针对癌症个体化疗法的制品和方法技术

技术编号:26535805 阅读:23 留言:0更新日期:2020-12-01 14:27
描述了用于提供用于治疗包括淋巴瘤的B细胞恶性肿瘤的个体化药物的方法。该方法利用嵌合抗原受体(CAR)技术。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】针对癌症个体化疗法的制品和方法相关申请本申请要求2017年10月4日提交的俄罗斯申请第2017134483号、2018年4月4日提交的俄罗斯申请第2018112009号和2018年10月1日提交的俄罗斯申请第2018134321号的优先权,这些申请的每一个的全部内容在此通过引用并入本文。专利技术背景淋巴瘤是免疫系统淋巴细胞中的一种癌症。通常,淋巴瘤表现为淋巴样细胞(lymphoidcell)的实体瘤。这些恶性细胞通常起源于淋巴结,表现为淋巴结肿大,即肿瘤。它也可以影响其他器官,在这种情况下,它被称为结外淋巴瘤。结外部位包括皮肤、脑、肠和骨骼。淋巴瘤与淋巴样白血病(lymphoidleukemias)密切相关,淋巴样白血病也起源于淋巴细胞,但通常仅涉及循环血液和骨髓,且通常不形成静态肿瘤(statictumor)(Parham,P.Theimmunesystem.NewYork:GarlandScience.第414页,2005)。治疗包括化学疗法,并且在一些情况下还包括放射疗法和/或骨髓移植,并且取决于疾病的组织学、类型和阶段可以是可治愈的。较晚期的淋巴瘤病例是耐药的,并且因此需要新的治疗方法。专利技术概述本公开内容提供了用于使用个体化药物治疗B细胞恶性肿瘤的方法。更具体地,该方法提供了从受试者的B细胞恶性肿瘤中分离B细胞受体,鉴定该B细胞受体的配体,并且然后用与治疗剂偶联的B细胞受体配体,例如其中B细胞受体配体包含抗原结合结构域的CART细胞治疗受试者。在一些实施方案中,本公开内容的方法使用基于自分泌的形式来鉴定对肿瘤特异性的B细胞受体配体。一旦B细胞受体配体被鉴定出,就可以用与治疗剂附接的配体治疗患者。从诊断到治疗的整个过程可以在短时间段内,例如在几周内完成。例如,可以通过使来自肿瘤的B细胞受体和嵌合抗原受体(CAR)在T细胞中共表达来鉴定B细胞受体配体,其中CAR的胞外结构域包含来自文库的肽。T细胞通过CAR的活化指示CAR的胞外结构域已经结合B细胞受体,并且来自肽文库中的肽是B细胞受体配体。可选地,本文预期的是使用噬菌体展示来鉴定B细胞受体配体。本公开内容还提供了治疗癌症的方法,所述方法通过施用表达CAR的T细胞以及疫苗来进行,其中该CAR包含以癌症特异性方式特异性结合癌症特异性抗原的抗原结合结构域,例如具有包含如本文描述的B细胞受体配体的抗原结合结构域的CAR,该疫苗包含表达相同癌症特异性抗原或其癌症特异性片段(例如,B细胞受体或其片段)的多肽或核酸。已经出人意料地发现,当对癌症抗原是特异性的CAR以及该相同抗原被施用至受试者时,两者对肿瘤体积的减少具有协同作用。在一个方面,本文提供了治疗受试者中的淋巴瘤的方法。该方法包括:鉴定在受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;使所述独特的B细胞受体在细胞中表达;使细胞与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触;检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及向受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的B细胞受体配体。在一些实施方案中,推定的独特的B细胞受体配体包括肽、环肽、类肽、环类肽、多糖、脂质或小分子。在一些实施方案中,独特的B细胞受体和推定的独特的B细胞受体配体在T细胞中共表达。在一些实施方案中,细胞包含含有推定的独特的B细胞受体配体的CAR。在一些实施方案中,通过噬菌体展示使独特的B细胞受体与来自的文库的推定的独特的B细胞受体配体接触。在一些实施方案中,文库包括与噬菌体连接的推定的B细胞受体配体的文库。在一些实施方案中,独特的B细胞受体被附接至固体支持物。在一些实施方案中,使独特的B细胞受体与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触包括用与噬菌体连接的推定的B细胞受体配体的文库淘选被附接至固体支持物的独特的B细胞受体一轮或更多轮。在一些实施方案中,每一轮淘选包括阴性选择。在一些实施方案中,所述检测方法包括鉴定T细胞的活化。