一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法技术

本发明专利技术公开了一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，具体涉及生物医学领域，包括有效检测人食管鳞癌组织内具核梭杆菌，所述具核梭杆菌特异性基因nusG的引物序列特征为：根据具核梭杆菌的nusG基因mRNA序列Gene ID：45633894，基因组序列为NZ_LN831027.1。本发明专利技术通过qPCR检测肿瘤组织内的具核梭杆菌的DNA表达含量，利用预设的cutoff值判定阳性或阴性；其次通过全外显子测序技术检测肿瘤组织的肿瘤突变负荷，利用预设的cutoff值判定高TMB或者低TMB；当F.nucleatum结果为阳性并且高TMB，食管癌更易发生转移；结合两个检测结果建立的预测模型可能成为预测食管鳞癌转移的有力方法。食管鳞癌转移的有力方法。食管鳞癌转移的有力方法。

【技术实现步骤摘要】
一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法


[0001]本专利技术涉及生物医学
，更具体地说，本专利技术涉及一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法。

技术介绍

[0002]食管癌是世界上最主要的上消化道恶性肿瘤。食管癌早期发现较为困难，一经确诊往往为中晚期，并且存在侵袭性强和致死率高等特点，是一种进展迅速并且预后较差的疾病。目前手术仍是食管癌患者获得长期生存的主要手段，但即便是根治性切除，病理检查无淋巴结转移(pNO)的患者术后5年内仍有40％～50％出现转移复发，因此食管癌转移复发是影响患者长期生存的重要原因。现亟待探索更有效的预警食管癌转移复发的手段，从而最终提高食管癌患者总体生存的关键问题。
[0003]具核梭菌作为一种厌氧的革兰氏阴性菌，主要分布于人、动物肠道和口腔粘膜。具核梭菌在口腔中含量最丰富，近年来研究发现该菌与人类疾病的联系越来越多。许多研究表明，具核梭菌与肿瘤的发生相关密切，尤其与结肠癌的发生之间存在相关性。此外，有报告研究它与食管癌的不良预后呈正相关。临床研究提示，较高的具核梭菌含量与食管鳞癌的新辅助化本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于瘤内具核梭杆菌预测食管鳞癌转移的方法，其特征在于：包括有效检测人食管鳞癌组织内具核梭杆菌，所述具核梭杆菌特异性基因nusG的引物序列特征为：根据具核梭杆菌的nusG基因mRNA序列Gene ID：45633894，基因组序列为NZ_LN831027.1；nusG正义链引物：5
’-
TGGTGTCATTCTTCCAAAAATATCA-3
’
；nusG反义链引物：5
’-
AGATCAAGAAGGACAAGTTGCTGAA-3
’
；具体预测步骤如下：S1：根据该有效的nusG基因序列，通过qPCR技术检测并设定通过熔解曲线评价qPCR结果的可靠性，并取Ct值(达到设定阈值所经历的循环数)，从而检测肿瘤组织内具核梭杆菌的DNA表达；S2：利用全外显子测序...

【专利技术属性】
技术研发人员：石超，李臻，马杰，唐颢，郭永军，
申请(专利权)人：河南省肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：