一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分子诊断技术领域，具体是一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用，所述组合物由PTMAP4、H3F3AP6、RPL22L1、RP11‑267J23.4、MSH4、LYG1、RP11‑372B4.3、TLE6、RP11‑819M15.2、CIRBP‑AS1、FAM151B、EIF5A、SUMO2P17、FECH、MNX1‑AS1组成。本发明专利技术通过运用GSVA算法进行差异分析，获取得到各肿瘤相应的截断值，可用于多种肿瘤的微卫星不稳定性(MSI)状态的检测。通过实验验证，发现该方法具有准确性高、特异性好的优点，有很好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用
本专利技术涉及分子诊断
，具体地说，是一种检测肿瘤微卫星不稳定性状态的组合物及其应用。
技术介绍
微卫星不稳定(MSI)，是指由于在DNA复制时插入或缺失突变引起的MS序列长度改变的现象，常由错配修复(MMR)功能缺陷引起。MSI现象于1993年被Jacobs等人在结直肠癌中首次发现，与癌症发生有关，可用于癌症检测。据文献报道，大约15％的结直肠癌中存在MSI-H现象，与MSS特征的结直肠癌相比，其发病机制、预后和对药物的敏感性均不同。在非结直肠癌的实体瘤中，也存在着不同比例的MSI-H现象，MSI状态不同的实体瘤在对Keytruda响应率方面存在显著性差异。因此，准确的区分肿瘤患者的MSI状态，对于提高患者的治疗效果、减轻社会的负担有着极为重要的意义。目前多重荧光PCR-毛细管电泳法检测MSI状态是国际公认的金标准，提取同一患者的正常组织和肿瘤组织样本DNA，采用多重荧光PCR的方法对检测位点进行扩增，再通过毛细管电泳对扩增产物进行检测，并利用专业软件对两种组织来源检测结果进行对比本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测试剂在制备评估肿瘤微卫星不稳定性状态的试剂盒中的应用，其特征在于，所述检测试剂由检测以下基因/lncRNA表达量的试剂组成：PTMAP4、H3F3AP6、RPL22L1、RP11-267J23.4、MSH4、LYG1、RP11-372B4.3、TLE6、RP11-819M15.2、CIRBP-AS1、FAM151B、EIF5A、SUMO2P17、FECH、MNX1-AS1；所述检测试剂作为试剂盒实现评估肿瘤微卫星不稳定性状态的唯一关键成分。/n

【技术特征摘要】
1.检测试剂在制备评估肿瘤微卫星不稳定性状态的试剂盒中的应用，其特征在于，所述检测试剂由检测以下基因/lncRNA表达量的试剂组成：PTMAP4、H3F3AP6、RPL22L1、RP11-267J23.4、MSH4、LYG1、RP11-372B4.3、TLE6、RP11-819M15.2、CIRBP-AS1、FAM151B、EIF5A、SUMO2P17、FECH、MNX1-AS1；所述检测试剂作为试剂盒实现评估肿瘤微卫星不稳定性状态的唯一关键成分。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书记载如下公式：
GSVA评分＝-2.093101+(0.012068×PTMAP4)-(0.008544×H3F3AP6)+(0.062508×RPL22L1)+(0.073353×RP11-267J23.4)+(0.111126×MSH4)+(0.019458×LYG1)+(0.119968×RP11-372B4.3)+(0.099555×TLE6)+(0.218096×RP11-819M15.2)+(0.15873×FAM151B)+(0.142415×EIF5A)+(0.151092×SUMO2P17)+(0.081567×FECH)+(0.046266×MNX1-AS1)。


3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述肿瘤对应疾病包括乳腺癌、结直肠腺癌、食管癌、直肠腺癌、胃腺癌、子宫内膜癌、肝细胞肝癌、肺腺癌、肺鳞癌、肾上腺皮质癌、膀胱尿路上皮癌、宫颈鳞癌和腺癌、弥漫性大B细胞淋巴癌、多行成性胶质细胞瘤、头颈鳞状细胞癌、肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、急性髓细胞样白血病、脑低级别胶质瘤、卵巢浆液性囊腺癌、子宫肉瘤、葡萄膜黑色素瘤、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、皮肤黑色素瘤、肉瘤、胸腺癌。


4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，各疾病肿瘤的截断值分别为：乳腺癌：0.494、食管癌:0.359、肝细胞肝癌:0.283、结肠腺癌:0.364、肺腺癌:0.494、肺鳞癌:0.926、直肠腺癌:0.431、胃腺癌:0.297、子宫内膜瘤:0.053、肾上腺皮质癌:0.154、膀胱尿路上皮癌:0.157、宫颈鳞癌和腺癌:0.434、弥漫性大B细胞淋巴瘤:0.484、多形成性胶质细胞瘤:0.365、头颈鳞状细胞癌:0.424、肾嫌色细胞癌:0.424、肾透明细胞癌:0.318、肾乳头状细胞癌:0.333、急性髓细胞样白血病:0.401、脑低级别胶质瘤:0.544、卵巢浆液性囊腺癌:0.369、子宫肉瘤:0.243、葡萄膜黑色素瘤:0.151、胰腺癌:0.594、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤:0.512、前列腺癌:0.522、皮肤黑色素瘤:0.392、肉瘤:0.243、胸腺癌:0.540。


5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，当检测样本GSVA评分高于该肿瘤的截断值时，代表检测样本为MSI-H状态；当检测样本GSVA评分低于该肿瘤的截断值时，代表检测样本为MSI-L状态。


6.根据权利要求5所述应用，其特征在于，所述检测样本为新鲜组织肿瘤样本。


7.权利要求1所述的试剂在制备评估疾病预后生存的试剂盒中的应用。


8....

【专利技术属性】
技术研发人员：郑元生，梁嘉琪，胡正阳，杜雅静，卞赟艺，毕国澍，詹成，王群，蒋伟，
申请(专利权)人：复旦大学附属中山医院，
类型：发明
国别省市：上海;31