一种提高基因编辑技术安全性的方法及系统技术方案

技术编号:28323623 阅读:44 留言:0更新日期:2021-05-04 13:04
本发明专利技术公开了一种提高基因编辑技术安全性的方法和系统,所述方法包括:获得进行基因编辑的第一外源基因;获得所述第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息;根据所述第一外源基因获得易脱靶的第一基因区域;获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息;将所述第二细胞基因序列信息输入第一训练模型中,获得所述第一训练模型的第一输出信息,其中,所述第一输出信息标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;当所述第一输出信息满足所述预定条件时,获得基因编辑技术安全性的第一结果。解决了现有技术中基因编辑技术安全性低、脱靶率高,脱靶预测不够准确的技术问题。

【技术实现步骤摘要】
一种提高基因编辑技术安全性的方法及系统
本专利技术涉及基因编辑
,尤其涉及一种提高基因编辑技术安全性的方法和系统。
技术介绍
基因编辑(geneediting),又称基因组编辑(genomeediting)或基因组工程(genomeengineering),是一种新兴的比较精确的能对生物体基因组特定目标基因进行修饰的一种基因工程技术或过程。但脱靶效应依旧是影响基因编辑技术能否广泛应用的主要限制因素,如何正确评估、检测脱靶效应,并提出相应的策略降低脱靶效应,是当前基因编辑研究领域的重要研究方向。本申请专利技术人在实现本申请实施例中专利技术技术方案的过程中,发现上述技术至少存在如下技术问题:基因编辑技术安全性低、脱靶率高,脱靶预测不够准确。
技术实现思路
本申请实施例通过提供一种提高基因编辑技术安全性的方法和系统,解决了现有技术中基因编辑技术安全性低、脱靶率高,脱靶预测不够准确的技术问题,达到了基于训练模型进行基因组比对,从而提高脱靶检测的准确性,提高基因编辑技术安全性的技术目的。>本申请实施例通过提本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种提高基因编辑技术安全性的方法,其中,所述方法包括:/n获得进行基因编辑的第一外源基因;/n获得所述第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息;/n根据所述第一外源基因获得易脱靶的第一基因区域;/n根据所述第一细胞基因序列信息和所述第一基因区域获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息;/n将所述第二细胞基因序列信息输入第一训练模型中,所述第一训练模型通过多组训练数据训练获得,所述多组中的训练数据中的每一组训练数据均包括:第二细胞基因序列信息,以及标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;/n获得所述第一训练模型的第一输出信息,其中,所述第一输出信息标识所述第二细胞基因序列是否...

【技术特征摘要】
1.一种提高基因编辑技术安全性的方法,其中,所述方法包括:
获得进行基因编辑的第一外源基因;
获得所述第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息;
根据所述第一外源基因获得易脱靶的第一基因区域;
根据所述第一细胞基因序列信息和所述第一基因区域获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息;
将所述第二细胞基因序列信息输入第一训练模型中,所述第一训练模型通过多组训练数据训练获得,所述多组中的训练数据中的每一组训练数据均包括:第二细胞基因序列信息,以及标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;
获得所述第一训练模型的第一输出信息,其中,所述第一输出信息标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;
当所述第一输出信息满足所述预定条件时,获得基因编辑技术安全性的第一结果。


2.如权利要求1所述的方法,其中,当所述第一输出信息满足所述预定条件时,所述方法还包括:
根据所述第一外源基因获得不易脱靶的第二基因区域;
根据所述第一细胞基因序列信息和所述第二基因区域获得所述第二基因区域内的第三细胞基因序列信息;
将所述第三细胞基因序列信息输入第二训练模型中,所述第二训练模型通过多组训练数据训练获得,所述多组中的训练数据中的每一组训练数据均包括:第三细胞基因序列信息,以及标识所述第三细胞基因序列信息是否满足所述预定条件的结果信息;
获得所述第二训练模型的第二输出信息,其中,所述第二输出信息标识所述第三细胞基因序列是否满足所述预定条件的结果信息;
当所述第二输出信息表示满足所述预定条件时,获得基因编辑技术安全性的第二结果。


3.如权利要求1所述的方法,获得第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息后,所述方法还包括:
将所述第一细胞基因序列信息输入至第一预测模型;
获得第一潜在脱靶位点信息;
将所述第一潜在脱靶位点信息输入至第一比对模型。


4.如权利要求3所述的方法,其中,获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息之后,所述方法还包括:
将所述第二细胞基因序列信息输入至所述第一预测模型;
获得第二潜在脱靶位点信息;
将所述第二潜在脱靶位点信息输入至所述第一比对模型;
由所述第一比对模型输出第一比对结果;
依据所述第一比对结果,确定所述第一基因区域。


5.如权利要求1所述的方法,其中,所述方法包括:
获得基因编辑的第一外源基因之后,所述方法还包括:
获得所述第一外源基因...

【专利技术属性】
技术研发人员:李晓光
申请(专利权)人:无锡市第五人民医院
类型:发明
国别省市:江苏;32

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