【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，具体涉及一种刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物及其应用。
技术介绍
1、芝麻(sesamumindicum l.,2n＝26)是一种古老且具有高价值的油籽作物，因其多样的饮食用途、保健功效和工业应用而受到广泛重视。但与其他商业油籽作物相比，芝麻在育种改良方面相对落后。基因库狭窄是限制芝麻育种研究的主要因素。目前栽培芝麻品种遗传背景较为单一，抗病性和抗逆性较差。育种者迫切需要获取新的优异基因资源，拓宽当前芝麻品种的遗传多样性，以适应不断变化的环境条件。
2、与芝麻同属胡麻属中的刚果野芝麻(sesamum schinzianum,2n＝64)具有优异的抗病和抗逆特性。近年来，研究人员通过远缘杂交、胚拯救等技术手段获得了刚果野芝麻与多个普通栽培芝麻材料的杂种植株(张海洋等，2012)。利用刚果野芝麻与栽培芝麻杂交，有望对栽培芝麻的抗病抗逆性状进行改良，培育出高产且适应性强的芝麻新品种。快速实现远缘杂交种及其后代的真伪鉴定有利于提高育种选择效率。
3、分子标记被广泛应用于植物种质资源鉴定。位于细胞质的叶绿体表现为母系遗传，子代中的叶绿体基因组完全继承自母本。在刚果野芝麻与栽培种的远缘杂交中，一般以具有较大基因组的刚果野芝麻作为母本，较易获得杂种后代。因此，利用叶绿体基因组特异标记可实现对远缘杂交种及其后代的快速鉴定。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物及其应用，以可用于刚果野芝麻远缘杂交后代鉴
2、上述目的可以是通过以下技术方案的实施方式实现：
3、一种刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物，所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少一种；
4、所述引物对cp-1中，f引物的核苷酸序列如seq id no.1所示；r引物的核苷酸序列如seq id no.2所示；
5、所述引物对cp-2中，f引物的核苷酸序列如seq id no.3所示；r引物的核苷酸序列如seq id no.4所示；
6、所述引物对cp-3中，f引物的核苷酸序列如seq id no.5所示；r引物的核苷酸序列如seq id no.6所示。
7、可选的，所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少两种。
8、一种试剂盒，所述试剂盒中包含上述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物。
9、可选的，所述试剂盒中还包含有pcr试剂。
10、可选的，所述试剂盒中还包含电泳所需的试剂。
11、上述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物、试剂盒在鉴别刚果野芝麻叶绿体基因组或刚果野芝麻杂交后代中的应用。
12、一种鉴别刚果野芝麻叶绿体基因组的方法，包括如下步骤：
13、步骤1)提取待测材料叶片dna以及刚果野芝麻叶片dna为模板，采用上述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物进行pcr扩增；
14、步骤2)将步骤1)中的扩增产物进行凝胶电泳检测；如果待测材料均和刚果野芝麻的扩增产物具有相同大小条带，则说明待测材料中包含刚果野芝麻叶绿体基因组。
15、一种鉴定刚果野芝麻远缘杂交后代的方法，包括如下步骤：
16、步骤1)提取待测材料叶片dna、母本刚果野芝麻叶片dna和父本栽培种叶片dna为模板，采用上述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物进行pcr扩增；
17、步骤2)将步骤1)中的扩增产物进行凝胶电泳检测；如果待测材料的扩增产物和刚果野芝麻具有相同大小条带，且不具有和父本栽培种相同大小的条带；则说明待测材料为刚果野芝麻为真杂交种。
18、可选的，所述步骤1)中采用引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3分别进行pcr扩增；所述步骤2)中如果待测材料用引物对cp-1、引物对cp-2和引物对cp-3进行pcr扩增的扩增产物均和刚果野芝麻具有相同大小条带，且不具有和父本栽培种相同大小的条带，则说明待测材料为刚果野芝麻为真杂交种；如果一对或多对引物扩增后得到的产物具有和父本相同大小的条带或与父母本均不同的条带，说明待测材料为假杂种。
19、本专利技术具有如下的有益效果：
20、本专利技术可实现对刚果野芝麻与栽培种远缘杂交后代的快速、有效鉴定和早期选择。有利于促进刚果野芝麻在栽培芝麻远缘杂交育种中的应用。与性状调查和染色体压片等传统方法相比，本专利技术操作简单，且具有稳定的重复性以及整体实验周期短等特点。适用于刚果野芝麻和栽培种杂交后代的真伪鉴定。
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1.一种刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物，其特征在于，所述刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少一种；
2.一种刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物，其特征在于，所述刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少两种。
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包含权利要求1或2所述刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物。
4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还包含有PCR试剂。
5.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还包含电泳所需的试剂。
6.根据权利要求1或2所述刚果野芝麻叶绿体InDel标记检测引物、权利要求3～5中任一项所述的试剂盒在鉴别刚果野芝麻叶绿体基因组或刚果野芝麻杂交后代中的应用。
7.一种鉴别刚果野芝麻叶绿体基因组的方法，其特征在于，包括如下步骤：
8.一种鉴定刚果野芝麻远缘杂交后代的方法，其特征在于，包括如下步骤：
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【技术特征摘要】
1.一种刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物，其特征在于，所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少一种；
2.一种刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物，其特征在于，所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物包括引物对cp-1、引物对cp-2、引物对cp-3中的至少两种。
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包含权利要求1或2所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物。
4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还包含有pcr试剂。
5.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还包含电泳所需的试剂。
6.根据权利要求1或2所述刚果野芝麻叶绿体indel标记检测引物、权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：梁俊超，孙建，颜小文，曾攀，王郅琪，
申请(专利权)人：江西省农业科学院作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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