与大口黑鲈食欲抑制相关的SNPs位点及应用制造技术

本发明专利技术提供一种大口黑鲈POMC中的SNPs位点及应用，属于水产育种和生物基因技术领域。本发明专利技术探讨了在禁食和复喂条件下大口黑鲈与POMC基因多态性有关的内分泌生理学。从具有SNP位点注解的转录组数据集中获得POMC的单基因序列，克隆POMC cDNA的全长，并分析该基因的结构和同源性。确定了大口黑鲈POMC中SNP的位点和基因型，并计算了以不同食物养殖的群体中不同基因型的频率分布。禁食和复喂后比较POMC基因型的表达模式。通过配方饲料替代饵料鱼来驯化大口黑鲈已经在水产养殖业中得到了很好的发展，这项研究将有利于大口黑鲈食性的分子标记辅助育种，用于获得具备快速生长、配方饲料高利用率和高驯化效率摄食性状的大口黑鲈群体。

【技术实现步骤摘要】
与大口黑鲈食欲抑制相关的SNPs位点及应用
本专利技术涉及水产育种和生物基因
，涉及一种与大口黑鲈食欲抑制相关的SNPs位点及应用。
技术介绍
大口黑鲈(Micropterussalmoides)于1980年代从北美引入中国大陆，如今已成为水产养殖中产量最高的物种之一，2019年其年产量为477,808吨(《中国渔业统计年鉴2020》)。野生的大口黑鲈大口黑鲈作为肉食性鱼，在自然环境中喜欢捕食小鱼、小龙虾、两栖动物和昆虫，而商业养殖的大口黑鲈则以冷冻或活的饵料鱼为食。饵料鱼造成了巨大的生产成本和对海洋资源的过度开发，同时，过量的饵料鱼会使水质急剧恶化。为了减轻鱼粉的负面影响，不可避免地，在大口黑鲈的生产中使用配方饲料作为替代品是一种趋势。大口黑鲈已经通过替代饲料驯化了十多年(Portz和Cyrino，2004；Ren等，2018；Tidwell等，2005)。经过选育的摄食配方饲料的大口黑鲈新品种或种群，目前已在中国20多个城市进行养殖(BaiandLi，2019；Maetal.，2019)。鱼类表现出不同的摄食或饮食习惯，表明在本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种大口黑鲈POMC中的SNPs位点，其特征在于，其位于阿黑皮素原基因序列的ORF区。/n

【技术特征摘要】
1.一种大口黑鲈POMC中的SNPs位点，其特征在于，其位于阿黑皮素原基因序列的ORF区。


2.根据权利要求1所述大口黑鲈POMC中的SNPs位点，其特征在于，所述阿黑皮素原(POMC)基因序列如SEQIDNO:1所示；所述大口黑鲈POMC基因的cDNA全长1828bp，包括96bp的5'非翻译区，1,075bp的3'UTR和657bp的ORF，预计可编码218个氨基酸的蛋白，由三个外显子组成。


3.根据权利要求1所述大口黑鲈POMC中的SNPs位点，其特征在于，所述SNPs位点为4个，分别位于LMBPOMC完整ORF的220bp(T220C)，327bp(G327A)，452bp(C452T)和504bp(T504C)处。


4.一种用于检测权利要求1～3任一项所述SNPs位点的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列为：
引物对1：
ACTH-F1ATGTGTCCTGTGTGGCTATTGG
ACTH-R1GCAGCGATTTTGTTTCTCAT。


5.一种利用权利要求4所述引物对筛选大口黑鲈中POMC基因的SNP位点进行筛选的方法，其特征在于，步骤如下：
PCR反应体积(20μL)包含10μL预混Taq，7μLRNase-Free的ddH2O，1μL正向引物(10μM)，1μL反向引物(10μM)和1μLcDNA模板(>200ng/μL)；
PCR循环条件为：95℃下预变性5分钟；95℃下变性30秒，60℃下退火40秒，并在72℃下延伸60秒，共34个循环；并在72℃下最终延伸10分钟。


6.权利要求1～3任一所述SNPs位点紧密连锁构成的POMC基因型，其特征在于，所述POMC基因型包括：纯合子220TT/327GG/452CC/504TT、220CC/327AA/452TT/504CC，和杂合子220CT/327AG/452CT/504CT...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡婕，孙承熙，叶星，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院珠江水产研究所，
类型：发明
国别省市：广东;44