【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于鉴定免疫细胞特别是PD1+细胞的作为表观遗传标志物的PDCD1本专利技术涉及一种用于鉴定PD1+细胞的方法，特别是一种体外方法，包括分析哺乳动物的程序性细胞死亡1(PDCD1)基因区中至少一个CpG位置的表观遗传修饰/特性(包括甲基化状态)，其中与非PD1+细胞相比，所述基因区的去甲基化或缺乏甲基化指示PD1+细胞。根据本专利技术的分析可以在表观遗传水平上鉴定PD1+细胞，并将其与复杂样品中的所有其他细胞(例如其他血液细胞或免疫细胞)区分开来。本专利技术还提供了一种用于定量PD1+细胞(特别是在复杂样品中)的改进方法。该方法可以在没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下，优选在全血和/或非胰蛋白酶化组织中进行。此外，本专利技术涉及用于进行上述方法的试剂盒及其相应的用途。本专利技术的一个目的是提供一种新的、更强健的方法来定量检测和测量哺乳动物的任何实体器官或组织的血液、或体液中的PD1+细胞。专利技术背景通常，PD1+细胞被定义为主动合成由基因程序性细胞死亡1编码的蛋白质的细胞。在目前的应用中，PD1+细胞被定义为通过提供可获得...
【技术保护点】
1.鉴定样品中的PD1+细胞的方法，包括分析哺乳动物的程序性细胞死亡1(PDCD1)基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态，其中优选地，所分析的所述基因区根据SEQ ID No.1定位，其中与非PD1+细胞相比，所述基因区的去甲基化或缺乏甲基化指示PD1+细胞。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171025 DE 102017125019.01.鉴定样品中的PD1+细胞的方法，包括分析哺乳动物的程序性细胞死亡1(PDCD1)基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态，其中优选地，所分析的所述基因区根据SEQIDNo.1定位，其中与非PD1+细胞相比，所述基因区的去甲基化或缺乏甲基化指示PD1+细胞。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一个CpG位置存在于所分析的所述基因区的转录起始上游的5’区、启动子区、5’或3’非翻译区、外显子、内含子、外显子/内含子边界和/或转录终止下游的3’区。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述至少一个CpG位置选自根据SEQIDNo.2的扩增子1876中的CpG位置27、47、82、136、194、197、249、285、290、303、336、354和369，根据SEQIDNo.3的扩增子1877中的CpG位置31、60、75、86、114、138、142、171、184、210、217和241，根据SEQIDNo.4的扩增子1878中的CpG位置35、56、74、104、118、130、150、182、196和212，并且优选选自根据SEQIDNo.3的扩增子1877的片段中的CpG位置60、75、86、114、138、142、171、184、210、217和241。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中亚硫酸氢盐可转化性分析包括选自甲基化特异性酶消化、亚硫酸氢盐测序的方法，选自启动子甲基化、CpG岛甲基化、MSP、重甲基、荧光定量法、Ms-SNuPE以及其他依赖扩增DNA检测的方法的分析。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，还包括基于将所分析的所述区域中的甲基化频率的相对量与对照基因(例如GAPDH)中的甲基化频率的相对量进行比较来定量PD1+细胞的相对量。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述样品选自哺乳动物体液，包括人血液样品或组织、器官或细...
【专利技术属性】
技术研发人员：斯文·欧莱克，乌多·巴伦，
申请(专利权)人：艾皮恩蒂斯有限公司，
类型：发明
国别省市：德国;DE
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