一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法技术

技术编号:26585864 阅读:51 留言:0更新日期:2020-12-04 21:05
一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,属于基因检测技术领域,其特征在于:所述的检测肿瘤组织的单个和多个CTNNB1基因突变;根据与癌发生相关的CTNNB1突变位点信息,自主设置筛选变异位点的方法步骤,并基于实时荧光定量PCR仪的ARMS‑PCR方法,设计专用引物和探针,经对具有不同CTNNB1基因突变的质粒DNA的单个检测或多个同时检测的实验验证而建立。该方法能在4小时内鉴定出肿瘤组织中是否含有CTNNB1基因突变,可准确高效地确定相应的肿瘤类器官培养条件,可操作性强,具有高准确性、高灵敏性的技术优势,检测结果稳定、效果明显,具有显著优势。

【技术实现步骤摘要】
一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法
本专利技术涉及一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,属于基因检测

技术介绍
中国作为一个癌症大国,癌症发病率居高不下,年新发病例约占全球总数的四分之一。国家癌症中心发布的最新一期全国癌症统计数据报告显示:2015年恶性肿瘤发病约392.9万人,发病率为285.83/10万,死亡约233.8万人,这意味着平均每天超过1万人被确诊为癌症,每分钟有7.5人被确诊为癌症。近十多年来,我国癌症发病、死亡数均持续上升,恶性肿瘤发病率每年约有3.9%的增幅,死亡率每年约有2.5%的增幅。目前,随着靶向药物研究的持续深入,多种靶向特定致癌基因的药物不断进入临床,给广大患者带来了福音。然而,由于癌症的本质是受多基因突变影响的疾病,患者肿瘤会随着疾病的进展而不断演化,导致形成患者间的肿瘤异质性和同一肿瘤内的异质性。癌症异质性给靶向精准治疗增加了不确定性,同时也是导致癌症药物治疗耐药性的重要原因之一。为此,拓展针对癌症异质性的精准医疗具有重要的现实意义本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,可检测肿瘤组织的单个CTNNB1基因突变和(或)同时检测肝癌组织的多个CTNNB1基因突变;CTNNB1基因是原癌基因,CTNNB1基因的基因突变和过表达与多种肿瘤发生相关;一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,根据与癌发生相关的CTNNB1突变位点信息,自主设置筛选变异位点的方法步骤,并基于实时荧光定量PCR仪的ARMS-PCR方法,设计专用的Mutation引物、ARMS-PCR扩增引物和探针,经对具有不同CTNNB1基因突变的质粒DNA的单个检测或多个同时检测的实验验证而建立;其特征在于...

【技术特征摘要】
1.一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,可检测肿瘤组织的单个CTNNB1基因突变和(或)同时检测肝癌组织的多个CTNNB1基因突变;CTNNB1基因是原癌基因,CTNNB1基因的基因突变和过表达与多种肿瘤发生相关;一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法,根据与癌发生相关的CTNNB1突变位点信息,自主设置筛选变异位点的方法步骤,并基于实时荧光定量PCR仪的ARMS-PCR方法,设计专用的Mutation引物、ARMS-PCR扩增引物和探针,经对具有不同CTNNB1基因突变的质粒DNA的单个检测或多个同时检测的实验验证而建立;其特征在于:所述的一种用于肿瘤类器官培养条件选择的CTNNB1基因突变的快速鉴定方法检测肿瘤组织的单个CTNNB1基因突变和同时检测肿瘤组织的多个CTNNB1基因突变的有效性验证包括如下实验步骤:
(1)筛选出肿瘤CTNNB1基因突变达到一定频率的功能性变异位点;
(2)设计步骤(1)的肝癌Wnt通路中CTNNB1基因突变达到一定频率的功能性变异位点的ARMS-PCR扩增引物和探针;
(3)选取能够包含步骤(1)中的CTNNB1基因功能性变异位点及其ARMS-PCR扩增引物的DNA片段,并设计PCR扩增引物;
(4)以正常人基因组DNA为模板,对步骤(3)中的PCR扩增引物进行PCR扩增;
(5)对步骤(4)中获得的DNA片段,设计TA克隆引物,进行TA克隆,并转化扩增;
(6)设计步骤(1)的肝癌Wnt通路中CTNNB1基因突变达到一定频率的功能性变异位点的Mutation引物;
(7)以步骤(5)中的质粒DNA为模板,对步骤(6)中的Mutation引物进行PCR扩增,并转化扩增;
(8)将步骤(7)中的质粒DNA设为阳性对照,以待测样本基因组DNA为模板,对步骤(2)中的ARMS-PCR扩增引物进行PCR扩增;
(9)检测结果使用实时荧光定量PCR仪软件分析并输出结果,通过观察软件输出的一种结果曲线图AmplificationCurves来判断样本是否发生突变;所述肿瘤CTNNB1基因中达到一定频率的功能性变异位点为:CTNNB1_p.D32N、CTNNB1_p.D32G、CTNNB1_p.S33P、CTNNB1_p.S33C、CTNNB1_p.S33F、CTNN...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘平果周正牛建军周礼媛王翠敏黄啸杨光张以平
申请(专利权)人:南昌五元生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:江西;36

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