与调节细胞内乳酸浓度的反式代谢分子组合的嵌合受体多肽及其治疗用途制造技术

技术编号:28686186 阅读:14 留言:0更新日期:2021-06-02 03:06
本文公开了遗传工程化的造血细胞,所述遗传工程化的造血细胞表达一种或多种乳酸调节因子(例如,多肽)和任选的嵌合受体多肽(例如,抗体偶联的T细胞受体(ACTR)多肽或嵌合抗原受体(CAR)多肽),所述嵌合受体多肽能够与感兴趣的靶抗原结合。本文还公开了工程化的造血细胞用于抑制在有需要的受试者中表达靶抗原的细胞的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】与调节细胞内乳酸浓度的反式代谢分子组合的嵌合受体多肽及其治疗用途相关申请的交叉引用本申请要求提交于2018年9月7日的美国临时申请号62/728,338和提交于2018年9月7日的美国临时申请号62/728,306的提交日的权益。这些在先申请中的每一者的全部内容以引用方式并入本文。
技术介绍
癌症免疫疗法(包括基于细胞的疗法)用于在保留正常组织的同时激发攻击肿瘤细胞的免疫应答。其为治疗各种类型癌症的有前途选项,因为它有可能逃避耐药性的遗传和细胞机制,并在保留正常组织的同时靶向肿瘤细胞。基于细胞的疗法可涉及反应性偏向癌细胞的细胞毒性T细胞。Eshhar等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.;1993;90(2):720-724;Geiger等人,JImmunol.1999;162(10):5931-5939;Brentjens等人,Nat.Med.2003;9(3):279-286;Cooper等人,Blood.2003;101(4):1637-1644;以及Imai等人,Leukemia.2004;18:676-684。一种方法是表达具有与一个或多个T细胞活化信号传导结构域融合的抗原结合结构域的嵌合受体。癌症抗原通过抗原结合结构域的结合导致T细胞活化并触发细胞毒性。通过输注表达嵌合受体的自体T淋巴细胞进行的临床试验的最新结果为其临床潜能提供了令人信服的证据。Pule等人,Nat.Med.2008;14(11):1264-1270;Porter等人,NEnglJMed;2011;25;365(8):725-733;Brentjens等人,Blood.2011;118(18):4817-4828;Till等人,Blood.2012;119(17):3940-3950;Kochenderfer等人,Blood.2012;119(12):2709-2720;以及Brentjens等人,SciTranslMed.2013;5(177):177ra138。另一种方法是在造血细胞(例如,造血干细胞、免疫细胞,诸如NK细胞或T细胞)中表达抗体偶联的T细胞受体(ACTR)蛋白,所述ACTR蛋白含有细胞外Fc结合结构域。当表达ACTR的造血细胞(例如,表达ACTR的T细胞,也称为“ACTRT细胞”)与抗癌抗体一起施用给受试者时,它们可以通过它们与抗体的Fc结构域的结合而增强对所述抗体靶向的癌细胞的毒性。Kudo等人,CancerResearch.(2014)74:93-103。基于细胞的免疫疗法,虽然有前途,但是面临着肿瘤微环境(TME)的特定特性引起的挑战,所述TME是通过恶性肿瘤细胞与非转化细胞之间的相互作用而创建的细胞环境。因此,根据TME开发改善基于细胞的免疫疗法的功效的策略非常重要。
技术实现思路
本公开基于调节造血细胞(诸如造血干细胞(HSC)或免疫细胞)中的细胞内乳酸浓度的策略的开发,所述造血细胞包括表达嵌合受体多肽(诸如抗体偶联的T细胞受体(ACTR)多肽或嵌合抗原受体(CAR)多肽)的细胞,本公开用于基于细胞的免疫疗法。细胞内乳酸浓度的调节可以通过在造血细胞(例如,HSC或免疫细胞(例如,T细胞或自然杀伤细胞))中表达(例如,过表达)一种或多种乳酸调节因子(诸如乳酸调节多肽,例如本文所述的乳酸调节多肽)来实现。例如在低葡萄糖环境、低氨基酸环境、低pH环境和/或低氧环境中(例如,在肿瘤微环境中),预期这种遗传工程化的造血细胞(例如,免疫细胞)相对于相同类型的天然造血细胞(例如,相同类型的免疫细胞)具有增强的代谢活性。