肠道菌群在重症肌无力中的应用制造技术

本发明专利技术公开了肠道菌群在重症肌无力中的应用，所述肠道菌群选自Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified的一种或几种。本发明专利技术首次发现了Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified在重症肌无力患者中的丰度增加，通过检测Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified的丰度，可以诊断受试者是否患重症肌无力和/或患重症肌无力的风险，从而实现受试者的无创诊断。

【技术实现步骤摘要】
肠道菌群在重症肌无力中的应用
本专利技术属于生物
，涉及肠道菌群在重症肌无力中的应用。
技术介绍
微生物群对人类健康的影响越来越明显，它的失调导致了各种疾病，从肥胖、炎症性肠病到免疫性疾病(Tamburini,S.,etal.,Themicrobiomeinearlylife:implicationsforhealthoutcomes.[J]Naturemedicine,2016.22(7):p.713.)。胃肠道是一个复杂的生态系统，含有大量的常驻微生物，它们与宿主共生，影响人类的营养、新陈代谢和免疫功能(Macpherson,A.J.,etal.Ganal-Vonarburg,Hownutritionandthematernalmicrobiotashapetheneonatalimmunesystem.[J]NatureReviewsImmunology,2017.17(8):508.)。最近的研究已经报道了几种自身免疫性疾病，如类风湿性关节炎和多发性硬化症，都与肠道微生物群有关(Kishikawa,T,etal.,Metagenome-wideassociationstudyofgutmicrobiomerevealednovelaetiologyofrheumatoidarthritisintheJapanesepopulation.[J]Annalsoftherheumaticdiseases,2020.79(1):103-111.)。微生物组测序方法最初侧重于16S核糖体RNA(rRNA)基因的扩增序列测定。随着生物技术的发展，基于微生物组全基因组鸟枪式测序的宏基因组测序技术使全基因组测序成为常规，可以在细菌、古菌、真菌甚至病毒的物种水平上检测微生物组的基因组组成，并分析其生物功能特性(Ranjan,R.,etal.,Analysisofthemicrobiome:Advantagesofwholegenomeshotgunversus16Sampliconsequencing.[J]Biochemicalandbiophysicalresearchcommunications,2016.469(4):967-977)。重症肌无力(MG)是一种获得性免疫介导的神经肌肉接头疾病，导致波动的骨骼肌无力和疲劳(XuLori,CastroDiana,etal.Responsetotreatmentinpediatricocularmyastheniagravis.[J]MuscleNerve,2020,61:226-230)。在东亚MG病例中，儿童MG患者占一半。儿重症肌无力有两种类型：泛发性重症肌无力(GMG)和眼肌无力(OMG)。眼肌无力(OMG)是一种局限性的重症肌无力(MG)，只有眼外肌、提上睑肌和眼轮匝肌受累，会产生上睑下垂、复视和眼外活动受限等症状，进而导致斜视。长期不适当的治疗可能会导致严重的残疾和发病率，伴随持续的肢体无力和永久性眼球运动障碍和弱视风险的增加(PinelesSL,AveryRA,etal.Visualandsystemicoutcomesinpediatricocularmyastheniagravis.[J]AmJOphthalmol.2010；150(4):453-9e3.)重症肌无力的发病机制十分复杂，肠道菌群在其中起着重要作用。目前缺少关于重症肌无力患者的肠道菌群与重症肌无力的相关性报道，本申请的目的在于探讨重症肌无力患者中，肠道菌群与重症肌无力的关系，明确可以作为重症肌无力的生物标志物的肠道菌群。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于发现与重症肌无力发生发展相关的肠道菌群，通过检测肠道菌群的丰度或者相对丰度，可以判断受试者是否患重症肌无力和/或患重症肌无力的风险。本专利技术的第一方面提供了重症肌无力相关微生物标志物，所述微生物标志物选自Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified的一种或几种。本专利技术的第二方面提供了本专利技术第一方面所述的微生物标志物在制备诊断重症肌无力的产品中的应用。进一步，所述产品通过测定样本中的微生物标志物的丰度来确定受试者是否患有重症肌无力。进一步，所述产品包括检测微生物标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。进一步，所述重症肌无力为儿童重症肌无力。本专利技术的第三方面提供了一种利用本专利技术第一方面所述的微生物标志物预测重症肌无力的系统，其特征在于，包括：核酸样本分离单元，用于从检测对象中分离肠道菌群核酸样本；测序单元，用于对分离的肠道菌群核酸样本进行测序，以获得测序结果；数据处理单元，用于根据测序结果，对肠道菌群中的所述微生物标志物的相对丰度进行检测，将所得到的相对丰度值进行分析，得出上述微生物标志物的临界值；结果判定单元，用于将数据处理单元得到的微生物标志物的临界值与设定诊断值进行比较。本专利技术的第四方面提供了一种诊断重症肌无力的产品，所述产品包括检测本专利技术第一方面所述的微生物标志物丰度的试剂。进一步，所述试剂包括检测所述微生物标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。本专利技术的第五方面提供了本专利技术第一方面所述的微生物标志物在构建预测重症肌无力的计算模型中的应用。本专利技术的第六方面提供了本专利技术第一方面所述的微生物标志物在制备治疗重症肌无力的药物组合物中的应用。进一步，所述药物组合物包括降低所述微生物标志物丰度的试剂。进一步，所述药物组合物还包括药学上可接受的载体。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术首次发现了Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified与重症肌无力相关，其丰度在重症肌无力患者和健康人群中呈现显著性差异，ROC曲线分析其作为检测变量具有较高的准确性、特异性和敏感性，可以将Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified作为检测靶标应用于重症肌无力患者的诊断。附图说明图1是α多样性和β多样性分布的小提琴图；其中，A-C是基于shannon指数的α多样性在门(A)、属(B)和种(C)水平上的分布图；D-F是基于Bray-Curtis距离的β多样性在门(D)、属(E)和种(F)水平上的分布图。图2是所有参与者在不同分类水平的相对丰度的PcoA，其中图A-F分别是在门、纲、目、科、属、种分类水平的相对丰度的PcoA，红点和蓝色三角形分别代表MG和HC。图3是微生物标志物的丰度情况图，其中图A是Fusobacterium_mortiferum，图B是Megamonas_rupellensis，图C是Megamonas_unclassified。...

【技术保护点】
1.重症肌无力相关微生物标志物，其特征在于，所述微生物标志物选自Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified的一种或几种。/n

【技术特征摘要】
1.重症肌无力相关微生物标志物，其特征在于，所述微生物标志物选自Fusobacterium_mortiferum、Megamonas_rupellensis、Megamonas_unclassified的一种或几种。


2.权利要求1所述的微生物标志物在制备诊断重症肌无力的产品中的应用。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品通过测定样本中的微生物标志物的丰度来确定受试者是否患有重症肌无力。


4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述产品包括检测微生物标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。


5.根据权利要求2-4任一项所述的应用，其特征在于，所述重症肌无力为儿童重症肌无力。


6.一种利用权利要求1所述的微生物标志物预测重症肌无力的系统，其特征在于，包括：
核酸样本分...

【专利技术属性】
技术研发人员：乞国艳，
申请(专利权)人：石家庄市人民医院石家庄市第一医院，石家庄市肿瘤医院，河北省重症肌无力医院，石家庄市心血管病医院，
类型：发明
国别省市：河北;13