【技术实现步骤摘要】
一种基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统及其鉴定或验证方法
[0001]本专利技术属于分子生物学
,涉及一种已知分子与蛋白质相互作用检测系统,尤其涉及一种基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统及其鉴定或验证方法。
技术介绍
[0002]蛋白质是生命活动的执行者。超过80%的蛋白质通过与其他分子相互作用发挥功能,包括胚胎发育、细胞通讯、受体
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配体结合、信号传导等广泛的生命过程。无序、失控的蛋白质
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分子相互作用可能引发癌症、神经退行性疾病等(kesin et al.,2016.Chem.Rev.,116,4884
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4909)。生理过程中小分子或小分子药物与蛋白质的相互作用在生物医学和临床应用中研究广泛,有助于对机体生理代谢过程的进一步理解以及指导药物设计与合成。发现和验证蛋白质与其他分子如蛋白、DNA、RNA、小分子的相互作用,对于在分子层面揭示生命活动的内在规律具有重要意义。蛋白质
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分子的相互作用研究一直存在两个难点,一是由 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述检测系统包括以下分子:a)链霉亲和素
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短肽四聚体;b)PafA酶;c)生物素修饰的已知分子。2.根据权利要求1所述的基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述链霉亲和素
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短肽四聚体中,短肽为含有12
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100个氨基酸的肽链。3.根据权利要求2所述的基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述短肽包括Pup分子或其突变分子,且所述Pup分子末端的谷氨酰胺突变为谷氨酸,其序列如SEQ ID NO.1所示;所述Pup的突变分子为存在一个或多个突变的Pup分子,序列如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4中的任一序列所示。4.根据权利要求1所述的基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述PafA酶表面的7个赖氨酸突变为精氨酸,突变位点为K162R,K202R,K320R,K361R,K423R,K435R和K446R。5.根据权利要求1所述的基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述生物素修饰的已知分子包括蛋白、DNA、RNA、小分子中的任一种或多种。6.根据权利要求5所述的基于共价连接的已知分子与蛋白质相互作用检测系统,其特征在于,所述蛋白包括蛋白质、肽、修饰肽、抗体、凝集素中的至少一种;所述RNA包括信使RNA、核糖体RNA、长链非编码RNA、非编码小RNA中的至少一种;所述DNA包括双链DNA、闭环DNA中的至少一种;所述小分子包括生物体中具有生物活性的寡核苷酸、氨基酸、维生素、动植物微生物的次级代谢产物以及化学合成的小分子中的至少一种。7.一种根据权利要求1所述的检测系统用于鉴定已知分子与蛋白质相互作用的方法,其特征在于,包括以下步骤:A、将生物素化的已知分子及待测样品充分混匀,并于25℃
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35℃孵育0
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1h;B、...
【专利技术属性】
技术研发人员:陶生策,江何伟,郑云萧,陈红,王雪宁,
申请(专利权)人:上海交通大学,
类型:发明
国别省市:
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