针对突变的RAS的HLA II类限制性T细胞受体制造技术

技术编号:24295820 阅读:24 留言:0更新日期:2020-05-26 21:14
公开了分离或纯化的T细胞受体(TCR),其中该TCR对人类白细胞抗原(HLA)II类分子呈递的突变的Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)具有抗原特异性。还提供了相关多肽及蛋白质,以及相关核酸、重组表达载体、宿主细胞、细胞群体及药物组合物。还公开了检测哺乳动物中癌症存在的方法及治疗或预防哺乳动物癌症的方法。

HLA class II restricted T cell receptor for mutant ras

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】针对突变的RAS的HLAII类限制性T细胞受体相关申请的交叉引用本专利申请要求2017年9月20日提交的美国临时专利申请第62/560,930号的权益,该美国临时专利申请在本文中通过引用以其整体并入。关于联邦政府资助的研究或开发的声明本专利技术是在政府支持下由国立卫生研究院(NationalInstitutesofHealth)的国家癌症研究院(NationalCancerInstitute)以项目号BC010984作出。该政府享有本专利技术的某些权利。以电子方式提交的材料通过引用并入通过引用整体并入本文的是随本文同时提交的并且如下确定的计算机可读的核苷酸/氨基酸序列表:名称为“739664_ST25.txt”,日期为2018年9月5日的一份59,753字节ASCII(文本)文件。专利技术背景一些癌症可具有极有限之治疗选择,尤其在癌症变为转移性及不可切除性时。尽管诸如手术、化学疗法及辐射疗法等治疗已获进展,但许多癌症(例如胰腺癌、结肠直肠癌、肺癌、子宫内膜癌、卵巢癌及前列腺癌)的预后可能较差。因此,存在对癌症的其它治疗的未满足需求。专利技术简述本专利技术的实施方案提供了分离或纯化的T细胞受体(TCR),其中该TCR对由人类白细胞抗原(HLA)II类分子呈递的突变的人类Ras氨基酸序列具有抗原特异性,其中突变的人类RAS氨基酸序列是突变的人类Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)氨基酸序列、突变的人类Harvey大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)氨基酸序列或突变的人类神经母细胞瘤大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(NRAS)氨基酸序列。本专利技术的另一实施方案提供了包括本专利技术TCR的功能部分的分离或纯化的多肽,其中该功能部分包括以下氨基酸序列:(a)全部SEQIDNO:1-3,(b)全部SEQIDNO:4-6,(c)全部SEQIDNO:7-9,(d)全部SEQIDNO:10-12,(e)全部SEQIDNO:1-6,或(f)全部SEQIDNO:7-12。本专利技术的再一实施方案提供了包括至少一种本专利技术多肽的分离或纯化的蛋白。本专利技术的实施方案还提供了与本专利技术的TCR、多肽及蛋白相关的核酸、重组表达载体、宿主细胞、细胞群体及药物组合物。本专利技术的实施方案还提供了检测哺乳动物中癌症存在的方法及治疗或预防哺乳动物中癌症的方法。附图中几个视图的简要说明图1描绘说明通过流式细胞术检测针对同种型(对照)染色的细胞或针对PD-1和/或OX40表达染色的细胞的实验数据(点图)。直方图中的数值代表表达PD-1的细胞的百分比。图2是展示干扰素γ(IFNg)阳性斑点数/孔的图形,其是在将效应自体T细胞的汇集培养物(培养物编号W1-W16)与用指示的25-mer肽的池(PP)或由涵盖各种肿瘤特异性突变的25-mer串联小基因(TMG)所编码的肽的池脉冲的靶DC共培养时所检测的。单独培养的、与二甲基亚砜(DMSO)或OKT3抗体一起培养的自体T细胞用作对照。加框符号(▼)指示分离TCR的汇集培养物(7及8)。图3是展示IFNγ阳性斑点数/2×104(2E4)个细胞的图形,其是在将培养物编号7(W7)的自体T细胞与用来自肽池1(PP1)的肽1-17(P1-P17)中的每一种脉冲的自体DC共培养时所检测的。与二甲基亚砜(DMSO)或OKT3抗体一起培养的自体T细胞用作对照。图4是展示在HLA-封闭抗体W6/32(抗HLA-A、-B、-C)、IVA12(泛特异性,抗HLAII类)、B7/21(抗HLA-DP)、HB55(抗HLA-DR)或SPV-L3(HLA-DQ)(靶细胞)存在下与用KRASG12V肽(1ng/mL)脉冲的靶自体APC共培养后,经实施例2中表达4-1BB的TCR转导的效应T细胞的百分比的图形。