T细胞受体制造技术

技术编号:24132972 阅读:41 留言:0更新日期:2020-05-13 07:01
本发明专利技术涉及与来源于生殖系癌抗原PRAME的HLA‑A*02限制性肽SLLQHLIGL(SEQ ID NO:1)结合的T细胞受体(TCR)。相对于天然PRAME TCR,所述TCR可以包含α和/或β可变结构域内的非天然突变。本发明专利技术的TCR特别适合用作用于治疗恶性疾病的新型免疫治疗剂。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】T细胞受体
本专利技术涉及与来源于生殖系癌抗原PRAME的HLA-A*02限制性肽SLLQHLIGL(SEQIDNO:1)结合的T细胞受体(TCR)。相对于天然PRAMETCR,所述TCR可以包含α和/或β可变结构域内的非天然突变。本专利技术的TCR特别适合用作用于治疗恶性疾病的新型免疫治疗剂。
技术介绍
T细胞受体(Tcellreceptor,TCR)由CD4+和CD8+T细胞天然表达。TCR被设计为识别在抗原呈递细胞表面上展示的与主要组织相容性复合物(MajorHistocompatibilityComplex,MHC)分子(在人中,MHC分子也被称为人白细胞抗原或HLA)复合的短肽抗原(Davisetal.,AnnuRevImmunol.1998;16:523-44)。CD8+T细胞也称为细胞毒性T细胞,其具有特异性识别结合至MHCI类分子的肽的TCR。CD8+T细胞通常负责发现和介导病变细胞的破坏,包括癌细胞和病毒感染的细胞。由于胸腺选择,天然库中的癌症特异性TCR对相应抗原的亲和性通常较低,这意味着癌细胞经常逃避检测和破坏。旨在促进T细胞识别癌症的新型免疫治疗方法,为开发有效的抗癌疗法提供了非常有前景的策略。最初黑色素瘤中的PRAME或优先表达的抗原被鉴定为在黑色素瘤中过度表达的抗原(Ikedaetal.,Immunity.1997Feb;6(2):199-208);这种抗原也被称为CT130、MAPE、OIP-4,并且这种抗原的Uniprot登录号为P78395。该蛋白作为维甲酸受体信号转导的阻抑物起作用(Eppingetal.,Cell.2005Sep23;122(6):835-47)。PRAME属于被称为睾丸癌抗原的生殖系编码抗原家族。睾丸癌抗原是免疫治疗干预的有吸引力的靶标,因为它们通常在正常成人组织中表达受限或不表达。PRAME在许多实体瘤以及白血病和淋巴瘤中表达(DoolanetalBreastCancerResTreat.2008May;109(2):359-65;EppingetalCancerRes.2006Nov15;66(22):10639-42;ErcolaketalBreastCancerResTreat.2008May;109(2):359-65;MatsushitaetalLeukLymphoma.2003Mar;44(3):439-44;MitsuhashietalInt.JHematol.2014;100(1):88-95;Proto-SequeireetalLeukRes.2006Nov;30(11):1333-9;SzczepanskietalOralOncol.2013Feb;49(2):144-51;VanBarenetalBrJHaematol.1998Sep;102(5):1376-9)。本专利技术的PRAME靶向疗法可能特别适合于治疗癌症,包括但不限于:肺癌(NSCLC和SCLC)、乳腺癌(包括三阴性)、卵巢癌、子宫内膜癌、食道癌、膀胱癌以及头颈癌。肽SLLQHLIGL(SEQIDNO:1)对应于全长PRAME蛋白的第425-433位氨基酸,并与HLA-A*02复合存在于细胞表面(Kessleretal.,JExpMed.2001Jan1;193(1):73-88)。该肽-HLA复合物为基于TCR的免疫治疗干预提供了有用的靶标。以高亲和力和高特异性结合至SLLQHLIGL(SEQIDNO:1)HLA-A*02复合物的特定TCR序列的鉴定,对于开发新的免疫疗法是有利的。例如,治疗性TCR可用作可溶性靶向剂,用于将细胞毒性剂递送至肿瘤部位或激活针对肿瘤细胞的免疫效应子功能的目的(Lissin,etal.,“High-AffinityMonocloncalT-cellreceptor(mTCR)Fusions”inFusionProteinTechnologiesforBiophamaceuticals:ApplicationsandChallenges.2013.S.R.Schmidt,Wiley;Boulteretal.,ProteinEng.2003Sep;16(9):707-11;Liddy,etal.,NatMed.2012Jun;18(6):980-7),或者可选地,治疗性TCR可用于使T细胞工程化以进行过继性治疗(Fesnaketal.,NatRevCancer.2016Aug23;16(9):566-81)。