在另一个方面,本文提供了治疗受试者中的淋巴瘤的方法。该方法包括:鉴定在受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;使独特的B细胞受体和来自文库的推定的独特的B细胞受体配体在细胞中共表达;检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及向受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的B细胞受体配体。在一些实施方案中,独特的B细胞受体和推定的独特的B细胞受体配体在T细胞中共表达。在一些实施方案中,T细胞包含含有推定的独特的B细胞受体配体的CAR。在一些实施方案中,所述检测方法包括鉴定T细胞的活化。在一些实施方案中,将B细胞受体或其片段与治疗剂伴随施用至受试者。在另一个方面,本文提供了鉴定B细胞受体配体的方法。该方法包括:向T细胞的群体提供编码嵌合抗原受体(CAR)的文库和B细胞受体的核酸分子,其中文库中的每一个CAR包含不同的推定的B细胞受体配体结构域;使B细胞受体和CAR的文库在T细胞中共表达;测量所述T细胞的活化,其中如果表达B细胞受体和CAR的T细胞被活化,则来自CAR的文库的CAR的推定的B细胞受体配体结构域包含所述B细胞受体的配体;以及从活化的T细胞中分离编码CAR的核酸分子;以及对来自活化的T细胞的编码CAR的核酸分子的推定的B细胞受体配体结构域进行测序;从而鉴定B细胞受体配体。在一些实施方案中,B细胞受体来自癌细胞。在一些实施方案中,癌细胞是淋巴瘤细胞。在一些实施方案中,淋巴瘤细胞从来自患者的肿瘤获得。在一些实施方案中,该方法还包括用B细胞受体配体治疗患有淋巴瘤的受试者,其中B细胞受体在来自受试者的肿瘤中表达;并且B细胞受体配体与治疗剂偶联。在一些实施方案中,将B细胞受体或其片段与治疗剂伴随施用至受试者。在另一个方面,本文提供了治疗淋巴瘤的方法。该方法包括:向受试者施用治疗有效剂量的与治疗剂偶联的B细胞受体配体,其中所述B细胞受体配体包含推定的B细胞受体配体结构域,并且其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的CAR在与淋巴瘤细胞的B细胞受体共表达时活化T细胞。在另一个方面,本文提供了治疗受试者中的淋巴瘤的方法。该方法包括:鉴定在受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;使独特的B细胞受体和来自CAR的文库的嵌合抗原受体(CAR)在T细胞中共表达,其中文库中的每一个CAR包含不同的推定的B细胞受体配体结构域;通过鉴定活化的T细胞来鉴定B细胞受体配体,其中如果表达B细胞受体和CAR的T细胞被活化,则来自CAR的文库的CAR的推定的B细胞受体配体结构域包含所述独特的B细胞受体的配体;以及向受试者施用治疗有效剂量的与治疗剂偶联的B细胞受体配体。在一些实施方案中,该方法还包括制备与治疗剂偶联的B细胞受体配体。在一些实施方案中,T细胞通过CAR的基于自分泌的活化而被活本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:/n鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;/n使所述独特的B细胞受体在细胞中表达;/n使所述细胞与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触;/n检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及/n向所述受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171004 RU 2017134483;20180404 RU 2018112009;20181.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:
鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;
使所述独特的B细胞受体在细胞中表达;
使所述细胞与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触;
检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及
向所述受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


