通用封闭序列及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种通用封闭序列及其应用。该通用封闭序列按照从5’到3’的方向包括依次连接的左侧非标签区封闭序列、中间标签区封闭序列及右侧非标签区封闭序列，左侧非标签区封闭序列包括5～7个LAN或BNA修饰的碱基，中间标签区封闭序列为通用封闭碱基序列，右侧非标签区封闭序列包括7～10个LAN或BNA修饰的碱基，且右侧非标签区封闭序列的3’端带有封闭修饰。通过在左侧和右侧非标签区分别设计5～7个和7～10个LNA或BNA修饰的碱基序列能够显著增强与待封闭序列的结合能力，从而增加封闭效果；3’端进行封闭修饰能够减少或避免文库的非特异性捕获，提高目的文库捕获的中靶率。

【技术实现步骤摘要】
通用封闭序列及其应用
本专利技术涉及高通量测序文库构建领域，具体而言，涉及一种通用封闭序列及其应用。
技术介绍
随着高通量测序在临床应用的辅助诊断重要性的提升，如何降低测序成本是一个很关键的问题，降低测序成本在不同的层面有相应的表现：华大智造(MGI)不断推出更高测序通量的测序仪，测序成本不断降低，相继推出MGI-200、MGI-2000和T7测序仪，其中T7测序仪是目前市场上测序通量最高和测序成本最低的测序仪。此外靶向捕获测序也是在检测目标序列的同时实现大规模降低检测成本的有效途径。在测序的过程中，不同样本用不同的Index序列来区分，进而将多个样本混合测序，也是高通量测序能够降低单个样本成本的方式。但是，如果采用单端Index，由于Index接头或引物在合成、文库构建实验操作以及测序的各个环节，都不可避免地会导致污染和/或相互串扰。因此，需要一种方式解决样本之间的低频度的相互串扰，目前解决这个问题的方法是采用双端Index来区分不同的样本，用双端Index的方法可以有效去除样本之间的相互串扰。通过杂交捕获可以有效地降低检测目本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种通用封闭序列，其特征在于，所述通用封闭序列按照从5’到3’的方向包括依次连接的左侧非标签区封闭序列、中间标签区封闭序列及右侧非标签区封闭序列，/n其中，所述左侧非标签区封闭序列包括5～7个LAN或BNA修饰的碱基，所述中间标签区封闭序列为通用封闭碱基序列，所述右侧非标签区封闭序列包括7～10个LAN或BNA修饰的碱基，且所述右侧非标签区封闭序列的3’端带有封闭修饰。/n

【技术特征摘要】
1.一种通用封闭序列，其特征在于，所述通用封闭序列按照从5’到3’的方向包括依次连接的左侧非标签区封闭序列、中间标签区封闭序列及右侧非标签区封闭序列，
其中，所述左侧非标签区封闭序列包括5～7个LAN或BNA修饰的碱基，所述中间标签区封闭序列为通用封闭碱基序列，所述右侧非标签区封闭序列包括7～10个LAN或BNA修饰的碱基，且所述右侧非标签区封闭序列的3’端带有封闭修饰。


2.根据权利要求1所述的通用封闭序列，其特征在于，所述3’端的所述封闭修饰为MGB修饰、C3间隔臂修饰，磷酸化修饰，地高辛修饰或生物素修饰，或者所述3’端碱基为双脱氧碱基。


3.根据权利要求1所述的通用封闭序列，其特征在于，所述通用封闭碱基为次黄嘌呤或C3间隔臂。


4.根据权利要求1至3中任一项所述的通用封闭序列，其特征在于，所述通用封闭序列为MGI测序平台的带有第一标签序列的P1接头的封闭序列或带有第二标签序列的P2接头的封闭序列，其中，
所述P1接头的封闭序列为SEQIDNO:3：
CTCTCA+GTACG+TCA+GCA+GT+TXXXXXXXXXXCA+ACTCCT+TGGC+TCACAGA+ACGA+CATGG+CTACGATC+CGACTT/3SpC3/；其中+表示LAN或BNA修饰，X表示次黄嘌呤或C3spacer，/3SpC3/为3’端的C3间隔臂修饰；
所述P2接头的封闭序列为SEQIDNO:4：
GCA+TGGC+GA+CCTT+ATCA+GXXXXXXXXXXXTTGTCTT+CCTA+AGA+CCGC+TTG+GCC+TCCGA+CTT/3SpC3/；其中+表示LAN或BNA修饰，X表示次黄嘌呤或C3spacer，/3SpC3/为3’端的C3间隔臂修饰。


5.根据权利要求1至3中任一项所述的通用封闭序列，其特征在于，所述通用封闭序列为MGI测序平台的...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡玉刚，汪彪，郑文莉，吴强，
申请(专利权)人：纳昂达南京生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32