先前已经报道了结合至与HLA-A*02复合的SLLQHLIGL(SEQIDNO:1)的TCR(Amiretal.,ClinCancerRes.2011Sep1;17(17):5615-25;Griffioenetal.,ClinCancerRes.2006May15;12(10):3130-6;WO2016142783)。但是,尚未对这些TCR进行工程化以使它们相对于天然TCR以增加的亲和力结合至靶抗原时。如下文进一步说明的,超生理抗原亲和力是治疗性TCR的期望特征,其产生并不简单,特别是当与其他期望特征(例如特异性)相平衡时。本申请定义的TCR序列参考IMGT命名法进行描述,该命名法对于TCR领域的技术人员而言广为人知并且可以获得。例如,参见:LeFrancandLeFranc,(2001).“TcellReceptorFactsbook”,AcademicPress;Lefranc,(2011),ColdSpringHarbProtoc2011(6):595-603;Lefranc,(2001),CurrProtocImmunolAppendix1:Appendix10O;andLefranc,(2003),Leukemia17(1):260-266。简而言之,αβTCR由两条以二硫键连接的链组成。通常认为每条链(α和β)具有两个结构域,即可变结构域和恒定结构域。短连接区连接可变结构域和恒定结构域,并且通常被认为是α可变区的一部分。另外,β链通常包含在连接区旁的短的多样性区,该多样性区通常也被认为是β可变区的一部分。每条链的可变结构域位于N端,并包含嵌入框架序列(Frameworksequence,FR)的三个互补决定区(ComplementarityDeterminingRegion,CDR)。CDR包含肽-MHC结合的识别位点。存在若干个编码α链可变(Vα)区的基因和若干个编码β链可变(Vβ)区的基因,其区别在于它们的构架、CDR1和CDR2序列,以及部分定义的CDR3序列。在IMGT命名法中,Vα和Vβ基因分别用前缀“TRAV”和“TRBV”来表示(FolchandLefranc,(2000),ExpClinImmunogenet17(1):42-54;ScavinerandLefranc,(2000),ExpClinImmunogenet17(2):83-96;LeFrancandLeFranc,(2001),“TcellReceptorFactsbook”,AcademicPress)。同样地,α链和β链各有若干连接基因或J本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种T细胞受体(TCR),所述T细胞受体(TCR)具有结合至SLLQHLIGL(SEQ ID NO:1)HLA-A*02复合物的性质并且包含TCRα链可变结构域和/或TCRβ链可变结构域,所述TCRα链可变结构域和/或所述TCRβ链可变结构域中的每个包含FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,其中FR为构架区,并且CDR为互补决定区,其中/n(a)所述α链CDR具有以下序列:/nCDR1–TISGTDY(SEQ ID NO:39)/nCDR2–GLTSN(SEQ ID NO:40)/nCDR3–CILILGHSGAGSYQLTF(SEQ ID NO:41)/n其中任选地有一个或多个突变,/n和/或/n(b)所述β链CDR具有以下序列:/nCDR1–LNHDA(SEQ ID NO:42)/nCDR2–SQIVNDF(SEQ ID NO:43)/nCDR3–CASSPWTSGSREQYF(SEQ ID NO:44)/n其中任选地有一个或多个突变。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170620 GB 1709866.61.一种T细胞受体(TCR),所述T细胞受体(TCR)具有结合至SLLQHLIGL(SEQIDNO:1)HLA-A*02复合物的性质并且包含TCRα链可变结构域和/或TCRβ链可变结构域,所述TCRα链可变结构域和/或所述TCRβ链可变结构域中的每个包含FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4,其中FR为构架区,并且CDR为互补决定区,其中
(a)所述α链CDR具有以下序列:
CDR1–TISGTDY(SEQIDNO:39)
CDR2–GLTSN(SEQIDNO:40)
CDR3–CILILGHSGAGSYQLTF(SEQIDNO:41)
其中任选地有一个或多个突变,
和/或
(b)所述β链CDR具有以下序列:
CDR1–LNHDA(SEQIDNO:42)
CDR2–SQIVNDF(SEQIDNO:43)
CDR3–CASSPWTSGSREQYF(SEQIDNO:44)
其中任选地有一个或多个突变。


