【技术实现步骤摘要】
一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物
本专利技术属于生物工程
,具体涉及一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物。
技术介绍
转录组测序已成为转录组信息研究、发现新转录本、新的可变性剪切的重要手段,但总RNA中含有大量的核糖体RNA(rRNA),占总RNA量的80%-95%,不利于转录组序列的研究,由于rRNA存在所引起的诸多问题是对其他相关RNA分子分析的难题,若存在rRNA,在做转录组测序时,会产生大量冗余的数据,造成很大的浪费和成本的上升,如果能很好的去除样本中的rRNA将会极大地提高数据的有效利用率,全血RNA样本则更具有挑战性:由于球蛋白mRNA(GlobinmRNA)占总mRNA的76%以上,因此,如果不将球蛋白mRNA和/或核糖体RNA全部去除,会对低丰度转录本的分析造成严重的影响。使用poly(A)富集mRNA不仅需要大量的起始样本总RNA,还存在着不能捕获全部的RNA(如miRNA和lncRNA)、核糖体RNA残留度高、仅适用于高完整度RNA样本和真核生
【技术保护点】
1.一种去除人总RNA中rRNA和Globin mRNA的组合物,其特征在于:包括探针组合物一和探针组合物二;/n所述探针组合物一包括针对rRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合一的序列如SEQ ID NO.1-187所示;/n所述探针组合物二包括针对Globin mRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合二的序列如SEQ ID NO.188-220所示。/n
【技术特征摘要】
1.一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物,其特征在于:包括探针组合物一和探针组合物二;
所述探针组合物一包括针对rRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合一的序列如SEQIDNO.1-187所示;
所述探针组合物二包括针对GlobinmRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合二的序列如SEQIDNO.188-220所示。
2.根据权利要求1所述的一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物,其特征在于:所述rRNA分子包括5SrRNA、5.8SrRNA、12SrRNA、16SrRNA、18SrRNA和28SrRNA中的...
【专利技术属性】
技术研发人员:曾志鹏,唐春花,张鹏,邢宽,谢珍,何志健,何贵伦,安雪茹,
申请(专利权)人:南京实践医学检验有限公司,
类型:发明
国别省市:江苏;32
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