2.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:
鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;
使独特的B细胞受体与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触;
检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及
向所述受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述推定的独特的B细胞受体配体包括肽、环肽、类肽、环类肽、多糖、脂质或小分子。


4.根据权利要求1所述的方法,其中所述独特的B细胞受体和所述推定的独特的B细胞受体配体在T细胞中共表达。


5.根据权利要求权利要求1-4中任一项所述的方法,其中所述细胞包含含有所述推定的独特的B细胞受体配体的CAR。


6.根据权利要求5所述的方法,其中所述检测方法包括鉴定所述T细胞的活化。


7.根据权利要求6所述的方法,其中鉴定所述T细胞的活化包括测量CD69或CD25的表达。


8.根据权利要求2或3所述的方法,其中通过噬菌体展示使所述独特的B细胞受体与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触。


9.根据权利要求8所述的方法,其中所述文库包括与噬菌体连接的推定的B细胞受体配体的文库。


10.根据权利要求8或9所述的方法,其中所述独特的B细胞受体被附接至固体支持物。


11.根据权利要求10所述的方法,其中使独特的B细胞受体与来自文库的推定的独特的B细胞受体配体接触包括用与噬菌体连接的推定的B细胞受体配体的文库淘选被附接至固体支持物的独特的B细胞受体一轮或更多轮。


12.根据权利要求11所述的方法,其中每一轮淘选包括阴性选择。


13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法,其中所述受试者被确定为患有淋巴瘤。


14.根据权利要求13所述的方法,其中所述受试者被确定为具有与淋巴瘤相关的一个或更多个单核苷酸多态性(SNP)。


15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括:
从活检物获得细胞;
从所述细胞提取RNA;
由所提取的RNA合成cDNA;以及
对所述cDNA进行测序。


16.根据权利要求1-14中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括对循环无细胞DNA进行克隆和测序。


17.根据权利要求1-16中任一项所述的方法,其中所述方法在3周或更少时间内进行。


18.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括放射性同位素。


19.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中偶联有治疗剂的B细胞受体配体包括治疗性CAR。


20.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括化学疗法。


21.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括免疫疗法。


22.根据权利要求1-21中任一项所述的方法,其中将所述B细胞受体或其片段与所述治疗剂伴随施用至所述受试者。


23.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:
鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;
使所述独特的B细胞受体和来自文库的推定的独特的B细胞受体配体在细胞中共表达;
检测所述独特的B细胞受体与推定的独特的B细胞受体配体的结合,从而鉴定独特的B细胞受体配体;以及
向所述受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


24.根据权利要求23所述的方法,其中所述独特的B细胞受体和所述推定的独特的B细胞受体配体在T细胞中共表达。


25.根据权利要求24所述的方法,其中所述T细胞包含含有所述推定的独特的B细胞受体配体的CAR。


26.根据权利要求25所述的方法,其中所述检测方法包括鉴定所述T细胞的活化。


27.根据权利要求26所述的方法,其中鉴定所述T细胞的活化包括测量CD69或CD25的表达。


28.根据权利要求23-27中任一项所述的方法,其中所述受试者被确定为患有淋巴瘤。


29.根据权利要求28所述的方法,其中所述受试者被确定为具有与淋巴瘤相关的一个或更多个单核苷酸多态性(SNP)。


30.根据权利要求23-29中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括:
从活检物获得细胞;
从所述细胞提取RNA;
由所提取的RNA合成cDNA;以及
对所述cDNA进行测序。


31.根据权利要求23-29中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括对循环无细胞DNA进行克隆和测序。