此类遗传工程化的免疫细胞还可具有经调节的表观遗传状态(例如,乙酰化状态)和/或经调节的免疫抑制代谢产物(例如,犬尿氨酸)水平。因此,共表达一种或多种乳酸调节因子(例如,多肽)和嵌合受体多肽的造血细胞(诸如HSC或免疫细胞)将表现出优异的生物活性(例如,在肿瘤微环境下,诸如低葡萄糖、低氨基酸、低pH和/或低氧条件下,任选地在治疗性抗体的存在下),例如细胞增殖、活化(例如,增加的细胞因子产生,例如IL-2或IFNγ产生)、细胞毒性和/或体内抗肿瘤活性。因此,本文提供了具有相对于相同类型的野生型免疫细胞具有改变的细胞内乳酸浓度调控的能力的经修饰的(例如,经遗传修饰的)造血细胞(例如,造血干细胞,或免疫细胞(诸如T细胞或自然杀伤细胞))。在一些情况下,经修饰的免疫细胞可表达或过表达乳酸调节因子,例如乳酸调节多肽。乳酸调节多肽可以是参与乳酸合成的酶(例如,LDHA,其催化乳酸和丙酮酸相互转化)、乳酸转运蛋白(例如,MCT)或者抑制竞争乳酸合成底物的途径的多肽(例如,PDK1)。示例性的乳酸调节多肽包括但不限于L-乳酸脱氢酶A链(LDHA)、单羧酸转运蛋白1(MCT1)、单羧酸转运蛋白2(MCT2)、单羧酸转运蛋白4(MCT4)和丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)。经修饰的免疫细胞还可表达嵌合受体多肽,所述嵌合受体多肽可包含(a)细胞外靶结合结构域;(b)跨膜结构域;以及(c)细胞质信号传导结构域(例如,包含基于免疫受体酪氨酸的活化基序(ITAM)的细胞质结构域)。在一些实施方案中,嵌合受体多肽为抗体偶联的T细胞受体(ACTR),所述ACTR包含细胞外Fc结合结构域(a)。在其他实施方案中,嵌合受体为嵌合抗原受体(CAR),所述CAR包含细胞外抗原结合结构域(a)。在一些实例中,(c)位于嵌合受体多肽的C末端处。在一些情况下,嵌合多肽还可包含至少一个共刺激信号传导结构域。在其他情况下,嵌合受体多肽可不含共刺激信号传导结构域。本文所述的嵌合受体多肽(例如,ACTR多肽或CAR多肽)中的任一者还可包含铰链结构域,所述铰链结构域位于(a)的C末端处和(b)的N末端处。在其他实例中,嵌合受体多肽可不含任何铰链结构域。在其他实例中,嵌合受体多肽,例如ACTR多肽,可不含来自任何非CD16A受体的铰链结构域。可选地或另外,嵌合受体多肽在其N末端处还包含信号肽。在一些实施方案中,本文公开的嵌合受体多肽可为包含Fc结合结构域(a)的ACTR多肽。在一些实例中,(a)的Fc结合结构域可为Fc受体的细胞外配体结合结构域,例如Fc-γ受体、Fc-α受体或Fc-ε受体的细胞外配体结合结构域。在特定实例中,Fc结合结构域为CD16A(例如,F158CD16A或V158CD16A)、CD32A或CD64A的细胞外配体结合结构域。在其他实例中,(a)的Fc结合结构域可为结合免疫球蛋白的Fc部分的抗体片段。例如,抗体片段可为单链可变片段(ScFv)、单结构域抗体(例如,纳米抗体)。另外,(a)的Fc结合结构域可为结合免疫球蛋白的Fc部分或其Fc结合片段的天然存在的蛋白质。例如,Fc结合结构域可为蛋白A或蛋白G或它们的Fc结合片段。在另外的实例中,(a)的Fc结合结构域可为结合免疫球蛋白的Fc部分的合成多肽。实例包括但不限于Kunitz肽、SMIP、avimer、亲和体、DARPin或抗运载蛋白(anticalin)。在一些实施方案中,本文公开的嵌合受体多肽可为包含细胞外抗原结合结构域(a)的C本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种遗传工程化的造血细胞,所述遗传工程化的造血细胞与相同类型的天然造血细胞相比具有增强的细胞内乳酸浓度。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180907 US 62/728,306;20180907 US 62/728,3381.一种遗传工程化的造血细胞,所述遗传工程化的造血细胞与相同类型的天然造血细胞相比具有增强的细胞内乳酸浓度。