单独培养的、与DMSO或佛波醇肉豆蔻酸乙酸酯(PMA)一起培养的效应转导细胞用作对照。经与靶自体APC(用1ng/mLKRASG12V肽脉冲的)一起共培养的空载体(模拟)转导的效应细胞用作再一对照。图5是展示以下结果的图形:(i)通过ELISPOT测量的IFN-γ数/2×104个细胞;及(ii)通过流式细胞术测量的mTCRβ+CD8+4-1BB+细胞的百分比,其皆是在将经实施例2的TCR转导的T细胞与自体APC(4148MB)或来自具有DRB101:01或DRB107:01单倍型的供体且用KRASG12V肽或WTKRAS肽脉冲的APC共培养时所测量的。将效应细胞与来自HLA-DRB1阳性供体(“DRB错配”)的APC(作为对照)共培养。单独培养的、与DMSO或佛波醇肉豆蔻酸乙酸酯-离子霉素(PMA:Iono)一起培养的效应细胞用作其他对照。图6是展示以下结果的图形:(i)通过ELISPOT测量的IFN-γ数/2×104个细胞(影线条);及(ii)通过流式细胞术测量的表达4-1BB和/或OX40的细胞的百分比(黑条),其皆是在将经实施例2的TCR转导的T细胞与用表达下列KRASG12突变之一的肿瘤细胞系的细胞裂解物脉冲的自体DC共培养时所测量的:G12R、G12C、G12D或G12V。与用表达WTKRAS的肿瘤细胞系的细胞裂解物脉冲的自体DC共培养的转导细胞用作对照。单独培养或与PMA或DMSO一起培养的转导细胞用作其他对照。图7是展示通过流式细胞术测量的mTCRβ+CD8+4-1BB+细胞的百分比的图形,其是在将经实施例2的TCR转导的T细胞与用指示浓度的KRASG12V肽(三角形)或WTKRAS肽(正方形)脉冲的自体DC过夜共培养时所测量的。图8是展示通过ELISPOT所测量的IFN-γ数/2×104个细胞的图形,其是在将经实施例2的TCR转导的T细胞与用指示浓度的表9中的肽脉冲的自体DC共培养时所测量的。图9描绘说明表达鼠类TCRβ链及4-1BB的细胞的百分比的实验数据(点图),其是在将经编码KRASG12CTCR的MSGV-1-逆转录病毒转导的细胞与DMSO(对照)或在指示浓度下加载指示WTKRAS或KRASG12C肽的DC共培养时所测定。点图指示以下细胞的百分比:mTCRβ+/4-1BB-(左上象限(Q1));mTCRβ+/4-1BB+(右上象限(Q2));mTCRβ-/4-1BB+(右下象限(Q3));mTCRβ-/4-1BB-(左下象限(Q4)),且展示如下(括号中的百分比):DMSO:Q1(71.0),Q2(0.96),Q3(0.20),Q4(27.9)。WT10μg/ml:Q1(64.5),Q2(4.27),Q3(0.43),Q4(30.8)。WT1μg/ml:Q1(70.6),Q2(1.13),Q3(0.20),Q4(28.1)。G12C10μg/ml:Q1(13.6),Q2(51.7),Q3(1.61),Q4(33.0)。G12C1μg/ml:Q1(19.7),Q2(46.9),Q3(1.67),Q4(31.7)。图10是展示表达CD3及4-1BB的细胞的百分比的图形,其是在使用针对HLA-DQ、DR、DP的抗体或针对本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.分离或纯化的T细胞受体(TCR),其中所述TCR对人类白细胞抗原(HLA)II类分子呈递的突变的人类RAS氨基酸序列具有抗原特异性,/n其中所述突变的人类RAS氨基酸序列是突变的人类Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)的氨基酸序列、突变的人类Harvey大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)的氨基酸序列、或突变的人类神经母细胞瘤大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(NRAS)的氨基酸序列。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170920 US 62/560,9301.分离或纯化的T细胞受体(TCR),其中所述TCR对人类白细胞抗原(HLA)II类分子呈递的突变的人类RAS氨基酸序列具有抗原特异性,
其中所述突变的人类RAS氨基酸序列是突变的人类Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)的氨基酸序列、突变的人类Harvey大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)的氨基酸序列、或突变的人类神经母细胞瘤大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(NRAS)的氨基酸序列。


