一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。本发明专利技术提供了用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质在鉴定绵羊产羔数性状、鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔、鉴定绵羊产羔数多少中的应用。本发明专利技术找到了与绵羊产羔相关的最显著遗传标记chr2：8283097，并建立了该标记一种简便的检测应用方法，从而提供一种在现实工作中快速、准确选育优良品种的方法。法。

【技术实现步骤摘要】
一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。

技术介绍

[0002]随着分子生物学和生物信息学的发展，涌现出通过分子标记的方法来进行育种。DNA分子标记的优越性：大多数分子标记具有共显性，对隐形性状的选择有利；分子标记的数量几乎是无限的；检测手段简单、迅速等优点。DNA分子标记主要有限制性片断长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLPs)标记、随机扩增多态性DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA，RAPDs)标记、扩增片断长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphisms，AFLPs)、简单重复序列(Simple Sequence Repeats，SSR)、单核苷酸多态性标记(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)等。
[0003]单核苷酸多态性标记(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)是指基于基因组水平上的由单个核苷酸引起的DNA序列多态性。SNP分型的方法主要有基于电泳的检测方法(PCR
‑
RFLP、PCR
‑
SSCP、AS
‑
PCR)、基于荧光定量PCR的检测方法(TaqMan探针法、HRM)、直接测序法、其它检测方法(质谱分析、SNaPshot、LDR)。其中PCR
‑/>RFLP是SNP筛查中最经典的方法之一，利用限制性内切酶作用于DNA片段，如果存在SNP位点，酶切产物的长度和数量则会出现差异，通过琼脂糖凝胶电泳就可以判断SNP位点基因型，该方法检测迅速，价格低廉。
[0004]绵羊产羔数是重要的经济性状，东弗里升绵羊属于国外典型的高产绵羊品种，具有较高繁殖力。

技术实现思路

[0005]本专利技术要求保护一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。
[0006]第一方面，本专利技术要求保护一种用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质在如下任一中的应用：
[0007](A1)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状；
[0008](A2)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状的产品；
[0009](A3)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔；
[0010](A4)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔的产品；
[0011](A5)鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少；
[0012](A6)制备用于鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少的产品。
[0013]其中，所述用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质可为引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂或试剂盒。
[0014]所述引物对由上游引物和下游引物组成；所述上游引物可根据所述绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的上游序列进行设计；所述下游引物可根据所述
绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的下游序列进行设计。
[0015]在本专利技术中，所述引物对为引物对A；所述引物对A由SEQ ID No.1所示的上游引物和SEQ ID No.2所示的下游引物组成。
[0016]在本专利技术中，所述成套引物对由引物对B和引物对C组成；所述引物对B由SEQ ID No.3所示的上游引物和SEQ ID No.4所示的下游引物组成；所述引物对C由SEQ ID No.5所示的上游引物和SEQ ID No.6所示的下游引物组成。
[0017]进一步地，所述试剂盒中含有所述成套引物对，还含有限制性内切酶DraI。
[0018]第二方面，本专利技术要求保护一种鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数为多羔还是单羔的方法。
[0019]本专利技术要求保护的鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数为多羔还是单羔的方法，可包括如下步骤：
[0020](B1)检测待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T，然后按照如下确定基因型：
[0021]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为A:A型；
[0022]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是T的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为T:T型；
[0023]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A和T的杂合体，则所述待测绵羊的基因型为A:T型；
[0024](B2)按照如下确定所述待测绵羊产羔数为多羔还是单羔：如果所述待测绵羊的基因型为A:A型，则所述待测绵羊的产羔数为或候选为多羔；如果所述待测绵羊的基因型为T:T型或A:T型，则所述待测绵羊的产羔数为或候选为单羔。
[0025]第三方面，本专利技术要求保护一种鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数多少的方法。
[0026]本专利技术要求保护的鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数多少的方法，可包括如下步骤：
[0027](C1)检测待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T，然后按照如下确定基因型：
[0028]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为A:A型；
[0029]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是T的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为T:T型；
[0030]如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A和T的杂合体，则所述待测绵羊的基因型为A:T型；
[0031](C2)按照如下确定所述待测绵羊产羔数多少：基因型为A:A型的所述待测绵羊的产羔数多于或候选多于基因型为T:T型或A:T型的所述待测绵羊的产羔数。
[0032]在步骤(B1)和(C1)中，可按照包括如下任一步骤的方法检测待测绵羊的基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T：
[0033]P1、以所述待测绵羊的基因组DNA为模板，采用前文所述成套引物对进行嵌套式PCR扩增，得到扩增产物(即，先以所述待测绵羊的基因组DNA为模板采用所述引物对B进行
第一轮PCR扩增，得到第一轮扩增产物；然后以所述第一轮扩增产物为模板采用所述引物对C进行第二轮PCR扩增，得到第二轮扩增产物，即为此处的所述“扩增产物”)；然后用限制性内切酶DraI对所述扩增产物进行酶切，根据酶切结果按照如下确定所述待测绵羊的基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T：如果酶切产物含有106bp目的条带且不含76bp和30bp目的条带，则所述待测绵羊的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质在如下任一中的应用：(A1)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状；(A2)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状的产品；(A3)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔；(A4)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔的产品；(A5)鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少；(A6)制备用于鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少的产品。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质为引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂或试剂盒；所述引物对由上游引物和下游引物组成；所述上游引物根据所述绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的上游序列进行设计；所述下游引物根据所述绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的下游序列进行设计。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述引物对为引物对A；所述引物对A由SEQ ID No.1所示的上游引物和SEQ ID No.2所示的下游引物组成；或所述成套引物对由引物对B和引物对C组成；所述引物对B由SEQ ID No.3所示的上游引物和SEQ ID No.4所示的下游引物组成；所述引物对C由SEQ ID No.5所示的上游引物和SEQ ID No.6所示的下游引物组成。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述试剂盒中含有所述成套引物对，还含有限制性内切酶DraI。5.如下任一方法：方法I：一种鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数为多羔还是单羔的方法，包括如下步骤：(B1)检测待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T，然后按照如下确定基因型：如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为A:A型；如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是T的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为T:T型；如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A和T的杂合体，则所述待测绵羊的基因型为A:T型；(B2)按照如下确定所述待测绵羊产羔数为多羔还是单羔：如果所述待测绵羊的基因型为A:A型，则所述待测绵羊的产羔数为或候选为多羔；如果所述待测绵羊的基因型为T:T型或A:T型，则所述待测绵羊的产羔数为或候选为单羔；方法II：一种鉴定或辅助鉴定待测绵羊产羔数多少的方法，可包括如下步骤：(C1)检测待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T，然后按照如下确定基因型：如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A的纯合体，则所述待测绵羊的基因型为A:A型；
如果所述待测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是T的纯合体，则所述待测绵羊...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩红兵，汪林丽，黄建伟，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：