基因分型方法、装置、电子设备及存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术实施例提供了一种基因分型方法、装置、电子设备及存储介质，其中，上述基因分型方法，包括：获取待分型序列、预设基因库中的基准参考序列以及第一差异结果集，预设基因库包括多个候选参考序列，第一差异结果集包括与多个候选参考序列分别对应的多个第一差异结果，第一差异结果用于表征对应的候选参考序列与基准参考序列之间的差异；获取待分型序列与基准参考序列之间的第二差异结果；从多个候选参考序列中确定出目标参考序列，目标参考序列为对应的第一差异结果与第二差异之间满足第一预设条件的候选参考序列；依据目标参考序列确定待分型序列的分型结果。本发明专利技术实施例能够有效降低数据的处理量，提高比对与基因分型效率。

【技术实现步骤摘要】
基因分型方法、装置、电子设备及存储介质
本专利技术涉及基因检测
，尤其涉及一种基因分型方法、装置、电子设备及存储介质。
技术介绍
众所周知，在国际免疫遗传学信息系统(internationalImmunogeneticsinformationsystem，IMGT)等基因库存在大量的基因序列，例如人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen，HLA)基因序列等；而通过将基因测序的序列与基因库中的基因序列进行比对，可以得到基因测序的序列的分型结果。现有技术中，通常是将基因测序的序列与基因库中的基因序列逐一比对，由于基因库中的基因序列的数量较多，导致对基因测序的序列的分型效率较低。
技术实现思路
本专利技术实施例提供一种基因分型方法、装置、电子设备及存储介质，以解决现有技术中将基因测序的序列与基因库中的基因序列逐一比对，由于基因库中的基因序列的数量较多，导致对基因测序的序列的分型效率较低的问题。为了解决上述技术问题，本专利技术是这样实现的：第一方面，本专利技术实施例提供了一种基因分型方法，包括本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基因分型方法，其特征在于，包括：/n获取待分型序列、预设基因库中的基准参考序列以及第一差异结果集，所述预设基因库包括多个候选参考序列，所述第一差异结果集包括与所述多个候选参考序列分别对应的多个第一差异结果，所述第一差异结果用于表征对应的候选参考序列与所述基准参考序列之间的差异；/n获取所述待分型序列与所述基准参考序列之间的第二差异结果；/n从所述多个候选参考序列中确定出目标参考序列，所述目标参考序列为对应的所述第一差异结果与所述第二差异之间满足第一预设条件的候选参考序列；/n依据所述目标参考序列确定所述待分型序列的分型结果。/n

【技术特征摘要】
1.一种基因分型方法，其特征在于，包括：
获取待分型序列、预设基因库中的基准参考序列以及第一差异结果集，所述预设基因库包括多个候选参考序列，所述第一差异结果集包括与所述多个候选参考序列分别对应的多个第一差异结果，所述第一差异结果用于表征对应的候选参考序列与所述基准参考序列之间的差异；
获取所述待分型序列与所述基准参考序列之间的第二差异结果；
从所述多个候选参考序列中确定出目标参考序列，所述目标参考序列为对应的所述第一差异结果与所述第二差异之间满足第一预设条件的候选参考序列；
依据所述目标参考序列确定所述待分型序列的分型结果。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一差异结果包括对应的候选参考序列与所述基准参考序列之间的第一差异碱基数量，所述第二差异结果包括所述待分型序列与所述基准参考序列之间的第二差异碱基数量；
所述从所述多个候选参考序列中确定出目标参考序列，包括：
分别计算每一所述第一差异碱基数量与所述第二差异碱基数量之间的第一差值；
将位于目标数值范围内的第一差值对应的所述第一差异碱基数量所对应的所述候选参考序列确定为所述目标参考序列。


3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述目标参考序列的数量为多个；
所述依据所述目标参考序列确定所述待分型序列的分型结果，包括：
分别针对多个所述目标参考序列中的每两个目标参考序列进行组合，得到至少一个候选组合参考序列；
获取每一所述候选组合参考序列分别对应的第三差异结果，所述第一差异结果用于表征对应的候选组合参考序列与所述基准参考序列之间的差异；
从所述至少一个候选组合参考序列中确定出目标组合参考序列，所述目标组合参考序列为对应的所述第三差异结果与所述第二差异之间满足第二预设条件的候选组合参考序列；
依据所述目标组合参考序列确定所述待分型序列的分型结果。


4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述第一差异结果包括对应的候选参考序列与所述基准参考序列之间的第一差异碱基位置，所述第三差异结果包括第三差异碱基数量与第二差异碱基位置；
所述获取每一所述候选组合参考序列分别对应的第三差异结果，包括：
获取组合形成所述候选组合参考序列的两个目标参考序列分别对应的第一差异碱基位置；
依据所述两个目标参考序列分别对应的第一差异碱基位置，确定所述候选组合参考序列对应的第二差异碱基位置及第三差异碱基数量。


5.根据权利要求3所述的方法，...

【专利技术属性】
技术研发人员：欧阳冬生，李晓晖，李超鹏，谢秀芬，谭海灿，费云舟，
申请(专利权)人：长沙都正生物科技股份有限公司，长沙都正医学检验有限责任公司，
类型：发明
国别省市：湖南;43