一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法、装置和存储介质制造方法及图纸

技术编号:28458123 阅读:14 留言:0更新日期:2021-05-15 21:22
本申请公开了一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,包括:基因型区分步骤:根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;基因型解读步骤:对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;报告生成步骤:根据基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。本申请根据待测样本的PCR荧光信号得到个体化用药建议报告,能够为临床选择合适的药物种类及药物剂量提供遗传证据,大大缩短了从取样到出具基因检测报告的周期,进而缩短了医疗工作者的诊疗周期。疗工作者的诊疗周期。疗工作者的诊疗周期。

【技术实现步骤摘要】
一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法、装置和存储介质


[0001]本申请涉及基因检测领域,具体涉及一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法、装置和存储介质。

技术介绍

[0002]我国每年有约5000万的住院病人,其中至少250万与药物不良反应有关,目前药物无效率非常高,而导致药物不良反应和无效的主要因素是基因突变。药物基因组学已经引起全球高度重视,比如美国食品药品监督管理局(FDA)对氯吡格雷、可待因、丙戊酸等药物发布了药物相关基因检测警示,在使用前要进行基因检测;我国卫计委也发布了《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》。
[0003]然而,现有的普通基因检测手段从取样到出具检测报告至少需要几天甚至几周的时间,在等待的过程中,病患很可能就错过了最佳的治疗时间窗,或只能根据传统医疗经验先进行试药,未能在第一时间结合自身的遗传特质使用最合适的药物。
[0004]如何缩短药物代谢酶和药物作用靶点基因的检测周期,快速给出相应的用药指导是缩短药物诊疗周期的难点。

技术实现思路

[0005]本申请的目的是提供一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法、装置和存储介质,以快速给出相应的个体化用药指导建议。
[0006]为了实现上述目的,本申请采用了以下技术方案:
[0007]本申请的第一方面公开了一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,包括:
[0008]基因型区分步骤:根据待测样本中靶点基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;
[0009]基因型解读步骤:对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;
[0010]报告生成步骤:根据SNP基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。
[0011]需要说明的是,根据待测样本的PCR荧光信号对检测位点的基因型进行区分,并对基因型结果进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议,并根据解读结果自动生成报告,为临床选择合适的药物种类及药物剂量提供遗传证据,大大缩短了从取样到出具基因检测报告的周期,进而缩短了医疗工作者的诊疗周期。
[0012]本申请的一种实现方式中,基因型获取步骤中,获取不同位点对应的PCR荧光信号,根据PCR荧光信号的类型确定位点的碱基类型,其中,PCR荧光信号和碱基类型为一一对应的关系;
[0013]根据每个位点的碱基类型确定每个位点的SNP基因型。
[0014]本申请的一种实现方式中,基因型区分步骤之前还包括样本检测步骤,样本检测步骤包括:
[0015]获取待测样本DNA,确定待测样本DNA的检测项目和检测位点;
[0016]采用检测项目和检测位点对应的qPCR引物和荧光探针对待测样本DNA的靶标基因进行qPCR扩增;
[0017]采集靶标基因扩增过程中产生的PCR荧光信号。
[0018]本申请的一种实现方式中,检测项目包括叶酸、高血脂用药、抗心绞痛药物、氯吡格雷、华法林中的至少一种。
[0019]本申请的一种实现方式中,PCR荧光信号包括FAM荧光信号和VIC荧光信号。
[0020]本申请的第三方面还公开了一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,基因型区分模块:根据待测样本中靶点基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;
[0021]基因型解读模块:对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;
[0022]报告生成模块:根据基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。
[0023]本申请的一种实现方式中,基因型区分模块中,根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型具体包括:
[0024]获取不同位点对应的PCR荧光信号,根据PCR荧光信号的类型确定位点的碱基类型,其中,PCR荧光信号和碱基类型为一一对应的关系;
[0025]根据每个位点的碱基类型确定每个位点的SNP基因型。
[0026]本申请的一种实现方式中,装置还包括样本检测模块,样本检测模块用于:
[0027]获取待测样本DNA,确定待测样本DNA的检测项目和检测位点;
[0028]采用检测项目和检测位点对应的qPCR引物和荧光探针对待测样本DNA的靶标基因进行qPCR扩增;
[0029]采集靶标基因扩增过程中产生的PCR荧光信号;
[0030]优选地,检测项目包括叶酸、高血脂用药、抗心绞痛药物、氯吡格雷、华法林中的至少一种;
[0031]优选地,PCR荧光信号包括FAM荧光信号和VIC荧光信号。
[0032]本申请的第三方面还包括一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,装置包括存储器和处理器;
[0033]存储器,包括用于存储程序;
[0034]处理器,包括用于通过执行存储器存储的程序以实现上述药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法。
[0035]本申请的第四方面还公开了一种计算机可读存储介质,存储介质中存储有程序,程序能够被处理器执行以实现上述药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法。
[0036]由于采用以上技术方案,本申请的有益效果在于:
[0037]本申请根据待测样本的PCR荧光信号对检测位点的基因型进行区分,并对基因型结果进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以
及不同表型对应的用药建议,并根据解读结果自动生成报告,能够为临床选择合适的药物种类及药物剂量提供遗传证据,大大缩短了从取样到出具基因检测报告的周期,进而缩短了医疗工作者的诊疗周期;同时直接根据患者的遗传物质特性得到个体化用药建议,优化传统的用药治疗方法,从而能够辅助临床提高药物使用的安全性和有效性。
附图说明
[0038]图1为本申请实施例提供的一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法的流程框图;
[0039]图2为本申请实施例中提供的一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置的结构框图。
具体实施方式
[0040]下面通过具体实施方式对本申请作进一步详细说明。在以下的实施方式中,很多细节描述是为了使得本申请能被更好的理解。然而,本领域技术人员可以毫不费力的认识到,其中部分特征在不同情况下是可以省略的,或者可以由其他元件、材料、方法所替代。在某些情况下,本申请相关的一些操作并没有在说明书中显示或者描述,这是为了避免本申请的核心部分被过多的描述所淹没,而对于本领域技术人员而言,详细描述这些相关操作并不是必要的,他们根据说明书中的描述以及本领域的一般技术知本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,包括:基因型区分步骤:根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;基因型解读步骤:对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;报告生成步骤:根据SNP基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。2.根据权利要求1所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述基因型区分步骤中,根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型具体包括:获取不同位点对应的PCR荧光信号,根据PCR荧光信号的类型确定位点的碱基类型,其中,PCR荧光信号和碱基类型为一一对应的关系;根据每个位点的碱基类型确定每个位点的SNP基因型。3.根据权利要求2所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述基因型区分步骤之前还包括样本检测步骤,所述样本检测步骤包括:获取待测样本DNA,确定待测样本DNA的检测项目和检测位点;采用检测项目和检测位点对应的qPCR引物和荧光探针对待测样本DNA的靶标基因进行qPCR扩增;采集靶标基因扩增过程中产生的PCR荧光信号。4.根据权利要求3所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述检测项目包括叶酸、高血脂用药、抗心绞痛药物、氯吡格雷、华法林中的至少一种。5.根据权利要求3所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述PCR荧光信号包括FAM荧光信号和VIC荧光信号。6.一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,其特征在于,包括:基因型区分模块:用于根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;基因型解读模块:...

【专利技术属性】
技术研发人员:汤丽慧辜清泉郑晨晴吴莉萍杨旭
申请(专利权)人:深圳瑞奥康晨生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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