32.根据权利要求23-31中任一项所述的方法,其中所述方法在3周或更少时间内进行。


33.根据权利要求23-32中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括放射性同位素。


34.根据权利要求23-32中任一项所述的方法,其中偶联有治疗剂的B细胞受体配体包括治疗性CAR。


35.根据权利要求23-32中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括化学疗法。


36.根据权利要求23-32中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括免疫疗法。


37.根据权利要求23-36中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽。


38.根据权利要求37所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域还包含Fc区。


39.根据权利要求23-38中任一项所述的方法,其中将所述B细胞受体或其片段与所述治疗剂伴随施用至所述受试者。


40.一种鉴定B细胞受体配体的方法,所述方法包括:
向T细胞的群体提供编码嵌合抗原受体(CAR)的文库和B细胞受体的核酸分子,其中所述文库中的每一个CAR包含不同的推定的B细胞受体配体结构域;
使所述B细胞受体和所述CAR的文库在T细胞中共表达;
测量所述T细胞的活化,其中如果表达所述B细胞受体和所述CAR的T细胞被活化,则来自所述CAR的文库的CAR的推定的B细胞受体配体结构域包含所述B细胞受体的配体;以及
从活化的T细胞中分离编码所述CAR的核酸分子;以及
对来自所述活化的T细胞的编码所述CAR的核酸分子的推定的B细胞受体配体结构域进行测序;
从而鉴定B细胞受体配体。


41.根据权利要求40所述的方法,其中所述B细胞受体来自癌细胞。


42.根据权利要求41所述的方法,其中所述癌细胞是淋巴瘤细胞,例如来自被确定为患有淋巴瘤的患者的淋巴瘤细胞。


43.根据权利要求42所述的方法,其中所述淋巴瘤细胞从来自患者的肿瘤获得。


44.根据权利要求43所述的方法,其中所述患者被确定为具有与淋巴瘤相关的一个或更多个单核苷酸多态性(SNP)。


45.根据权利要求40-44中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含30个氨基酸或更少氨基酸的多肽。


46.根据权利要求40-45中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽。


47.根据权利要求46所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域还包含Fc区。


48.根据权利要求40-47中任一项所述的方法,其中所述CAR包含跨膜结构域。


49.根据权利要求48所述的方法,其中所述跨膜结构域包括T细胞受体的α链、β链或δ链、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137和/或CD154。


50.根据权利要求40-49中任一项所述的方法,其中所述CAR包含胞内区域。


51.根据权利要求50所述的方法,其中所述胞内区域包括MHCI类分子、TNF受体蛋白、免疫球蛋白样蛋白、细胞因子受体、整联蛋白、信号传导淋巴细胞活化分子(SLAM蛋白)、活化NK细胞受体、BTLA、Toll配体受体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD25/CD18)、4-29B(CD137)、B7-H3、CDS、ICAM-1、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA4、VLA1、CD423、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD129、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244,304)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD123、与CD83特异性结合的配体和/或CD3δ。


52.根据权利要求40-51中任一项所述的方法,其中所述CAR包含铰链结构域。


53.根据权利要求40-52中任一项所述的方法,其中T细胞活化通过CD69或CD25的表达的增加来测量。


54.根据权利要求40-52中任一项所述的方法,其中T细胞活化通过在Jun、NF-κB和/或Rel的控制下的荧光蛋白报告物基因的表达的增加来测量。


55.根据权利要求40-54中任一项所述的方法,所述方法还包括用所述B细胞受体配体治疗患有淋巴瘤的受试者,其中:
所述B细胞受体在来自所述受试者的肿瘤中表达;以及
使所述B细胞受体配体与治疗剂偶联。


56.一种治疗淋巴瘤的方法,所述方法包括:
向受试者施用治疗有效剂量的与治疗剂偶联的B细胞受体配体,
其中所述B细胞受体配体包含推定的B细胞受体配体结构域,并且其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的CAR在与淋巴瘤细胞的B细胞受体共表达时活化T细胞。


57.根据权利要求56所述的方法,其中所述治疗剂包括放射性同位素。


58.根据权利要求56所述的方法,其中偶联有治疗剂的B细胞受体配体包括治疗性CAR。


59.根据权利要求56所述的方法,其中所述治疗剂包括化学疗法。


60.根据权利要求56所述的方法,其中所述治疗剂包括免疫疗法。


61.根据权利要求56-60中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含30个氨基酸或更少氨基酸的多肽。


62.根据权利要求56-61中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽。


63.根据权利要求62所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域还包含Fc区。


64.根据权利要求56-63中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含跨膜结构域。


65.根据权利要求64所述的方法,其中所述跨膜结构域包括T细胞受体的α链、β链或δ链、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137和/或CD154。


