5-羟甲基胞嘧啶在评估乳腺癌转移潜能及治疗中的应用制造技术

本申请涉及5‑羟甲基胞嘧啶在评估乳腺癌转移潜能及治疗中的应用。具体而言，本申请涉及5‑羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备诊断装置中的用途，所述诊断装置用于选自以下的一项或组合：预测乳腺癌的转移能力、预测乳腺癌的淋巴结转移能力、转移型乳腺癌的预后、评价转移型乳腺癌的治疗效果、评价转移型乳腺癌患者对治疗的敏感性。

【技术实现步骤摘要】
5-羟甲基胞嘧啶在评估乳腺癌转移潜能及治疗中的应用
本专利技术属于肿瘤诊断标记物领域，更具体地涉及5-羟甲基化胞嘧啶(5-hydroxymethylcysotine，5hmC)在乳腺癌转移潜能评估以及转移乳腺癌治疗中的用途。
技术介绍
DNA表观修饰是肿瘤发生发展过程中重要的调控因子。5-羟甲基化胞嘧啶(5-hydroxymethylcysotine，5hmC)来源于5-甲基胞嘧啶(5mC)，是胞嘧啶第五位碳原子上的羟甲基化修饰。5hmC不仅是DNA去甲基化的中间体，也可以作为独立的表观修饰参与多种生物学过程。研究发现，5hmC密切参与肿瘤发生，肿瘤组织中5hmC显著低于癌旁正常组织，但关于5hmC是如何参与肿瘤细胞的转移却鲜有研究。CN106460050A中公开了一种表观遗传修饰的细胞系，其包含至少一种具有预定胞嘧啶修饰的染色体整合核酸，其中所述胞嘧啶修饰与已知的诊断、预后或对疾病治疗的敏感性水平相关。所述胞嘧啶修饰选自：5mC、3mC、5hmC、5fC或5caC。CN106460050A发现MGMT、BRCA1、BRCA2、PITX2、GSTP1、APC、RASSF1或HER2基因上的胞嘧啶修饰可以在用于诊断疾病(诸如，癌症)、预测疾病结果、监测疾病行为和测量对靶向疗法的应答的测定中用作参照标准。CN102759626A公开了5-羟甲基胞嘧啶用作受精卵雄核标记物或雌核标记物的用途。乳腺癌在全球范围内位居女性肿瘤发病率之首。虽然早期乳腺癌预后良好，但存在淋巴结以及远处脏器转移的乳腺癌患者，预后往往不容乐观。乳腺癌腋窝淋巴结转移，作为临床最常见的转移，是评估患者不良预后的重要的指标之一，也是评估肿瘤的转移能力的重要指标。近年研究发现转移到淋巴结的肿瘤细胞会进一步向远处脏器播散，形成远处脏器的转移。鉴于肿瘤细胞的转移情况对乳腺癌患者生存及预后意义重大，而目前临床上尚未有用于评估肿瘤转移能力的特异性标记物，因此，开发可用于乳腺癌转移预测、治疗以及预后的靶标有重要的临床意义。
技术实现思路
根据本申请的一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平在疾病诊断、预后中的用途。根据一些实施方式，提供了检测试剂在制备诊断装置中的用途，其中所述检测试剂是5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂。在一些实施方式中，提供了检测试剂在制备诊断装置中的用途，其中所述检测试剂是5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂，并且所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在核酸水平的5-羟甲基化胞嘧啶。在一些实施方式中，提供了检测试剂在制备诊断装置中的用途，其中所述检测试剂是5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂，并且所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在DNA水平的5-羟甲基化胞嘧啶；所述定量试剂能够定量基因在DNA水平上的5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平。在一些实施方式中，本申请的检测试剂定量基因在DNA水平上的5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平。在具体的实施方式中，所述基因选自以下的一个或组合：ARHGEF10L、ALDH4A1、CPXM2、ANKK1、UBL4B、KANK4、CROCC2、BRD3、IL34、MEGF6、GTF2F1、PLCH2、PBX4、TTYH2、CBFA2T3、MAP7D1、UNC5D、LRRC29、GLI2、TMEM201；BRD1、NFE2、PTGFRN、PIK3R5。任一个基因的5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平均可以单独作为标记物、或组合使用。在一些实施方式中，根据本申请的用途，所述诊断装置用于选自以下用途的任一项或组合：-预测早期乳腺癌的转移能力、-评价乳腺癌的淋巴结转移能力、-转移型乳腺癌的预后、-评价转移型乳腺癌的治疗效果、-评价转移型乳腺癌患者对治疗的敏感性。在本申请上下文中，所述诊断装置体现为任何可行的已有的或未来形式，例如但不限于仪器、设备、试剂、试剂盒或芯片。尽管本申请的具体实例采用了试剂的形式，但是不排除其它实现羟甲基化修饰水平的检测技术手段。因为本申请的实施不依赖于具体的检测方式，本申请技术效果的实现依赖于特定基因(尤其是在基因特定区域上)的羟甲基化修饰水平和疾病状态之间的关联。在本申请上下文中，尤其检测兴趣基因特定位置的羟甲基化修饰水平，其选自以下的一种或组合：外显子区域、启动子区域、转录起始位点上游0kb至-1.5kb的区域，优选0、-0.1、-0.2、-0.3、-0.4、-0.5、-0.6、-0.7、-0.8、-0.9、-1.0、-1.1、-1.2、-1.3、-1.4、-1.5kb，及其两个数值之间的范围。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备诊断装置中的用途。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备预测早期乳腺癌转移能力的诊断装置中的用途。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平在预测早期乳腺癌转移能力中的用途。根据另一些实施方式，提供了基因水平的5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平在预测早期乳腺癌转移能力中的用途。在一些实施方式中，所述的基因选自以下的一个或组合：ARHGEF10L、ALDH4A1、CPXM2、ANKK1、UBL4B、KANK4、CROCC2、BRD3、IL34、MEGF6、GTF2F1、PLCH2、PBX4、TTYH2、CBFA2T3、MAP7D1、UNC5D、LRRC29、GLI2、TMEM201，优选MAP7D1。在具体的实施方式中，选自ARHGEF10L、ALDH4A1、CPXM2、ANKK1、UBL4B、KANK4、CROCC2、BRD3、IL34、MEGF6、GTF2F1、PLCH2、PBX4、TTYH2、CBFA2T3、MAP7D1、UNC5D、LRRC29、GLI2、TMEM201的基因的5-羟甲基化胞嘧啶水平升高，在统计学显著水平上指示早期乳腺癌的转移能力增强。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶修饰水平用于评价乳腺癌的淋巴结转移能力中的用途。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备诊断装置中的用途。根据另一些实施方式，提供了5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备用于评价乳腺癌的淋巴结转移能力的诊断装置中的用途。在一些实施方式中，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因水平的5-羟甲基化胞嘧啶；所述的基因选自以下的一个或组合：BRD1、NFE2、PTGFRN、PIK3R5。在具体的实施方式中，选自BRD1、NFE2、PTGFRN、PIK3R5的基因的5-羟甲基化胞嘧啶水平降低，在统计学显著水平上指示乳腺癌的淋巴结转移能力增强。根据另一些实施方式，提供了TET的定量试剂和5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂两者的组合用途。在一些实施方式中，提供了TET的定量试剂和5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂两者的组合在制备诊断装置中的用途。在一些实施方式中，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在核酸水平的5-羟甲基化胞嘧啶；更优选，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在DNA水平的5-羟甲基化胞嘧啶。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测试剂在制备诊断装置中的用途，其中：/n所述检测试剂是5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂；/n优选，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在核酸水平的5-羟甲基化胞嘧啶；/n更优选，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在DNA水平的5-羟甲基化胞嘧啶；/n所述诊断装置用于选自以下的一项或组合：预测早期乳腺癌的转移能力、评价乳腺癌的淋巴结转移能力、转移型乳腺癌的预后、评价转移型乳腺癌的治疗效果、评价转移型乳腺癌患者对治疗的敏感性；/n所述诊断装置体现为选自以下的一种或组合：试剂盒、芯片。/n