2.如权利要求1所述的遗传工程化的造血细胞,所述遗传工程化的造血细胞表达或过表达
(i)乳酸调节因子。


3.如权利要求2所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述乳酸调节因子为乳酸调节多肽。


4.如权利要求3所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述乳酸调节多肽是单羧酸转运蛋白(MCT)、参与乳酸合成的酶或抑制竞争乳酸合成底物的途径的多肽。


5.如权利要求4所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述MCT为MCT1、MCT2或MCT4。


6.如权利要求4所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述参与乳酸合成的酶是乳酸脱氢酶A(LDHA)。


7.如权利要求4所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述抑制竞争乳酸合成底物的途径的多肽是丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)。


8.如权利要求1-7中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,所述遗传工程化的造血细胞还表达:
(ii)嵌合受体多肽,其中所述嵌合受体多肽包含:
(a)细胞外靶结合结构域;
(b)跨膜结构域;以及
(c)细胞质信号传导结构域。


9.如权利要求8所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽为抗体偶联的T细胞受体(ACTR)多肽,在抗体偶联的T细胞受体中(a)为细胞外Fc结合结构域。


10.如权利要求8所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽为嵌合受体抗原(CAR)多肽,在所述嵌合受体抗原多肽中(a)为细胞外抗原结合结构域。


11.如权利要求8-10中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽还包含至少一个共刺激信号传导结构域。


12.如权利要求8-10中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽任选为ACTR多肽,不含共刺激信号传导结构域。


13.如权利要求8-12中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述细胞质信号传导结构域包含基于免疫受体酪氨酸的活化基序(ITAM)。


14.如权利要求8-13中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中(c)位于所述嵌合受体多肽的C末端处。


15.如权利要求8-14中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽还包含铰链结构域,所述铰链结构域位于(a)的C末端处和(b)的N末端处。


16.如权利要求8-15中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽在其N末端处还包含信号肽。


17.如权利要求8-16中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽为ACTR多肽,在所述ACTR多肽中所述细胞外靶结合结构域(a)为细胞外Fc结合结构域,并且其中所述Fc结合结构域选自由以下组成的组:
(A)Fc受体的细胞外配体结合结构域,
(B)结合免疫球蛋白的所述Fc部分的抗体片段,
(C)结合免疫球蛋白的所述Fc部分或其Fc结合片段的天然存在的蛋白质,以及
(D)结合免疫球蛋白的所述Fc部分的合成多肽。


18.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为(A),所述(A)为Fc-γ受体、Fc-α受体或Fc-ε受体的细胞外配体结合结构域。


19.如权利要求18所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为CD16A、CD32A或CD64A的细胞外配体结合结构域。


20.如权利要求18所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为F158CD16A或V158CD16A的细胞外配体结合结构域。


21.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为(B),所述(B)为单链可变片段(scFv)或单结构域抗体。


22.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为(C),所述(C)为蛋白A或蛋白G,或它们的Fc结合片段。


23.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述Fc结合结构域为(D),所述(D)为Kunitz肽、SMIP、avimer、亲和体、DARPin或抗运载蛋白。


24.如权利要求8-16中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽为CAR多肽,在所述CAR多肽中(a)的细胞外靶结合结构域为抗原结合结构域,并且其中所述抗原结合结构域为单链抗体片段,所述单链抗体片段与肿瘤抗原、病原性抗原或对自身抗原有特异性的免疫细胞结合。


25.如权利要求24所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述肿瘤抗原与血液肿瘤相关。


26.如权利要求25所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述肿瘤抗原选自由以下组成的组:CD19、CD20、CD22、κ链、CD30、CD123、CD33、LeY、CD138、CD5、BCMA、CD7、CD40和IL-1RAP。


