一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物及鉴别方法和应用技术

Tan1共有4种等位基因型，即Tan1、tan1‑a、tan1‑b和tan1‑c。本发明专利技术公开了一种鉴别高粱单宁等位变异基因Tan1的方法，以引物Tan1‑BZF1和Tan1‑BZR1扩增高粱Tan1基因部分开放阅读框，PCR产物片段大小Tan1和tan1‑a为257bp，tan1‑b和tan1‑c产物大小分别为267bp和247bp；以Tan1‑BZF2和Tan1‑BZR2扩增高粱Tan1基因部分开放阅读框，tan1‑a与Tan1相比，开放阅读框580位G缺失，由于缺失产生EcoNΙ新的酶切位点，PCR片段经EcoNΙ酶切后产生344bp和454bp两条带，完成Tan1和tan1‑a的鉴别。本发明专利技术开发了高效的分子标记，为培育低单宁含量的食、饲专用型高粱材料提供更加完善、准确的检测手段。

【技术实现步骤摘要】
一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物及鉴别方法和应用
本专利技术涉及分子生物学领域，具体涉及一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物及鉴别方法和应用。
技术介绍
单宁，通常称为缩合单宁(condensedtannins,CT)或原花青素(proanthocyanidins,PAs)，广泛存在于植物界中，如苹果、蓝莓、草莓、葡萄、蔓越莓、桃子和李子等水果中以及高粱、龙爪稷、蚕豆和大麦等谷物籽粒中，但是主要谷类作物如水稻、小麦和玉米籽粒中并不存在单宁。单宁具有多种生物学功能，如抑菌抗病毒、抗过敏、抗氧化、消炎、抗肿瘤促进免疫、紫外线保护以及免受昆虫、鸟类对谷物籽粒的噬食。高粱是世界五大粮食作物之一，用途广泛，主要用于食用、饲料、酿造和生物乙醇等。单宁是高粱重要的性状之一，高粱单宁含量远高于其他水果及谷物籽粒。高粱籽粒中单宁含量的高低影响高粱籽粒的用途，酿酒籽粒高粱要求单宁含量较高，通常为1％-1.5％。而食用和饲用籽粒高粱通常单宁含量较低，通常小于0.5％。Tan1，是一个含有WD40结构域的转录因子，调本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物，其特征在于，所述分子标记的引物为Tan1-BZF1和Tan1-BZR1，以及扩增多态性序列酶切法鉴定的引物为Tan1-BZF2和Tan1-BZR2，所述引物Tan1-BZF1的序列为SEQ1，所述引物Tan1-BZR1的序列为SEQ2，所述引物Tan1-BZF2的序列为SEQ3，所述引物Tan1-BZR2的序列为SEQ4；/n其中，SEQ1：5’-CTCTGACCTCCGCTATATGG-3’，/nSEQ2：5’-CTGCGTCGTACACTAGCACA-3’；/nSEQ3：5’-TCTCCTTCGACCACCCCTA-3’，/nSEQ...

【技术特征摘要】
1.一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物，其特征在于，所述分子标记的引物为Tan1-BZF1和Tan1-BZR1，以及扩增多态性序列酶切法鉴定的引物为Tan1-BZF2和Tan1-BZR2，所述引物Tan1-BZF1的序列为SEQ1，所述引物Tan1-BZR1的序列为SEQ2，所述引物Tan1-BZF2的序列为SEQ3，所述引物Tan1-BZR2的序列为SEQ4；
其中，SEQ1：5’-CTCTGACCTCCGCTATATGG-3’，
SEQ2：5’-CTGCGTCGTACACTAGCACA-3’；
SEQ3：5’-TCTCCTTCGACCACCCCTA-3’，
SEQ4：5’-AAGGCGATGGCCATCCAGTC-3’。


2.根据权利要求1所述的一种鉴别高粱单宁Tan1等位变异基因的分子标记的引物，其特征在于，所述引物采用以下方法设计：以引物Tan1-F和Tan1-R扩增高粱Tan1基因全长开放阅读框，其中tan1-a与Tan1相比较发生了2处突变，580位G碱基缺失以及798位G突变为T，导致193aa-298aa蛋白序列发生变化以及提前终止，tan1-b与Tan1序列比较只发生在925-926位10bp插入，导致309aa-318aa蛋白序列发生改变...

【专利技术属性】
技术研发人员：张丽霞，陆晓春，丛玲，王春语，王平，朱振兴，李丹，李金红，白春明，
申请(专利权)人：辽宁省农业科学院，
类型：发明
国别省市：辽宁;21