【技术特征摘要】
20190130 CN 20191008879631.检测试剂在制备诊断装置中的用途，其中：
所述检测试剂是5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂；
优选，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在核酸水平的5-羟甲基化胞嘧啶；
更优选，所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在DNA水平的5-羟甲基化胞嘧啶；
所述诊断装置用于选自以下的一项或组合：预测早期乳腺癌的转移能力、评价乳腺癌的淋巴结转移能力、转移型乳腺癌的预后、评价转移型乳腺癌的治疗效果、评价转移型乳腺癌患者对治疗的敏感性；
所述诊断装置体现为选自以下的一种或组合：试剂盒、芯片。


2.根据权利要求1所述的用途，其中：
所述核酸选自以下的一种或组合：外显子区域、启动子区域、转录起始位点上游0kb至-1.5kb的区域，优选-0.5kb至-1kb的区域。


3.根据权利要求1所述的用途，其中：
所述的基因选自以下的一个或组合：ARHGEF10L、ALDH4A1、CPXM2、ANKK1、UBL4B、KANK4、CROCC2、BRD3、IL34、MEGF6、GTF2F1、PLCH2、PBX4、TTYH2、CBFA2T3、MAP7D1、UNC5D、LRRC29、GLI2、TMEM201；BRD1、NFE2、PTGFRN、PIK3R5。


4.5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备诊断装置中的用途，其中：
所述诊断装置用于预测早期乳腺癌的转移能力；
所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因水平的5-羟甲基化胞嘧啶；
所述的基因选自以下的一个或组合：ARHGEF10L、ALDH4A1、CPXM2、ANKK1、UBL4B、KANK4、CROCC2、BRD3、IL34、MEGF6、GTF2F1、PLCH2、PBX4、TTYH2、CBFA2T3、MAP7D1、UNC5D、LRRC29、GLI2、TMEM201，优选MAP7D1；
所述诊断装置体现为选自以下的一种或组合：试剂盒、芯片；
优选地，所述基因的5-羟甲基化胞嘧啶水平升高，在统计学显著水平上指示早期乳腺癌的转移能力增强。


5.5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂在制备诊断装置中的用途，其中：
所述诊断装置用于评价乳腺癌的淋巴结转移能力；
所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因水平的5-羟甲基化胞嘧啶；
所述的基因选自以下的一个或组合：BRD1、NFE2、PTGFRN、PIK3R5；
所述诊断装置体现为选自以下的一种或组合：试剂盒、芯片；
优选地，所述基因的5-羟甲基化胞嘧啶水平降低，在统计学显著水平上指示乳腺癌的淋巴结转移能力增强。


6.TET的定量试剂和5-羟甲基化胞嘧啶的定量试剂两者组合在制备诊断装置中的用途，其中：
所述5-羟甲基化胞嘧啶是基因在核酸水平的5-羟甲基化胞...

【专利技术属性】
技术研发人员：牛亚梅，吴双伶，金锋，佟伟民，
申请(专利权)人：中国医学科学院基础医学研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11