一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法技术

本发明专利技术属于微生物领域，本发明专利技术提供了一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法。本发明专利技术分别在堆肥的第一天、第二天，高温期的前一天和高温期的第一天对堆肥发酵的畜禽粪便进行取样，并利用高通量测序技术对样品测序，得到有效数据；基于有效数据进行数据分析，找到优势微生物。本发明专利技术利用高通量测序技术，通过对取样时间进行控制，在不同堆肥时期检测粪肥中细菌的16S rRNA和真菌的rDNA ITS，分析堆肥过程中细菌和真菌的多样性与丰度变化，探索堆肥过程中微生物群落组成变化规律，为筛选堆肥优势微生物、提高堆肥效果，并进一步提供发酵效果更好的发酵菌剂奠定基础。

【技术实现步骤摘要】
一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法
本专利技术属于微生物领域，尤其涉及一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法。
技术介绍
近年来，我国畜牧业正向着规模化、集约化、标准化和现代化方向发展，而集约化养殖过程中产生的大量粪尿正成为环境污染的源头和畜牧业可持续性发展的制约性因素。世界各国对于如何处理畜禽粪污提出了多种方案，我国也制定并出台了一系列标准和规范。对于畜禽粪便最常用的处理处置方式就是堆肥处理，它是实现畜禽粪便减量化、无害化、资源化的良好途径，它将畜禽粪便中不稳定的有机物转化为稳定的且具有农业肥效的经济产品，一举多得，但堆肥处理技术仍存在许多缺点，如生产周期长、堆肥腐熟化程度低、产品质量差等，其关键受制于堆肥微生物的种类及作用不清，堆肥时微生物的多样性变化不清，堆肥菌剂所用细菌、真菌搭配不合理。针对这一瓶颈问题，前人对堆肥过程中细菌和真菌种群的变化进行了研究，但受实验设备和技术的限制，大多采用实验室培养、分离、鉴定等方法，仅对粪肥中有限的细菌和真菌类别进行了分析。高通量测序是指分析特定环境中微生物群体基因组成及功能、微生物群本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法，其特征在于，包括如下步骤：/n(1)分别在堆肥的第一天、第二天，高温期的前一天和高温期的第一天对堆肥发酵的畜禽粪便进行取样，得到各组样品；/n(2)分别提取各组样品DNA进行PCR扩增，并对PCR扩增产物进行构建文库和测序，得到原始数据，对原始数据进行拼接、过滤，得到有效数据；/n(3)基于有效数据进行OTUs聚类和物种分类分析；/n(4)基于OTUs聚类和物种分类分析结果进行Alpha多样性指数分析、样品间菌群丰度差异分析，找出各组样品的优势微生物。/n

【技术特征摘要】
1.一种筛选畜禽粪便发酵过程中优势微生物的方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)分别在堆肥的第一天、第二天，高温期的前一天和高温期的第一天对堆肥发酵的畜禽粪便进行取样，得到各组样品；
(2)分别提取各组样品DNA进行PCR扩增，并对PCR扩增产物进行构建文库和测序，得到原始数据，对原始数据进行拼接、过滤，得到有效数据；
(3)基于有效数据进行OTUs聚类和物种分类分析；
(4)基于OTUs聚类和物种分类分析结果进行Alpha多样性指数分析、样品间菌群丰度差异分析，...

【专利技术属性】
技术研发人员：姜国均，刘明超，岳世林，
申请(专利权)人：河北农业大学，
类型：发明
国别省市：河北;13