【技术实现步骤摘要】
一种芝麻SSR分子标记的扩增方法及其应用
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种芝麻SSR分子标记的扩增方法及其应用。
技术介绍
SSR(Simplesequencerepeats)标记,也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA)标记,是近年来植物研究中应用最为广泛的常用分子标记之一,该标记因具有稳定性高、信息量丰富及易于操作等优点,已经在遗传多样性、指纹图谱鉴定、关联分析、遗传图谱构建及QTL定位等方面得到广泛应用。传统的SSR分子标记技术,包括DNA提取、PCR扩增和凝胶电泳检测等步骤。DNA提取过程中需要样品的液氮研磨、水浴、离心、吸取上清液、沉淀、漂洗、干燥、溶解等多个步骤,操作繁琐,且需要大量的化学试剂和相关的仪器设备,一定程度上影响了大规模样品的实验进程。此外,芝麻含有大量的多聚糖、油脂类等黏性生物物质尤其是成株期叶片的DNA提取过程中,黏性类物质严重影响了DNA提取过程中样品研磨、吸取上清液、沉淀、晾干、溶解等操作,常出现提取失败或DNA质量不佳的状况。随着分子标记检测、分子标记辅助选择 ...
【技术保护点】
1.一种芝麻SSR分子标记的扩增方法,其特征在于,包括:获取芝麻的DNA;以所述芝麻的DNA为模板,对SSR分子标记进行PCR扩增;/n所述芝麻的DNA获取方法为:取0.3μg新鲜叶片置于40μl的0.5mol/L NaOH溶液中静置10-15min,然后向其中加入100mmol/L pH 8.0的Tris-HCL溶液400μl,混匀,所得溶液即为所述芝麻的DNA溶液。/n
【技术特征摘要】
1.一种芝麻SSR分子标记的扩增方法,其特征在于,包括:获取芝麻的DNA;以所述芝麻的DNA为模板,对SSR分子标记进行PCR扩增;
所述芝麻的DNA获取方法为:取0.3μg新鲜叶片置于40μl的0.5mol/LNaOH溶液中静置10-15min,然后向其中加入100mmol/LpH8.0的Tris-HCL溶液400μl,混匀,所得溶液即为所述芝麻的DNA溶液。
2.根据权利要求1所述的扩增方法,其特征在于,所述芝麻新鲜叶片选自芽期的子叶、幼苗期的全展叶片、苗期的四对真叶期叶片或成株期的上部幼嫩叶片;
所述取样的芝麻叶片直径为0.6-0.8mm。
3.根据权利要求1或2所述的扩增方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为:模板2μl,10×Taqbufferwith(NH4)2SO41μl,25mmolMgCl20.8μl,10mmoldNTP0.2μl,50ng/μl正向引物0.3μl,50ng/μl反向引物0.3μl,5U/μlTaqDNA聚合酶0.2μl,ddH2O补充至10μl。
4.根据权利要求1-3任一项所述的扩增方法,其特征在于,所述PCR扩增的程序为:94-95℃变性3min;10个循环:94℃变性1min,60℃-...
【专利技术属性】
技术研发人员:孙建,叶艳英,乐美旺,颜廷献,梁俊超,颜小文,饶月亮,周红英,
申请(专利权)人:江西省农业科学院作物研究所,
类型:发明
国别省市:江西;36
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