一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法技术

技术编号:25547128 阅读:44 留言:0更新日期:2020-09-08 18:45
本发明专利技术公开了一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法,所述的方法包括引物设计,重组质粒构建,标准曲线制作,灵敏度检测,重复性检测以及样品检测。检测的具体步骤为:称取土样,提取土壤微生物的总DNA,用引物Sps‑1和Sps‑2对粉痂菌ITS区域进行PCR扩增,产物回收后连接到pMD18‑T载体上,转化大肠杆菌DH5,筛选阳性克隆,用碱裂解法提取质粒;根据A260值计算质粒浓度,取新实验样品,比对试验结果在直线方程中的值。本检测方法在普通PCR基础上加入了一个探针,加快了检测速度,还并提高了检测的灵敏度和准确度,解决了由于马铃薯马铃薯粉痂菌不能人工培养,难以检测的难题。

【技术实现步骤摘要】
一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法
本专利技术涉及动植物保护领域,特别涉及是一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法。
技术介绍
目前国内没有该技术在马铃薯粉痂菌检测中的应用研究,国外目前有研究使用TaqMan探针进行多重实时PCR检测薯块中粉痂菌,但在土壤检测中存在一定问题,探针特异性不准确。植物病害的有效防治措施取决于对病害和病原体的正确识别,但马铃薯粉痂菌因不能人工离体培养,对其薯块及土壤中病原菌的存在与含量均不能准确得知,造成病害防控难度增大;而且在症状上该病害容易与马铃薯疮痂病混淆,而两种病害的防控措施完全不同。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法,以解决上述
技术介绍
中提出的问题。为实现上述目的,本专利技术提供如下技术方案:一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法,包括如下步骤:(1)称取土样0.2g、直径约2mm的石英砂0.2g加入1.5mL的离心管中,混匀;(2)加入400μL4%脱脂牛奶悬浮液,500μLDNA提取缓冲液100m本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:/n(1)称取土样0.2g、直径约2mm的石英砂0.2g加入1.5mL的离心管中,混匀;/n(2)加入400μL4%脱脂牛奶悬浮液,500μLDNA提取缓冲液100mmoL/L Tris,pH8.0;100mmoL/LEDTA;250mmoL/L NaCl,100μL 10%SDS,75μL 5moL/LNaCl,65μL 10%CTAB,在旋涡振荡仪上振荡1min,加入100μLTris-饱和酚,旋涡振荡仪上振荡30s;/n(3)将离心管放置于65℃水浴锅中水浴45min,其间轻轻摇动离心管。取出离心管12000r/min...

【技术特征摘要】
1.一种实时检测土壤中马铃薯粉痂病菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)称取土样0.2g、直径约2mm的石英砂0.2g加入1.5mL的离心管中,混匀;
(2)加入400μL4%脱脂牛奶悬浮液,500μLDNA提取缓冲液100mmoL/LTris,pH8.0;100mmoL/LEDTA;250mmoL/LNaCl,100μL10%SDS,75μL5moL/LNaCl,65μL10%CTAB,在旋涡振荡仪上振荡1min,加入100μLTris-饱和酚,旋涡振荡仪上振荡30s;
(3)将离心管放置于65℃水浴锅中水浴45min,其间轻轻摇动离心管。取出离心管12000r/min室温离心10min,将上清转到一新的离心管中,加入等体积的水饱和酚,混匀10min,12000r/min离心10min;
(4)取上清加入0.6倍体积的冰异戊醇,-20℃沉淀1h或过夜;
(5)12000r/min离心10min,弃上清留沉淀,用75%乙醇洗沉淀2次,再用无水乙醇洗1次,风干后溶于20μLTE中,-20℃保存备用;
(6)以土壤总DNA为模板,用引物Sps-1和Sps-2对粉痂菌ITS区域进行PCR扩增,PCR产物经UNIQ-10柱式PCR纯化试剂盒回收后,连接到pMD18-T载体上,并转化大肠杆菌DH5α,涂布含Amp的平板,筛选阳性克隆,用碱裂解法...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘霞杨艳丽黄勋钱红洁张哲
申请(专利权)人:云南农业大学
类型:发明
国别省市:云南;53

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