【技术实现步骤摘要】
一种用于预测胰腺癌转移风险的基因表达分类器、体外诊断试剂盒
本专利技术涉及生物医学检测
,特别是涉及一种用于预测胰腺癌转移风险的基因表达分类器、体外诊断试剂盒。
技术介绍
胰腺癌是一种恶性程度很高,极易转移的消化道恶性肿瘤,90%起源于腺管上皮的导管腺癌。其发病率和死亡率近年来明显上升,是预后最差的恶性肿瘤之一。胰腺癌早期的确诊率不高,手术死亡率较高,治愈率很低。胰腺癌极具侵袭性且被确诊时已存在高转移风险,因此,研究胰腺癌转移发生、发展及其机制就有重要的价值。胰腺癌恶性生物学行为的一个重要特点就是具有明显的侵袭和转移性,在胰腺癌早期就可以发生胰外播散,浸润至局部淋巴结、肠系膜血管、门静脉、胰周脏器和脂肪组织以及腹膜后神经丛等,或通过血行性转移至肺、肝等远处器官,导致3/4以上的胰腺癌患者就诊时丧失了根治性手术治疗的机会,使胰腺癌有较高的死亡率,5年生存率低于5%。现如今,癌症已经成为人类生命安全的最大威胁因素,造成了全球每年大概有700多万人因恶性肿瘤而死亡的局面。其中,胰腺恶性肿瘤是当今最难诊断,最难治疗的恶 ...
【技术保护点】
1.一种用于预测胰腺癌转移风险的基因表达分类器,其特征在于,为5-基因表达分类器,5个基因分别为HMGA2、PPL、DTX4、CDH3和ST6GALNAC2。/n
【技术特征摘要】
1.一种用于预测胰腺癌转移风险的基因表达分类器,其特征在于,为5-基因表达分类器,5个基因分别为HMGA2、PPL、DTX4、CDH3和ST6GALNAC2。
2.根据权利要求1所述的基因表达分类器,其特征在于,HMGA2、PPL、DTX4、CDH3和ST6GALNAC2的权重系数分别为:0.2056、0.1985、0.1366、0.1209和0.0688。
3.根据权利要求2所述的基因表达分类器,其特征在于,
其中Coefi是基因表达分类器中各基因的权重系数,xi是基因表达分类器中各基因的表达量,n是基因表达分类器中基因的数量;
风险评分越高,则胰腺癌转移风险越高。
4.一种基因表达分类器的构建方法,所述基因表达分类器用于预测胰腺癌转移风险,其特征在于,所述构建方法包括
(1)使用TCGA数据库中胰腺腺癌患者的基因表达信息和临床信息,以及GEO数据库中关于转移的胰腺癌细胞株的数据集,采用有监督的机器学习方法来筛选与转移风险高度相关的基因;
(2)筛选R0切除后发生转移和未发生转移的患者作为转移组和非转移组,获得训练集;
(3)在训练集中,数据输入中胰腺癌转移组赋值1,胰腺癌非转移组赋值0,根据风险评分公式如下:
其中Coefi是基因表达分类器中各基因的权重系数,xi是基因表达分类器中各基因的表达量,n是基...
【专利技术属性】
技术研发人员:郑慧琳,薛珂,张蕾,万健,范容丽,王麦秋,
申请(专利权)人:浙江科技学院,
类型:发明
国别省市:浙江;33
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。