基因在评估口腔鳞癌中的应用制造技术

本发明专利技术公开了基因在评估口腔鳞癌中的应用，具体的涉及基因AC108142.1或LINC01160，通过对癌样本和对照样本进行检测，发现AC108142.1或LINC01160在两组中呈现显著性差异，且应用于口腔鳞癌的诊断具有较高的敏感性、特异性和准确性。

【技术实现步骤摘要】
基因在评估口腔鳞癌中的应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及基因在评估口腔鳞癌中的应用。
技术介绍
口腔鳞状细胞(OralSquamousCellCarcinoma,OSCC)是恶性程度最高的恶性肿瘤之一，同样是最常见的口腔肿瘤类型，口腔鳞状细胞癌患者常常伴有转移、高的复发率以及差的预后。流行病学统计分析每年全球大约有10万人死于口腔鳞状细胞癌及其带来的病发症，因此口腔鳞状细胞癌给整个社会医疗保障体系带来了巨大的挑战与负担。作为一种多因素导致的疾病，当前的研究认为烟草与酒精是导致其发生、发展的重要因素，同样慢性炎症、人类疱疹病毒感染也同样与该病的产生密切相关，除了环境因素，易感的基因遗传背景也是导致口腔鳞状细胞癌产生的重要原因。OSCC的致病机理尚不完全明确，这也导致其有效治疗手段的相对单一，长期治疗效果不理想(AbdallaZ,WalshT,ThakkerN,etal.LossofepithelialmarkersisanearlyeventinoraldysplasiaandisobservedwithinthesafetymarginofdysplasticandTIOSCCbiopsies[J].PLoSOne,2017,12(12):e0187449.)。且OSCC治疗代价大，往往伴随患者生存质量的下降。因此早期诊断是OSCC治疗的关键，也是改善患者预后情况的基本环节。对于OSCC的诊断，传统的体格检查与辅助检查常常难以准确高效的判断肿瘤类型，进展程度，更难以推测其预后情况。而检测生物标志物，能够对肿瘤的存在、进展以及预后情况做出一定程度的判断，进而为肿瘤的早期诊断提供了可能，也从一定程度上为肿瘤的早期治疗提供了指导和方向。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种与口腔鳞癌的相关的基因标志物，使用该基因标志物，可以判断评估患者是否患口腔鳞癌以及患口腔鳞癌的风险。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了基因在制备用于诊断口腔鳞癌的产品中的应用，所述基因选自AC108142.1或LINC01160的一种或两种。进一步，所述产品包括检测样本中AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂，其中，所述样本包括细胞、组织、脏器、体液(血液、淋巴液等)、消化液、咳痰、肺胞支气管清洗液、尿、粪便等。优选的，所述样本为组织、血液。在本专利技术的具体实施方式中，所述样本为组织。进一步，AC108142.1或LINC01160在口腔鳞癌患者中表达上调。进一步，所述试剂包括通过RT-PCR、实时定量PCR、原位杂交或芯片检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂。进一步，所述通过RT-PCR检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂至少包括一对特异扩增AC108142.1或LINC01160基因的引物；所述通过实时定量PCR检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂至少包括一对特异扩增AC108142.1或LINC01160基因的引物；所述通过原位杂交检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括与AC108142.1或LINC01160基因的核酸序列杂交的探针；所述通过芯片检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括与AC108142.1或LINC01160基因核酸序列杂交的探针。本专利技术的第二方面提供了一种诊断口腔鳞癌的产品，所述产品包括制剂、核酸膜条、芯片或试剂盒，其中，所述制剂、核酸膜条、芯片或试剂盒包括检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂。进一步，所述芯片中检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括特异性识别AC108142.1或LINC01160基因的探针。进一步，所述试剂盒中检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括特异性扩增AC108142.1或LINC01160基因的引物；或特异性识别AC108142.1或LINC01160基因的探针。本专利技术所述的基因芯片或基因检测试剂盒可用于检测包括AC108142.1或LINC01160在内的多个基因(例如，与口腔鳞癌相关的多个基因)的表达水平。将口腔鳞癌的多个标志物同时进行检测，可大大提高口腔鳞癌诊断的准确率。本专利技术的第三方面提供了基因在制备治疗口腔鳞癌的药物组合物中的应用，所述基因选自AC108142.1或LINC01160。进一步，所述药物组合物包括AC108142.1或LINC01160的抑制剂。进一步，所述抑制剂为特异性降低AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂。进一步，所述抑制剂为干扰RNA。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术选择AC108142.1或LINC01160作为基因标志物，可以实现口腔鳞癌的辅助诊断，为患者的个性化治疗提供新的手段。本专利技术利用AC108142.1或LINC01160开发成检测产品，检测快速方便、检测灵敏度、特异度高、成本低，可以满足绝大多数口腔鳞癌病人的检测需求，应用范围广。附图说明图1是生物标志物在口腔鳞癌组织中的表达情况图，其中，图A是AC108142.1在口腔鳞癌组织中的表达情况图；图B是LINC01160在口腔鳞癌组织中的表达情况图。图2是生物标志物作为检测变量的ROC曲线图，其中，图A是AC108142.1作为检测变量的ROC曲线图；图B是LINC01160作为检测变量的ROC曲线图，图C是AC108142.1与LINC01160联合作为检测检测变量的ROC曲线图。具体的实施方式本专利技术通过广泛而深入的研究，首次发现了AC108142.1或LINC01160在口腔鳞癌患者中呈现显著性差异表达，并进一步评估了AC108142.1或LINC01160的诊断效能，结果显示，AC108142.1和/或LINC01160用于口腔鳞癌的诊断具有较高的效能。基因标志物“基因标志物”也称为“生物标志物”，是在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因或蛋白。本文包含用于检测分子标志物表达的现有技术中任何可用方法。本专利技术分子标志物的表达可在核酸水平上被检测(如，RNA转录物)或蛋白质水平。通过“检测表达”旨在确定RNA转录物或其分子标志物基因的表达产物的数量或存在。因此，“检测表达”包含一分子标志物被确定不能被表达、不能被检测表达，表达在低水平、表达在正常水平或过表达的实例。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的标志物基因的任何特定变体的基因表达进行定量。所述AC108142.1基因在ensembl数据库的基因ID为ENSG00000177822，所述LINC01160基因在ensembl数据库的基因ID为ENSG00000231346。本专利技术还涉及上述基因的多核苷酸的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.基因在制备用于诊断口腔鳞癌的产品中的应用，其特征在于，所述基因选自AC108142.1或LINC01160的一种或两种。/n

【技术特征摘要】
1.基因在制备用于诊断口腔鳞癌的产品中的应用，其特征在于，所述基因选自AC108142.1或LINC01160的一种或两种。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括检测样本中AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，AC108142.1或LINC01160在口腔鳞癌患者中表达上调。


4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过RT-PCR、实时定量PCR、原位杂交或芯片检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂。


5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述通过RT-PCR检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂至少包括一对特异扩增AC108142.1或LINC01160基因的引物；所述通过实时定量PCR检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂至少包括一对特异扩增AC108142.1或LINC01160基因的引物；所述通过原位杂交检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括与AC108142.1或LINC01160基因的核酸序列杂交的探针；所述通过芯片检测AC108142.1或LINC01160表达水平的试剂包括与AC108142.1或...

【专利技术属性】
技术研发人员：王月红，唐瞻贵，刘欧胜，邓智元，潘灏，方小丹，全宏志，王柏胜，顾立群，李龙，戴小寒，
申请(专利权)人：湖南中南大学湘雅口腔医院，
类型：发明
国别省市：湖南;43