来自噬菌体尾长度带检测蛋白的免疫原性序列、表达所述序列的细菌及其治疗癌症的用途制造技术

本发明专利技术涉及抗癌治疗的益生微生物辅助的领域。具体地，本发明专利技术涉及来自在被鉴定为抗癌治疗的有效辅助剂的细菌中存在的原噬菌体的免疫原性序列。本发明专利技术提供了表达来自此原噬菌体的免疫原性序列的细菌组合物、包含此序列的免疫原性组合物以及使用来自此原噬菌体的序列的方法，它们用于增加整套的抗癌干预措施。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】来自噬菌体尾长度带检测蛋白的免疫原性序列、表达所述序列的细菌及其治疗癌症的用途
本专利技术涉及抗癌治疗的益生微生物辅助的领域。具体地，本专利技术涉及来自在被鉴定为抗癌治疗的有效辅助剂的细菌中存在的原噬菌体的免疫原性序列。本专利技术提供了表达来自此原噬菌体的免疫原性序列的细菌组合物以及使用此原噬菌体的序列的方法，它们用于增加整套的抗癌干预措施。
技术介绍
癌症发病率和进展起因于基因调控和环境之间的复杂相互作用(Hanahan和Weinberg,2011)。许多上皮和造血瘤变被认为处于强烈的免疫监视下，如大量研究所表明的那样，这些研究揭示了浸润肿瘤的免疫细胞的密度、组成和功能状态决定了患者的预后，以及对辅助化学疗法或新辅助化学疗法(IngoldHeppner等人,2016；Palucka和Coussens,2016)和免疫检查点阻断剂(Hodi等人,2010；Ribas,2015；Robert等人,2015)的治疗响应。免疫效应器对癌细胞的识别依赖于两个参数，即，抗原性(来源于产生突变蛋白的突变的肿瘤相关抗原的存在，或正常仅在胚胎发育中或在本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种细菌组合物，其包含至少一种天然存在的或改造的细菌菌株，所述细菌组合物与抗肿瘤药物联合用于治疗癌症，其中所述至少一种细菌菌株表达SEQ ID No:1的蛋白或其包含选自由下列各项组成的组的至少一个表位的至少9个氨基酸、优选至少20个氨基酸的片段：SEQ ID No:13、14、53-188和209，条件是所述至少一种细菌菌株与于2013年11月7日在CNCM保藏的编号为I-4815的海氏肠球菌(Enterococcus hirae)菌株13144不同。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171229 EP 17306980.81.一种细菌组合物，其包含至少一种天然存在的或改造的细菌菌株，所述细菌组合物与抗肿瘤药物联合用于治疗癌症，其中所述至少一种细菌菌株表达SEQIDNo:1的蛋白或其包含选自由下列各项组成的组的至少一个表位的至少9个氨基酸、优选至少20个氨基酸的片段：SEQIDNo:13、14、53-188和209，条件是所述至少一种细菌菌株与于2013年11月7日在CNCM保藏的编号为I-4815的海氏肠球菌(Enterococcushirae)菌株13144不同。


2.根据权利要求1所述的细菌组合物，其用于根据权利要求1所述的用途，其中所述至少一种细菌菌株包含编码与SEQIDNo:1的蛋白具有至少80％、优选至少90％和更优选至少95％同一性的蛋白的原噬菌体基因组。


3.根据权利要求1或权利要求2所述的细菌组合物，其用于根据权利要求1所述的用途，其中所述组合物包含至少一种携带与SEQIDNo:2的原噬菌体具有至少80％且优选至少95％同一性的原噬菌体基因组的菌株，使得由所述原噬菌体编码的噬菌体能够在体内感染所述组合物的其他菌株和/或有需要的受试者的肠道微生物群的共生细菌。


4.根据权利要求1-3中任一项所述的细菌组合物，其用于根据权利要求1所述的用途，其中所述组合物包含选自由下列各项组成的组的细菌：
(i)海氏肠球菌菌株CNCMI-4815,
(ii)于2017年8月31日在CNCM保藏的编号为I-5224的海氏肠球菌菌株IGR7，
(iii)于2017年11月27日在CNCM保藏的编号为I-5261的海氏肠球菌菌株IGR11，
(iv)表达与来自SEQIDNo:1的蛋白的至少20个、优选至少30个和更优选至少40个核苷酸的片段具有至少65％、优选至少80％和更优选至少95％同一性的蛋白的任何其他细菌菌株，和
(v)至少两种(i)至(iv)中所述的菌株的混合物，优选(i)和(ii)中所述的菌株的混合物。


5.根据权利要求1-4中任一项所述的细菌组合物，其用于根据权利要求1所述的用途，其中所述组合物进一步包含于2017年11月27日在CNCM保藏的编号为I-5260的海氏肠球菌菌株IGR4。


6.一种增加细菌菌株的免疫原性的方法，所述方法包括在体外向所述菌株中引入编码SEQIDNo:1的蛋白或其至少包含SEQIDNo:13和14的肽的片段的核苷酸序列，或编码包含选自由SEQIDNo:53-187组成的组的至少一个表位的至少9个、优选至少20个氨基酸的肽的序列，或编码包含SEQIDNo:209的至少一个表位的至少9个、优选至少20个氨基酸的肽的序列。


7.根据权利要求6所述的方法，所述方法包括在体外利用编码与SEQIDNo:1的蛋白具有至少80％、优选至少90％和更优选至少95％同一性的蛋白的噬菌体感染所述菌株的细菌。


8.根据权利要求7所述的方法，其中所述噬菌体具有包含SEQIDNO:2的核苷酸序列或与SEQIDNO:2的核苷酸序列具有至少90％或至少95％同一性的序列的基因组。


9.一种用于治疗癌症的细菌组合物，其包含通过根据权利要求6-8中任一项所述的方法获得的改造的细菌菌株。


10.根据权利要求9所述的细菌组合物，其用于根据权利要求9所述的用途，其中所述细菌菌株选自由大肠杆菌(Escherichiacoli)、鹑鸡肠球菌(Enterococcusgallinarum)、粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)和海氏肠球菌组成的组。


11.根据权利要求9或权利要求10所述的细菌组合物，其用于根据权利要求9所述的用途，所述细菌组合物用于治疗HLA-A*0201患者中的癌症。


12.一种用于治疗癌症的细菌组合物，其选自由包含海氏肠球菌CNCMI-4815的细菌组合物以及根据权利要求1-5和9-11所述的细菌组合物组成的组，其中所述细菌组合物与能够触发由存在于所述组合物的至少一些细菌中的原噬菌体所编码的噬菌体的裂解周期的抗肿瘤药物联合使用。


13.根据权利要求12所述的细菌组合物，其用于根据权利要求12所述的用途，其中所述细菌组合物与CDK4/6抑制剂联合使用。


14.根据权利要求12所述的细菌组合物，其用于根据权利要求12或13所述的用途，其中所述细菌组合物与免疫检查点阻断剂联合使用。


15.一种用作抗癌疫苗的免疫原性组合物，其包含多肽或编码所述多肽的多核苷酸，所述多肽包含来自SEQIDNo:1的蛋白的至少9个连续氨基酸的序列或SEQIDNo:209的序列。


16.根据权利要求15所述的免疫原性组合物，其用于根据权利要求15所述的用途，其中所述来自SEQIDNo:1的蛋白的至少9个连续氨基酸的序列选自由SEQIDNo:53-187...

【专利技术属性】
技术研发人员：L·齐特沃格尔，
申请(专利权)人：古斯达威罗斯研究所，
类型：发明
国别省市：法国;FR