【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】作为用于鉴定免疫细胞,特别是初始CD8+T细胞的表观遗传标志物的内皮唾液酸蛋白(CD248)本专利技术涉及用于鉴定特异性免疫细胞(特别是初始CD8+T细胞)的方法(特别是体外方法),其包括分析哺乳动物内皮唾液酸蛋白(CD248)基因区中至少一个CpG位置的修饰(如甲基化状态),其中当与非初始CD8+T细胞或任何其它(血液)细胞类型相比时,所述基因区的脱甲基化或修饰(如甲基化)的缺乏指示初始CD8+T细胞。根据本专利技术的分析可以在表观遗传水平上鉴定初始CD8+T细胞,并将它们与复杂样品中的所有其它细胞(如例如其它血液细胞或免疫细胞)区分开。本专利技术还提供了用于定量初始CD8+T细胞(特别是在初始CD8+T细胞复杂样品中的初始CD8+T细胞)的改进方法。所述方法可以在有或没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下进行,优选在全血和/或非胰蛋白酶消化的组织中进行。此外,本专利技术涉及用于进行上述方法的试剂盒及其各自的用途。本专利技术的一个目的是提供一种新颖的,更稳健的方法来定量检测和测量任何体液(如血液)、任何实体器官或组织内的或哺乳动物的初始CD8 ...
【技术保护点】
1.用于鉴定来源于人的样品中初始CD8+T细胞的方法,其包括分析人内皮唾液酸蛋白(CD248)基因区中至少一个CpG位置的修饰,诸如例如甲基化状态,其中优选地,所分析的所述基因区根据SEQ ID No.1定位,其中当与非初始CD8+T细胞相比时,所述基因区的所述修饰的缺乏,诸如脱甲基化或甲基化的缺乏指示初始CD8+T细胞。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171026 DE 102017125150.21.用于鉴定来源于人的样品中初始CD8+T细胞的方法,其包括分析人内皮唾液酸蛋白(CD248)基因区中至少一个CpG位置的修饰,诸如例如甲基化状态,其中优选地,所分析的所述基因区根据SEQIDNo.1定位,其中当与非初始CD8+T细胞相比时,所述基因区的所述修饰的缺乏,诸如脱甲基化或甲基化的缺乏指示初始CD8+T细胞。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述至少一个CpG位置存在于所分析的所述基因区的转录起始上游的5’区、启动子区、5’或3’非翻译区、外显子、内含子、外显子/内含子边界,和/或转录终止下游的3’区。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述至少一个CpG位置选自这样的CpG,其选自根据SEQIDNo.1的扩增子中的CpG的位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20和21,并且优选地选自根据根据SEQIDNo.2或3的亚硫酸氢盐转化序列的第1817号扩增子的片段中的CpG位置10、11、12和13。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述亚硫酸氢盐可转化性的分析包括选自甲基化特异性酶促消化、亚硫酸氢盐测序的方法,选自启动子甲基化、CpG岛甲基化、MSP、重甲基、甲基化荧光检测、Ms-SNuPE的分析,以及依赖于扩增DNA的检测的其它方法。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其还包括基于比较所分析的区域中所述甲基化频率的相对量与诸如例如GAPDH的对照基因中的甲基化频率的相对量,对初始CD8+T细胞的相对量进行定量。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述样品选自哺乳动物体液,其包括人血液样品,或组织、器官或细胞类型的血液样品,血液淋巴细胞样品或其级分。
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【专利技术属性】
技术研发人员:斯文·欧莱克,贾尼卡·约瑟芬·舒尔茨,
申请(专利权)人:艾皮恩蒂斯有限公司,
类型:发明
国别省市:德国;DE
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