【技术实现步骤摘要】
一种添加分子标签的多重PCR方法及建库仪器
本专利技术涉及基因测序文库
,具体涉及一种添加分子标签的多重PCR方法及建库仪器。
技术介绍
目前NGS建库富集的方法主要有两种,一种是通过连接的方法加上接头,再通过探针富集的方法,常称之为探针捕获法。一种是通过PCR引物组经过多轮扩增建库富集,该方法称为多重PCR法。多重PCR法较探针法更快捷,灵活性更高而且成本更低,适用于起始量低,片段长度较大的样本。测序和建库过程中常常需要PCR的过程,尤其是多重PCR法,都会出现一些系统错误,如illuminaHiseq平台的测序错误率在0.1-0.3%。但随着对测序结果的准确度要求越来越高,需要添加分子标签(Uniquemolecularidentifier,UMI)。多重PCR法添加分子标签具有较高难度,如果借鉴探针法添加分子标签的方法,单纯地在引物上添加分子标签,随着扩增循环数地增加,引入的分子标签种类增多,面临着一个基因组模板对应多个分子标签的状况。这样就不是严格的一个模板对应一种分子标签,导致后期分析操作误认 ...
【技术保护点】
1.一种添加分子标签的多重PCR方法,其特征在于,所述方法包括:/n步骤S10:选择基因组位点或DNA区域作为DNA模板并进行引物组设计;/n步骤S20:对所述引物组添加对应的分子标签;/n步骤S30:使用所述引物组以及通用引物对所述DNA模板进行第一轮多重PCR扩增,得到第一产物;/n步骤S40:对所述第一产物进行第一纯化处理和切割不匹配分子标签处理,以得到第二产物;/n步骤S50:使用通用引物对所述第二产物进行第二轮多重PCR扩增并添加索引,以得到第三产物;/n步骤S60:对所述第三产物进行第二纯化处理,以得到文库。/n
【技术特征摘要】
1.一种添加分子标签的多重PCR方法,其特征在于,所述方法包括:
步骤S10:选择基因组位点或DNA区域作为DNA模板并进行引物组设计;
步骤S20:对所述引物组添加对应的分子标签;
步骤S30:使用所述引物组以及通用引物对所述DNA模板进行第一轮多重PCR扩增,得到第一产物;
步骤S40:对所述第一产物进行第一纯化处理和切割不匹配分子标签处理,以得到第二产物;
步骤S50:使用通用引物对所述第二产物进行第二轮多重PCR扩增并添加索引,以得到第三产物;
步骤S60:对所述第三产物进行第二纯化处理,以得到文库。
2.根据权利要求1所述的添加分子标签的多重PCR方法,其特征在于,所述引物组设计的引物形式包括常规单链引物、发夹引物和欧米伽引物中的任意一种或多种。
3.根据权利要求1所述的添加分子标签的多重PCR方法,其特征在于,所述第一轮多重PCR扩增反应包括3个循环。
4.根据权利要求1所述的添加分子标签的多重PCR方法,其特征在于,所述步骤S40包括:
步骤S410:对所述第一产物加入纯化磁珠,洗涤纯化后加入适量去离子水溶解;
步...
【专利技术属性】
技术研发人员:徐飞岳,王堰汇,缑灵山,
申请(专利权)人:深圳易倍科华生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:广东;44
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