一种去除人总RNA中rRNA和Globin mRNA的组合物制造技术

技术编号:26753034 阅读:71 留言:0更新日期:2020-12-18 21:20
本发明专利技术公开了一种去除人总RNA中rRNA和Globin mRNA的组合物,包括探针组合物一和探针组合物二;探针组合物一包括针对rRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合一的序列如SEQ ID NO.1‑187所示;探针组合物二包括针对Globin mRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合二的序列如SEQ ID NO.188‑220所示。本发明专利技术的组合物中的rRNA和Globin mRNA的捕获探针特异性强,去除率达99%以上;无需使用生物素标记和链霉亲和素磁珠,节省了大量成本。

【技术实现步骤摘要】
一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物
本专利技术属于生物工程
,具体涉及一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物。
技术介绍
转录组测序已成为转录组信息研究、发现新转录本、新的可变性剪切的重要手段,但总RNA中含有大量的核糖体RNA(rRNA),占总RNA量的80%-95%,不利于转录组序列的研究,由于rRNA存在所引起的诸多问题是对其他相关RNA分子分析的难题,若存在rRNA,在做转录组测序时,会产生大量冗余的数据,造成很大的浪费和成本的上升,如果能很好的去除样本中的rRNA将会极大地提高数据的有效利用率,全血RNA样本则更具有挑战性:由于球蛋白mRNA(GlobinmRNA)占总mRNA的76%以上,因此,如果不将球蛋白mRNA和/或核糖体RNA全部去除,会对低丰度转录本的分析造成严重的影响。使用poly(A)富集mRNA不仅需要大量的起始样本总RNA,还存在着不能捕获全部的RNA(如miRNA和lncRNA)、核糖体RNA残留度高、仅适用于高完整度RNA样本和真核生物等多方面缺陷。...

【技术保护点】
1.一种去除人总RNA中rRNA和Globin mRNA的组合物,其特征在于:包括探针组合物一和探针组合物二;/n所述探针组合物一包括针对rRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合一的序列如SEQ ID NO.1-187所示;/n所述探针组合物二包括针对Globin mRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合二的序列如SEQ ID NO.188-220所示。/n

【技术特征摘要】
1.一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物,其特征在于:包括探针组合物一和探针组合物二;
所述探针组合物一包括针对rRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合一的序列如SEQIDNO.1-187所示;
所述探针组合物二包括针对GlobinmRNA分子全长序列设计合成的单链DNA探针中的一种或多种的组合,其中探针组合二的序列如SEQIDNO.188-220所示。


2.根据权利要求1所述的一种去除人总RNA中rRNA和GlobinmRNA的组合物,其特征在于:所述rRNA分子包括5SrRNA、5.8SrRNA、12SrRNA、16SrRNA、18SrRNA和28SrRNA中的...

【专利技术属性】
技术研发人员:曾志鹏唐春花张鹏邢宽谢珍何志健何贵伦安雪茹
申请(专利权)人:南京实践医学检验有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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