66.根据权利要求56-65中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含胞内区域。


67.根据权利要求66所述的方法,其中所述胞内区域包括MHCI类分子、TNF受体蛋白、免疫球蛋白样蛋白、细胞因子受体、整联蛋白、信号传导淋巴细胞活化分子(SLAM蛋白)、活化NK细胞受体、BTLA、Toll配体受体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD25/CD18)、4-29B(CD137)、B7-H3、CDS、ICAM-1、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA4、VLA1、CD423、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD129、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244,304)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD123、与CD83特异性结合的配体和/或CD3δ。


68.根据权利要求56-67中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含铰链结构域。


69.根据权利要求56-68中任一项所述的方法,其中T细胞活化通过CD69或CD25的表达的增加来测量。


70.根据权利要求56-69中任一项所述的方法,其中将所述B细胞受体或其片段与所述治疗剂伴随施用至所述受试者。


71.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:
鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;
使所述独特的B细胞受体和来自嵌合抗原受体(CAR)的文库的CAR在T细胞中共表达,其中所述文库中的每一个CAR包含不同的推定的B细胞受体配体结构域;
通过鉴定活化的T细胞来鉴定B细胞受体配体,其中如果表达所述B细胞受体和所述CAR的T细胞被活化,则来自所述CAR的文库的CAR的推定的B细胞受体配体结构域包含所述独特的B细胞受体的配体;以及
向所述受试者施用治疗有效剂量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


72.根据权利要求71所述的方法,其中所述受试者被确定为患有淋巴瘤。


73.根据权利要求72所述的方法,其中所述受试者被确定为具有与淋巴瘤相关的一个或更多个单核苷酸多态性(SNP)。


74.根据权利要求71-73中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括:
从活检物获得细胞;
从所述细胞提取RNA;
由所提取的RNA合成cDNA;以及
对所述cDNA进行测序。


75.根据权利要求71-73中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括对循环无细胞DNA进行克隆和测序。


76.根据权利要求71-75中任一项所述的方法,所述方法还包括制备与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


77.根据权利要求71-76中任一项所述的方法,其中所述方法在3周或更少时间内进行。


78.根据权利要求71-77中任一项所述的方法,其中所述T细胞通过所述CAR的基于自分泌的活化而被活化。


79.根据权利要求71-78中任一项所述的方法,其中鉴定B细胞受体配体还包括:
从活化的T细胞中分离编码所述CAR的核酸分子;以及
对来自所述活化的T细胞的编码所述CAR的核酸分子的推定的B细胞受体配体结构域进行测序。


80.根据权利要求71-79中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括放射性同位素。


81.根据权利要求71-79中任一项所述的方法,其中偶联有治疗剂的B细胞受体配体包括治疗性CAR。


82.根据权利要求71-79中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括化学疗法。


83.根据权利要求71-79中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括免疫疗法。


84.根据权利要求71-83中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含30个氨基酸或更少氨基酸的多肽。


85.根据权利要求71-83中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽。


86.根据权利要求85所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域还包含Fc区。


87.根据权利要求71-86中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含跨膜结构域。


88.根据权利要求87所述的方法,其中所述跨膜结构域包括T细胞受体的α链、β链或δ链、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137和/或CD154。


89.根据权利要求71-88中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含胞内区域。


90.根据权利要求89所述的方法,其中所述胞内区域包括MHCI类分子、TNF受体蛋白、免疫球蛋白样蛋白、细胞因子受体、整联蛋白、信号传导淋巴细胞活化分子(SLAM蛋白)、活化NK细胞受体、BTLA、Toll配体受体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD25/CD18)、4-29B(CD137)、B7-H3、CDS、ICAM-1、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA4、VLA1、CD423、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD129、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244,304)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD123和/或与CD83特异性结合的配体。


