【技术实现步骤摘要】
药物副作用关系预测方法、系统、计算机设备和存储介质
本申请涉及生物医药
,特别是涉及一种药物副作用关系预测方法、系统、计算机设备和存储介质。
技术介绍
临床上药物的正确使用本质上是实现药物期望益处和药物潜在风险间的一个有效的平衡。药物潜在的风险主要是指药物引起的不良反应,或叫做副作用。世界卫生组织对药物副作用给出了明确的定义:药品在预防、诊断或调节生理功能的正常用法用量下,出现的有害的和意料之外的反应。药物副作用的评估在制药工业和公共卫生健康领域是一个特别值得关注的问题。在制药工业中,药物副作用是药物研发过程中最容易引起失败的重要因素之一,也是药物批准上市后又退出市场的主要原因。大部分研究中的先导化合物在临床试验中的失败要归因于这些分子的毒副作用。据统计,由于毒副作用研究失败的药物占所有研究药物的30%左右,并且最近几年有增长的趋势。药物副作用也是病人不连续服用一种药物或者换用其它同类型药物的最重要的因素。在医疗卫生行业,大约有200多万的病人每年由于严重的副作用而住院,其中约有10万左右的病人会在住院过程中病 ...
【技术保护点】
1.一种药物副作用关系预测方法,其特征在于,所述方法包括:/n获取待测关系对,所述待测关系对包含一待测药物和一目标副作用;/n基于所述待测药物和已知药物的药物信息、以及已知药物副作用关系,确定各种药物维度下所述待测关系对的第一关联得分;/n基于所述目标副作用和已知副作用的副作用信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种副作用维度下所述待测关系对的第二关联得分;/n基于所述待测药物、所述已知药物、所述目标副作用和所述已知副作用的网络连接信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种网络连接维度下所述待测关系对的第三关联得分;/n根据所述第一关联得分、所述第二关联得分以及所述第三关 ...
【技术特征摘要】
1.一种药物副作用关系预测方法,其特征在于,所述方法包括:
获取待测关系对,所述待测关系对包含一待测药物和一目标副作用;
基于所述待测药物和已知药物的药物信息、以及已知药物副作用关系,确定各种药物维度下所述待测关系对的第一关联得分;
基于所述目标副作用和已知副作用的副作用信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种副作用维度下所述待测关系对的第二关联得分;
基于所述待测药物、所述已知药物、所述目标副作用和所述已知副作用的网络连接信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种网络连接维度下所述待测关系对的第三关联得分;
根据所述第一关联得分、所述第二关联得分以及所述第三关联得分,预测所述待测药物与所述目标副作用是否具有潜在关联。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述待测药物和已知药物的药物信息、以及已知药物副作用关系,确定各种药物维度下所述待测关系对的第一关联得分,包括:
基于所述待测药物和已知药物的药物信息,从所述已知药物中确定各种药物维度下所述待测药物的相似药物;
基于所述已知药物副作用关系,从各种药物维度下所述待测药物的相似药物中,分别选取与所述目标副作用有关联的相似药物,作为各种药物维度下所述待测药物的关联药物;
根据所述待测药物与各种药物维度下的关联药物的相似性,确定各种药物维度下所述待测关系对的第一关联得分。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述目标副作用和已知副作用的副作用信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种副作用维度下所述待测关系对的第二关联得分,包括:
基于所述目标副作用和所述已知副作用的副作用信息,从所述已知副作用中确定各种副作用维度下所述目标副作用的相似副作用;
基于所述已知药物副作用关系,从各种副作用维度下所述目标副作用的相似副作用中,分别选取与所述待测药物有关联的相似副作用,作为各种副作用维度下所述目标副作用的关联副作用;
根据所述目标副作用与各种副作用维度下的关联副作用的相似性,确定各种副作用维度下所述待测关系对的第二关联得分。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述待测药物、所述已知药物、所述目标副作用和所述已知副作用的网络连接信息、以及所述已知药物副作用关系,确定各种网络连接维度下所述待测关系对的第三关联得分,包括:
基于所述待测药物、所述已知药物、所述目标副作用和所述已知副作用的网络连接信息,确定各种网络连接维度下所述待测药物的相似药物和所述目标副作用的相似副作用,以及所述待测药物与所述目标副作用的偏好连接信息;
基于所述已知药物副作用关系,从各种网络连接维度下所述待测药物的相似药物中,分别选取与所述目标副作用有关联的相似药物,作为各种网络连接维度下所述待测药物的关联药物,从各种网络连接维度下所述目标副作用的相似副作用中,分别选取与所述待测药物有关联的相似副作用,作为各种网络连接维度下所述目标副作用的关联副作用;
根据所述待测药物与各种网络连接维度下的关联药物的相似性、所述目标副作用与各种网络连接维度下的关联副作用的相似性、以及所述偏好连接信息,确定各种网络连接特征维度下所述待测关系对的第三关联得分。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,基于所述待测药物和已知药物的药物信息,从所述已知药物中确定各种药物维度下所述待测药物的相似药物,包括下述各项中的至少一项:
第一项:
基于所述待测药物与各已知药物的拓展连接性指纹的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为化学结构维度下所述待测药物的相似药物;所述药物信息包括所述拓展连接性指纹,所述药物维度包括所述化学结构维度;
第二项:
基于所述待测药物与各已知药物的ATC数据的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为ATC维度下所述待测药物的相似药物;所述药物信息包括所述ATC数据,所述药物维度包括所述ATC维度;
第三项:
基于所述待测药物与各已知药物的靶点序列的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为靶点序列维度下所述待测药物的相似药物;所述药物信息包括所述靶点序列,所述药物维度包括所述靶点序列维度;
第四项:
基于所述待测药物与各已知药物的靶点蛋白的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为靶点蛋白维度下所述待测药物的相似药物;所述药物信息包括所述靶点蛋白,所述药物维度包括所述靶点蛋白维度;
第五项:
基于所述待测药物与各已知药物的靶点基因本体信息的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为靶点基因本体维度下所述待测药物的相似药物;所述药物信息包括所述靶点基因本体信息,所述药物维度包括所述靶点基因本体维度;
第六项:
基于所述待测药物与各已知药物所治疗的疾病信息的相似性,选取相似性靠前的相应数量的已知药物,作为疾病维度下所述待测药物的相似药物;所述药...
【专利技术属性】
技术研发人员:曹东升,印明柱,陈翔,杨素青,
申请(专利权)人:中南大学,
类型:发明
国别省市:湖南;43
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