)孟买血型，找到与之相合的罕见(类)孟买血型的献血者也极为困难。因此建立(类)孟买血型捐献者资料库非常有必要。由于该血型极其罕见，需要筛选大量献血者方可发现一二，因此操作简单、结果精确、技术要求低、筛选成本低等适用于大量样本检测的方法亟待开发。目前，类孟买血型的常规检测方法是采用血型血清学方法，包括：ABO正定型、ABO反定型、H血型正定型、H血型反定型、抗H效价试验、吸收放散试验检测红细胞表面的ABH抗原等。该方法不仅操作繁琐、结果也存在不稳定性和不确定性，不适合临床大规模应用。此外，抗
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H试剂价格高、不易长期保存。相比之下，基因检测可用于批量检测，而且对类孟买血型的检测结果可靠、精确。通过检测FUT1基因型确定类孟买表型，不仅在弥补血清学技术的不足上具有重要的临床实用意义，而且还具有广泛的科研应用价值。
[0003]目前，对FUT1基因突变的鉴定均通过测序方法进行，但该方法存在一些难以克服的缺点：操作过程复杂，技术要求高，试剂昂贵，检测费用高，测序仪普及率低，普通实验室无法开展等，这些缺点使其在临床应用中受到很大的限制。
[0004]因此一种操作简单、结果精确、技术要求低、筛选成本低并适用于大量样本的类孟买血型检测方法是亟需解决的问题。

技术实现思路

[0005]针对现有技术所存在的技术问题，本专利技术提供了一种类孟买FUT1 236delG等位基因及其检测方法和应用，不仅可用于特定个体的FUT1基因鉴别及(类)孟买血型鉴定，而且
由于筛选成本低、操作简单，还可用于大量样本的筛选，以建立(类)孟买血型捐献者资料库，为(类)孟买血型患者提供相合的血液。
[0006]本专利技术采用如下技术方案：
[0007]在本专利技术实施例的第一方面，提供了一种类孟买血型FUT1236delG等位基因，所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因为Hh血型系统变异型FUT1基因编码区域由起始密码子第236位碱基缺失了1个G。
[0008]在本专利技术实施例的第二方面，提供了一种所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因在制备用于检测类孟买血型的制品中的应用。
[0009]在本专利技术实施例的第三方面，提供了一种用于检测红细胞类孟买血型的引物对，所述的引物对的序列如SEQ ID NO:1
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SEQID NO:3所示，所述类孟买血型FUT1基因236delG等位基因的引物序列如下：
[0010]236delG
‑
F：如SEQ ID NO:1所示，
[0011]440Wild
‑
R：如SEQ ID NO:2所示；
[0012]针对野生型FUT1基因的引物序列如下：
[0013]236Wild
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F：如SEQ ID NO:3所示，
[0014]反向引物：如SEQ ID NO:2所示；反向引物序列为突变型与野生型共用，不具突变鉴别特异性。
[0015]在本专利技术实施例的第四方面，提供了一种用于检测红细胞类孟买血型的制品，所述制品是用于检测待检测的样品是否存权利要求1所述的类孟买血型FUT1 236delG等位基因。
[0016]进一步地，所述制品包括PCR扩增测序检测试剂盒，所述PCR扩增测序检测试剂盒包括所述的引物对。
[0017]进一步地，所述PCR扩增测序检测试剂盒还包括2
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Taq PCR MasterMix和内参引物对。
[0018]在本专利技术实施例的第五方面，提供了一种类孟买血型FUT1基因236delG等位基因的检测方法，所述检测方法包括：通过基因扩增方法对包含突变位点的目的片段进行选择性扩增，由此检测该突变基因的有无，检测方法包括以下步骤：
[0019]提取待检样本中的基因组DNA；
[0020]以所述基因组DNA为模板，采用用于检测红细胞类孟买血型的引物对进行PCR反应，得到PCR反应产物；
[0021]利用凝胶电泳法检测所述PCR反应产物的条带格局；
[0022]根据所述条带格局判断被检样本是否携带236delG等位基因，并鉴别纯合型或杂合型。
[0023]进一步地，所述根据所述条带格局判断被检样本是否携带236delG等位基因，并鉴别纯合型或杂合型，具体包括：
[0024]若待检测样本的所述条带格局为：没有236delG特异性扩增产物条带，表明待检测样本为非携带者；
[0025]若待检测样本的所述条带格局为：有236delG特异性扩增产物条带，表明待检测样本为236delG等位基因携带者；进一步判断236delG等位基因携带者为纯合型或杂合型，包
括：
[0026]若待检测样本的所述条带格局为：既有236delG特异性扩增产物条带又有440wild特异性扩增产物条带，表明待检测样本为杂合型236delG等位基因携带者；
[0027]若待检测样本的所述条带格局为：只有236delG特异性扩增产物条带而没有440wild特异性扩增产物条带，表明待检测样本为纯合型236delG等位基因携带者。
[0028]进一步地，所述用于检测红细胞类孟买血型的引物对如权利要求3所示，所述236delG特异性扩增产物条带和所述440wild特异性扩增产物条带的长度均为250bp；
[0029]同时引入1对管家基因β
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actin引物作为DNA样本扩增阳性内参照，所述内参基因引物对的序列如SEQ ID NO:4...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种类孟买血型FUT1236delG等位基因，其特征在于，所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因为Hh血型系统变异型FUT1基因编码区域由起始密码子第236位碱基缺失了1个G。2.权利要求1所述类孟买血型FUT1 236delG等位基因在制备用于检测类孟买血型的制品中的应用。3.一种用于检测红细胞类孟买血型的引物对，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQ ID NO:1
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SEQ ID NO:3所示，其中，针对所述类孟买血型FUT1基因236delG等位基因的引物序列如SEQ ID NO:1所示和SEQ ID NO:2所示，针对野生型FUT1基因的引物序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:2所示，4.一种用于检测红细胞类孟买血型的制品，其特征在于，所述制品是用于检测待检测的样品是否存权利要求1所述的类孟买血型FUT1 236delG等位基因。5.根据权利要求4所述的一种用于检测红细胞类孟买血型的制品，其特征在于，所述制品包括PCR扩增测序检测试剂盒，所述PCR扩增测序检测试剂盒包括权利要求3所述的引物对。6.根据权利要求5所述的一种用于检测红细胞类孟买血型的制品，其特征在于，所述PCR扩增测序检测试剂盒还包括2
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Taq PCR MasterMix和内参引物对。7.一种类孟买血型FUT1236delG等位基因的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括：通过基因扩增方法对包含突变位点的目的片段进行选择性扩增，由此检测该突变基因的有无，检测方法包括以下步骤：提取待检样本中的基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，采用用于检测红细胞类孟买血型的引物对进行PCR反应，得到PCR反应产物；利用凝胶电泳法检测所述PCR反应产物的条带格局；根据所述条带格局判断被检样本是否携带236delG等位基因，并鉴别纯合型或杂合型。8.根据权利要求7所述的一种类孟买血型FUT1...

【专利技术属性】
技术研发人员：邹洁，沈钢，任明，石小玲，江梦天，何鸣镝，
申请(专利权)人：武汉血液中心，
类型：发明
国别省市：