基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系、扩增方法及常规引物对技术

本发明专利技术提供了一种基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系，所述恒温扩增体系包括具有串联重复序列的DNA模板、DNA聚合酶和常规引物对，所述DNA聚合酶为具有链置换活性的DNA聚合酶，所述常规引物对是指在恒温扩增时，常规引物对结合到模板DNA后无需折叠成特定的二级结构。该恒温扩增方法，结合具有链置换活性的DNA聚合酶和常规引物(即引物结合到模板DNA后无需折叠成特定的二级结构)即可实现指数级恒温扩增重复DNA序列。

Constant temperature amplification system, amplification method and conventional primer pair for tandem repeats based on conventional primers

【技术实现步骤摘要】
基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系、扩增方法及常规引物对
本专利技术涉及生物
，具体地，涉及一种基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系、扩增方法及常规引物对。
技术介绍
恒温扩增方法多种多样，其中主要的方法有依赖核酸序列的扩增反应(nucleicacidsequence-basedamplification，NASBA)、依赖解链酶的扩增反应(helicasedependentamplification，HDA)、环介导等温扩增反应(loop-mediatedisothermalamplification，LAMP)、链置换扩增反应(stranddisplacementamplification，SDA)、重组酶聚合酶扩增(recombinasepolymeraseamplification，RPA)。这些方法的主要特征是反应体系中含有链置换活性的核酸聚合酶和特殊设计的引物，特殊设计的引物结合到模板DNA后需要折叠成特定的二级结构，便于后续的恒温扩增。但是，上述恒温扩增方法体系都需要根据扩增模板以及具体其恒本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系，其特征在于，所述恒温扩增体系包括具有串联重复序列的DNA模板、DNA聚合酶和常规引物对，所述DNA聚合酶为具有链置换活性的DNA聚合酶，所述常规引物对是指在恒温扩增时，常规引物对结合到模板DNA后无需折叠成特定的二级结构。/n

【技术特征摘要】
1.一种基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系，其特征在于，所述恒温扩增体系包括具有串联重复序列的DNA模板、DNA聚合酶和常规引物对，所述DNA聚合酶为具有链置换活性的DNA聚合酶，所述常规引物对是指在恒温扩增时，常规引物对结合到模板DNA后无需折叠成特定的二级结构。


2.根据权利要求1所述的基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系，其特征在于，所述具有串联重复序列的DNA模板为重复DNA序列rDs7或结核分枝杆菌H37Rv基因组DNA；
当重复DNA序列rDs7为模板时，所述常规引物对为：
正向引物：5'GAACTTCACCAGCACACTGA3'
反向引物：5'AGCCACGATCTTTGACTTGT3'
当结核分枝杆菌H37Rv基因组DNA为模板时，所述常规引物对为：
正向引物：5'GCCGGCGACGATGCAGAGC3'
反向引物：5'GCGCCGCTCCTCCTCATCG3'；
或
正向引物：5'GCCGGCGACGATGCAGAGC3'
反向引物：5'GCCGGCGACGATGCAGAGC3'。


3.根据权利要求2所述的基于常规引物的针对串联重复序列的恒温扩增体系，其特征在于，所述重复DNA序列rDs7由7个高度同源DNA序列rDs7-1～rDs7-7按照先后顺序拼接而成；rDs7-1的序列如SEQIDNO：1所示；rDs7-2的序列如SEQIDNO：2所示；rDs7-3的序列如SEQIDNO：3所示；rDs7-4的序列如SEQIDNO：4所示；rDs7-5的序列如SEQIDNO：5所示；rDs7-6的序列如SEQIDNO：6所示；rDs7-7的序列如SEQIDNO：7所示。


4.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：范小勇，吴康，罗道良，
申请(专利权)人：上海市公共卫生临床中心，
类型：发明
国别省市：上海;31