27.如权利要求24所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述肿瘤抗原与实体瘤相关。


28.如权利要求27所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述肿瘤抗原选自由以下组成的组:GD2、GPC3、FOLR、HER2、EphA2、EFGRVIII、IL13RA2、VEGFR2、ROR1、NKG2D、EpCAM、CEA、间皮素、MUC1、CLDN18.2、CD171、CD133、PSCA、cMET、EGFR、PSMA、FAP、CD70、MUC16、L1-CAM和CAIX。


29.如权利要求24所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述病原性抗原为细菌抗原、病毒抗原或真菌抗原。


30.如权利要求8-29中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中(b)的所述跨膜结构域属于单穿膜蛋白。


31.如权利要求30所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述跨膜结构域属于选自由以下组成的组的膜蛋白:CD8α、CD8β、4-1BB、CD28、CD34、CD4、FcεRIγ、CD16A、OX40、CD3ζ、CD3ε、CD3γ、CD3δ、TCRα、CD32、CD64、VEGFR2、FAS和FGFR2B。


32.如权利要求8-29中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中(b)的所述跨膜结构域为非天然存在的疏水性蛋白区段。


33.如权利要求8-11和13-32中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述至少一个共刺激信号传导结构域属于选自由以下组成的组的共刺激分子:4-1BB、CD28、CD28LL→GG变体、OX40、ICOS、CD27、GITR、ICOS、HVEM、TIM1、LFA1和CD2。


34.如权利要求33所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述至少一个共刺激信号传导结构域为CD28共刺激信号传导结构域或4-1BB共刺激信号传导结构域。


35.如权利要求8-11和13-34中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽包含两个共刺激信号传导结构域。


36.如权利要求35所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述两个共刺激结构域为:
(i)CD28和4-1BB;或者
(ii)CD28LLGG变体和4-1BB。


37.如权利要求35所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述共刺激信号传导结构域中的一个为CD28共刺激信号传导结构域;并且其中另一个共刺激结构域选自由以下组成的组:4-1BB共刺激信号传导结构域、OX40共刺激信号传导结构域、CD27共刺激信号传导结构域和ICOS共刺激信号传导结构域。


38.如权利要求8-37中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中(c)的所述细胞质信号传导结构域为CD3ζ或FcεR1γ的细胞质结构域。


39.如权利要求15-38中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述铰链结构域的长度为1至60个氨基酸。


40.如权利要求15-39中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述铰链结构域属于CD28、CD16A、CD8α或IgG。


41.如权利要求15-40中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述铰链结构域为非天然存在的肽。


42.如权利要求41所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述铰链结构域为延伸的重组多肽(XTEN)或(Gly4Ser)n多肽,其中n为3-12的整数,包括端值在内。


43.如权利要求8-14和16-38中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽任选为ACTR多肽,不含任何铰链结构域。


44.如权利要求8-42中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体任选为ACTR多肽,不含来自任何非CD16A受体的铰链结构域。


45.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述ACTR多肽包含(i)CD28共刺激结构域;以及(ii)CD28跨膜结构域、CD28铰链结构域或它们的组合。


46.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述ACTR多肽包含如表4所示的组分(a)-(e)。


47.如权利要求17所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述ACTR多肽包含选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:80的氨基酸序列。


48.如权利要求24所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述嵌合受体多肽为CAR多肽,所述CAR多肽包含(i)CD28共刺激结构域与CD28跨膜结构域、CD28铰链结构域或它们的组合的组合,或(ii)4-1BB共刺激结构域与CD8跨膜结构域、CD8铰链结构域或它们的组合的组合。


49.如权利要求24所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述CAR多肽包含SEQIDNO:97或SEQIDNO:98的氨基酸序列。


50.如权利要求1-49中任一项所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述造血为造血干细胞或免疫细胞,任选地其中所述免疫细胞是自然杀伤细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞或T细胞。


51.如权利要求50所述的遗传工程化的造血细胞,其中所述免疫细胞为T细胞,在所述T细胞中内源性T细胞受体、内源性主要组织相容性复合物、内源性β-2-微球蛋白或它们的组合的表达已被抑制或消减。


52.如权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员:K麦金尼斯S埃坦伯格L巴伦M弗雷C威尔逊G莫茨
申请(专利权)人:SOTIO有限责任公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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