调节RNA的方法技术

本披露总体上涉及用于调节RNA的方法和组合物，例如使用包含Pumilio同源结构域的多肽。例如使用包含Pumilio同源结构域的多肽。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】调节RNA的方法
[0001]相关申请
[0002]本申请要求2018年11月29日提交的美国序列号62/772,907，2018年12月12日提交的美国序列号62/778,361和2018年12月17日提交的美国序列号62/780,442的优先权，其内容各自通过引用以其全文并入文中。

技术实现思路

[0003]本文描述了用于改变RNA结构和功能以调节生物过程的组合物和方法。
[0004]一级核苷酸序列决定了RNA的二级和三级结构。核苷酸的碱基配对形成了RNA配体(如蛋白质)结合所必需的茎、环和组合。这样，RNA的一级序列的编辑以及由此的二级和/或三级结构的编辑可以改变其配体结合特性，并提供调节下游过程而不改变配体(例如，RNA结合多肽)的功能的方式。本文描述了调节RNA一级、二级和三级结构和功能和/或剪接以影响由RNA
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配体相互作用和/或RNA编码产物的表达实现的过程的组合物和相关方法。
[0005]因此，在一方面，本披露涉及多肽，该多肽包含：(a)RNA结合结构域，该RNA结合结构域包含多个(例如，2
‑<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种多肽，该多肽包含：(a)RNA结合结构域，该RNA结合结构域包含多个(例如，2
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50、10
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30、或16
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21个)RNA碱基结合基序，每个基序与RNA碱基结合，并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合，该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域。2.一种多肽，该多肽包含：(a)RNA结合结构域，该RNA结合结构域包含多个(例如，2
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21个)RNA碱基结合基序，每个基序与RNA碱基结合，并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合，该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域，其中该多肽不包含核酸酶或其功能片段。3.一种多肽，该多肽包含：(a)RNA结合结构域，该RNA结合结构域包含多个(例如，2
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50、10
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21个)RNA碱基结合基序，每个基序与RNA碱基结合，并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合，该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA编辑结构域，该异源RNA编辑结构域包含脱氨酶的催化结构域或其功能片段或变体。4.一种多肽，该多肽包含：(a)RNA结合结构域，该RNA结合结构域包含多个(例如，2
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21个)RNA碱基结合基序，每个基序与RNA碱基结合，并且这些基序在该RNA结合结构域中有序排列以与靶RNA序列中连续顺序的RNA碱基结合，该RNA结合结构域连接至(b)异源RNA效应子，该异源RNA效应子包含剪接因子。5.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该多个RNA碱基结合基序包含至少3个(例如，至少4个、至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个、14
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24个、15
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23个、16
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21个、2
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10个、2
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8个、3
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20个、3
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15个、3
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10个、3
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8个、4
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8个、多达25个、多达30个)PUM RNA结合基序。6.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域结合2
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50个核苷酸(例如，14
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30、15
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26、16
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21、2
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40、2
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25、2
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20、5
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50、5
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15、2
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18、2
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9、4
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9、5
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8个核苷酸)的RNA序列。7.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域是90
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500个氨基酸残基，例如，90
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450个氨基酸残基、90
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400个氨基酸残基、90
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350个氨基酸残基、90
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300个氨基酸残基、120
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400个氨基酸残基。8.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域与野生型PUM
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HD，例如野生型人PUM1
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HD的相应的氨基酸序列具有至少80％同一性(例如，至少85％同一性、至少87％同一性、至少90％同一性、至少92％同一性、至少95％同一性、至少97％同一性、至少98％同一性、或99％同一性)并小于100％同一性。9.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域结合包含疾病相关突变的RNA序列。10.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域结合包含疾病相关突变的RNA序列并且该RNA编辑结构域编辑(例如，纠正)该疾病相关突变。11.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域包含多肽，该多肽包含RNA脱氨酶(例如，腺苷脱氨酶或胞苷脱氨酶)的催化结构域或其功能片段或变体。12.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域包含以下项的催化结构
域：作用于RNA的腺苷脱氨酶(ADAR)(例如，人ADAR l、人ADAR2、人ADAR3、或人ADAR4)；作用于tRNA的腺苷脱氨酶(ADAT)；作用于RNA的胞嘧啶脱氨酶(CDAR)；或其功能片段或变体。13.如权利要求11或12所述的多肽，其中该脱氨酶的该催化结构域与表B中所示的序列至少80％相同(例如，至少85％、87％、90％、92％、95％、98％、99％、100％相同)。14.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域修饰该靶RNA序列或包含该靶序列的RNA的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10(例如，1
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9、或9
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10)个核苷酸。15.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域修饰该靶RNA序列或包含该靶序列的RNA的单个核苷酸。16.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域将碱基改变为另一碱基，例如，将胞嘧啶改变为尿嘧啶；将腺苷改变为肌苷；或将鸟苷改变为腺苷。17.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域修饰该靶RNA序列的氨基酸编码序列。18.如权利要求17所述的多肽，其中对该靶RNA序列的该氨基酸编码序列的修饰改变了由该靶RNA序列编码的产物多肽的氨基酸序列。19.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA编辑结构域修饰该靶RNA序列的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10(例如，1
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10)个核苷酸，并且任选地不超过该靶RNA序列的1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10个核苷酸。20.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域结合RNA的二级结构。21.如任一前述权利要求所述的多肽，其中该RNA结合结构域结合前体mRNA，例如，前体mRNA的内含子
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外显子连接。22.如任一前述权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：DA贝里，C罗兹，JD法雷利，
申请(专利权)人：旗舰先锋创新V股份有限公司，
类型：发明
国别省市：