检测TP63-NTRK2融合基因及其相对表达水平的引物、探针和方法技术

本发明专利技术公开了一种利用荧光定量PCR技术检测肿瘤患者体内TP63‑NTRK2融合基因及其相对NTRK2基因的表达水平的引物、探针和方法，可筛查肿瘤患者体内是否有TP63‑NTRK2融合基因，同时检测NTRK2基因的相对表达量，对于肿瘤患者及时调整治疗方案、指导拉罗替尼用药、评价治疗效果、预测预后和预防临床复发具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
检测TP63-NTRK2融合基因及其相对表达水平的引物、探针和方法
本专利技术属生物技术检测领域，特别涉及一种筛查融合基因的方法，采用探针实时荧光PCR技术检测肿瘤患者体内TP63-NTRK2融合基因及其相对NTRK2基因的表达水平。
技术介绍
恶性肿瘤是目前全球疾病死亡的首位原因，严重威胁人类的健康。NTRK融合是一种致癌驱动基因，TP63-NTRK2融合基因是由TP63基因第6外显子和NTRK2基因第12外显子之间的融合形成的，其融合产物为嵌合蛋白，发挥非配体依赖性组成型激活作用，引发永久性信号级联反应，驱动癌细胞的生长。NTRK基因融合类型在多种成人和儿童的实体瘤中被发现。据报道，在比较常见的恶性肿瘤如肺癌、结直肠癌中NTRK基因融合的频率远低于5％，而在罕见的肿瘤类型如先天性婴儿纤维肉瘤、先天性中胚层肾癌、分泌型乳腺癌、涎腺乳腺样分泌癌中基因融合频率较高。其他的实体瘤还包括脑部恶性肿瘤、胰腺癌、黑色素瘤、甲状腺癌、胃肠道间质瘤等，在所有实体瘤中NTRK2基因融合的频率低于1％。近年来，随着技术的发展，以肿瘤驱动基因为靶点本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测肿瘤患者体内TP63-NTRK2融合基因和其相对NTRK2基因的表达水平的引物和探针，其特征在于，所使用的扩增TP63-NTRK2融合基因和NTRK2基因的引物和探针分别为：/nTP63-E6-F：GACAGGAAGGCGGATGAAGA/nNTRK2-E12-R：AGTGGGCTGGCAGAGTCATC/nNTRK2-E12-P：FAM-TCATTGCTGATAACGGAGGCTGGG-TAMRA/nNTRK2-E11-F：TTTTGGTAATGCTGTTTCTGCTT。/n

【技术特征摘要】
1.检测肿瘤患者体内TP63-NTRK2融合基因和其相对NTRK2基因的表达水平的引物和探针，其特征在于，所使用的扩增TP63-NTRK2融合基因和NTRK2基因的引物和探针分别为：
TP63-E6-F：GACAGGAAGGCGGATGAAGA
NTRK2-E12-R：AGTGGGCTGGCAGAGTCATC
NTRK2-E12-P：FAM-TCATTGCTGATAACGGAGGCTGGG-TAMRA
NTRK2-E11-F：TTTTGGTAATGCTGTTTCTGCTT。


2.根据权利要求1所述的检测肿瘤患者体内TP63-NTRK2融合基因和其相对NTRK2基因的表达水平的引物和探针，其特征在于，还包括扩增Actin内参基因的引物和探针，分别为：
Actin-F：TGAGCGAGGCTACAGCTT
Actin-R：TCCTTGATGTCGCGCACGATTT
Actin-P：FAM-ACCACCACGGCCGAGCGG-TAMRA。


3.根据权利要求1所述的引物和探针，其特征在于，TP63-E6-F：NTRK2-E12-R：NTRK2-E12-P的摩尔比为2：2：1。


4.根据权利要求1所述的引物和探针，其特征在于，NTRK2-E11-F：NTRK2-E12-R：NTRK2-E12-P的摩尔比为2：2：1。


5.根据权利要求1所述的引物和探针，其特征在于，Actin-F：Actin-R：Actin-P的摩尔比为1：1：1。


6.检测肿瘤患者体内TP63-NTRK2融合基因和其相对NTRK2基因的表达水平的方法，包括以下步骤：
(1)抽提组织中的总RNA并逆转录...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈雪青，王淑一，
申请(专利权)人：福州艾迪康医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：福建;35