91.根据权利要求71-90中任一项所述的方法,其中含有所述推定的B细胞受体配体结构域的所述CAR或所述治疗性CAR包含铰链结构域。


92.根据权利要求71-90中任一项所述的方法,其中T细胞活化通过CD69或CD25的表达的增加来测量。


93.根据权利要求71-91中任一项所述的方法,其中将所述B细胞受体或其片段与所述治疗剂伴随施用至所述受试者。


94.一种治疗受试者中的淋巴瘤的方法,所述方法包括:
鉴定在所述受试者的淋巴瘤细胞中表达的独特的B细胞受体;
使所述独特的B细胞受体和来自文库的推定的独特的B细胞受体配体在细胞中共表达;
通过检测方法鉴定所述独特的B细胞受体配体,其中如果推定的独特的B细胞受体配体与所述独特的B细胞受体相互作用,则所述推定的独特的B细胞受体配体是独特的B细胞受体配体;以及
向所述受试者施用治疗有效量的与治疗剂偶联的所述B细胞受体配体。


95.根据权利要求94所述的方法,其中所述独特的B细胞受体和推定的独特的B细胞受体配体在T细胞中共表达。


96.根据权利要求94或95所述的方法,其中细胞包含含有所述推定的独特的B细胞受体配体的CAR。


97.根据权利要求96所述的方法,其中所述检测方法包括鉴定所述T细胞的活化。


98.根据权利要求97所述的方法,其中鉴定所述T细胞的活化包括测量CD69或CD25的表达。


99.根据权利要求94-98中任一项所述的方法,其中所述受试者被确定为患有淋巴瘤。


100.根据权利要求99所述的方法,其中所述受试者被确定为具有与淋巴瘤相关的一个或更多个单核苷酸多态性(SNP)。


101.根据权利要求94-100中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括:
从活检物获得细胞;
从所述细胞提取RNA;
由所提取的RNA合成cDNA;以及
对所述cDNA进行测序。


102.根据权利要求94-100中任一项所述的方法,其中鉴定独特的B细胞受体包括对循环无细胞DNA进行克隆和测序。


103.根据权利要求94-102中任一项所述的方法,其中所述方法在3周或更少时间内进行。


104.根据权利要求94-103中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括放射性同位素。


105.根据权利要求94-103中任一项所述的方法,其中偶联有治疗剂的B细胞受体配体包括治疗性CAR。


106.根据权利要求94-103中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括化学疗法。


107.根据权利要求94-103中任一项所述的方法,其中所述治疗剂包括免疫疗法。


108.根据权利要求94-107中任一项所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽。


109.根据权利要求108所述的方法,其中所述推定的B细胞受体配体结构域还包含Fc区。


110.根据权利要求94-109中任一项所述的方法,其中将所述B细胞受体或其片段与所述治疗剂伴随施用至所述受试者。


111.一种嵌合抗原受体(CAR),所述嵌合抗原受体(CAR)包含:
推定的B细胞受体配体结构域,所述推定的B细胞受体配体结构域包含来自环肽文库的多肽;
跨膜结构域;和
胞内区域。


112.根据权利要求111所述的CAR,其中所述CAR在与B细胞受体共表达时活化T细胞,其中所述B细胞受体的B细胞受体配体包含所述推定的B细胞受体配体结构域。


113.根据权利要求111或112所述的CAR,其中所述跨膜结构域包括T细胞受体的α链、β链或δ链、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137和/或CD154。


114.根据权利要求111-113中任一项所述的CAR,其中所述胞内区域包括MHCI类分子、TNF受体蛋白、免疫球蛋白样蛋白、细胞因子受体、整联蛋白、信号传导淋巴细胞活化分子(SLAM蛋白)、活化NK细胞受体、BTLA、Toll配体受体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD25/CD18)、4-29B(CD137)、B7-H3、CDS、ICAM-1、ICOS(CD278)、GITR、BA...

【专利技术属性】
技术研发人员:阿列克谢·维亚切斯拉夫维奇·斯特潘诺夫D·D·格恩金亚历山大·加比博维奇·加比博夫理查德·A·勒纳阿列克谢·阿纳托利耶维奇·别洛古罗夫谢佳
申请(专利权)人:赫斯佩瑞克斯股份公司斯克利普斯研究所
类型:发明
国别省市:瑞士;CH

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