2.如权利要求1所述的TCR,其中所述HLAII类分子是HLA-DR分子。


3.如权利要求1所述的TCR,其中所述HLAII类分子是HLA-DRB1分子。


4.如权利要求1所述的TCR,其中所述HLAII类分子是HLA-DRB1*07:01分子或HLA-DRB1*11:01分子。


5.如权利要求1至4中任一项所述的TCR,其中所述突变的人类RAS氨基酸序列包括取代位置12处甘氨酸的野生型人类KRAS、野生型人类HRAS或野生型人类NRAS氨基酸序列,其中位置12是通过分别参照所述野生型人类KRAS、野生型人类HRAS或野生型人类NRAS蛋白来限定的。


6.如权利要求5所述的TCR,其中所述取代是使用缬氨酸或半胱氨酸取代位置12处的甘氨酸。


7.如权利要求1至6中任一项所述的TCR,其包括以下氨基酸序列:
(a)全部SEQIDNO:1-3,
(b)全部SEQIDNO:4-6,
(c)全部SEQIDNO:7-9,
(d)全部SEQIDNO:10-12,
(e)全部SEQIDNO:1-6,或
(f)全部SEQIDNO:7-12。


8.如权利要求1至7中任一项所述的TCR,其包括以下氨基酸序列:
(i)SEQIDNO:13,
(ii)SEQIDNO:14,
(iii)SEQIDNO:15,
(iv)SEQIDNO:16,
(v)SEQIDNO:13-14二者,或
(vi)SEQIDNO:15-16二者。


9.如权利要求1至8中任一项所述的TCR,其还包括:
(a)α链恒定区,其包括SEQIDNO:30的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:30的位置48处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:30的位置112处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:30的位置114处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:30的位置115处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(b)β链恒定区,其包括SEQIDNO:31的氨基酸序列,其中SEQIDNO:31的位置57处的X是Ser或Cys;或
(c)(a)及(b)二者。


10.如权利要求1至9中任一项所述的分离或纯化的TCR,其包括:
(a)α链,其包括SEQIDNO:34的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:34的位置179处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:34的位置243处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:34的位置245处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:34的位置246处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(b)β链,其包括SEQIDNO:35的氨基酸序列,其中SEQIDNO:35的位置189处的X是Ser或Cys;
(c)α链,其包括SEQIDNO:36的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:36的位置180处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:36的位置244处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:36的位置246处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:36的位置247处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(d)β链,其包括SEQIDNO:37的氨基酸序列,其中SEQIDNO:37的位置194处的X是Ser或Cys;
(e)(a)及(b)二者;或
(f)(c)及(d)二者。


11.分离或纯化的多肽,其包含权利要求1至10中任一项所述的TCR的功能部分,其中所述功能部分包括以下氨基酸序列:
(a)全部SEQIDNO:1-3,
(b)全部SEQIDNO:4-6,
(c)全部SEQIDNO:7-9,
(d)全部SEQIDNO:10-12,
(e)全部SEQIDNO:1-6,或
(f)全部SEQIDNO:7-12。


12.如权利要求11所述的分离或纯化的多肽,其中所述功能部分包括以下氨基酸序列:
(i)SEQIDNO:13,
(ii)SEQIDNO:14,
(iii)SEQIDNO:15,
(iv)SEQIDNO:16,
(v)SEQIDNO:13-14二者,或
(vi)SEQIDNO:15-16二者。


13.如权利要求11或12所述的分离或纯化的多肽,其还包括:
(a)SEQIDNO:30的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:30的位置48处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:30的位置112处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:30的位置114处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:30的位置115处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(b)SEQIDNO:31的氨基酸序列,其中SEQIDNO:31的位置57处的X是Ser或Cys;或
(c)(a)及(b)二者。


14.如权利要求11-13中任一项所述的分离或纯化的多肽,其包括:
(a)SEQIDNO:34的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:34的位置179处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:34的位置243处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:34的位置245处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:34的位置246处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(b)SEQIDNO:35的氨基酸序列,其中SEQIDNO:35的位置189处的X是Ser或Cys;
(c)SEQIDNO:36的氨基酸序列,其中:
(i)SEQIDNO:36的位置180处的X是Thr或Cys;
(ii)SEQIDNO:36的位置244处的X是Ser、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(iii)SEQIDNO:36的位置246处的X是Met、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe或Trp;及
(iv)SEQIDNO:36的位置247处的X是Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Met或Trp;
(d)...

【专利技术属性】
技术研发人员:拉米·约瑟夫盖尔·卡弗里保罗·F·罗宾斯史蒂文·A·罗森伯格
申请(专利权)人:美国卫生和人力服务部
类型:发明
国别省市:美国;US

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