2.根据权利要求1所述的TCR,其特征在于,所述α链可变结构域构架区包含以下序列:
FR1–SEQIDNO:2的第1-25位氨基酸
FR2–SEQIDNO:2的第33-49位氨基酸
FR3–SEQIDNO:2的第55-87位氨基酸
FR4–SEQIDNO:2的第105-114位氨基酸
或与所述序列具有至少90%同一性的各序列,和/或
所述β链可变结构域构架区包含以下序列:
FR1-SEQIDNO:3的第1-26位氨基酸
FR2-SEQIDNO:3的第32-48位氨基酸
FR3-SEQIDNO:3的第56-90位氨基酸
FR4-SEQIDNO:3的第106-114位氨基酸
或与所述序列具有至少90%同一性的各序列。


3.根据权利要求1或权利要求2所述的TCR,其特征在于,所述α链CDR中的所述突变中的一个或多个选自(按照SEQIDNO:2的编号):








野生型
突变


G96(CDR3)
R


A97(CDR3)
L


S99(CDR3)
N


Q101(CDR3)
I


L102(CDR3)
A









4.根据权利要求3所述的TCR,其特征在于,所述α链CDR中存在1、2、3、4或5个突变,并且所述1、2、3、4或5个突变选自(按照SEQIDNO:2的编号):








野生型
突变


G96(CDR3)
R


A97(CDR3)
L


S99(CDR3)
N


Q101(CDR3)
I


L102(CDR3)
A









5.根据权利要求4所述的TCR,其特征在于,所述α链CDR具有以下突变组之一(按照SEQIDNO:2的编号):












1
G96R

S99N
Q101I
L102A


2
G96R
A97L
S99N
Q101I
L102A


3
G96R
A97L
S99N

L102A









6.根据权利要求4或权利要求5所述的TCR,其特征在于,所述α链CDR3具有选自以下的序列:







CILILGHSRAGNYIATF(SEQIDNO:45)


CILILGHSRLGNYIATF(SEQIDNO:46)


CILILGHSRLGNYQATF(SEQIDNO:47)









7.根据前述任一权利要求所述的TCR,其特征在于,所述β链CDR中的所述突变中的一个或多个选自(按照SEQIDNO:3的编号):








野生型
突变


V52(CDR2)
M


N53(CDR2)
G


F55(CDR2)
E


P95(CDR3)
W


S98(CDR3)
G


S100(CDR3)
A


R101(CDR3)
S或A


E102(CDR3)
P


Q103(CDR3)
I


Y104(CDR3)
S或R









8.根据权利要求7所述的TCR,其特征在于,所述β链CDR中存在1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个突变,并且所述1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个突变选自(按照SEQIDNO:3的编号):








野生型
突变


V52(CDR2)
M


N53(CDR2)
G


F55(CDR2)
E


P95(CDR3)
W


S98(CDR3)
G


S100(CDR3)
A


R101(CDR3)
S或A


E102(CDR3)
P


Q103(CDR3)
I


Y104(CDR3)
S或R









9.根据权利要求8所述的TCR,其特征在于,所述β链CDR具有以下突变组之一(按照SEQIDNO:3的编号):

















1
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G
S100A
R101S
E102P
Q103I
Y104S


2
V52M
N53G
F55E
P95W

S100A
R101S
E102P
Q103I
Y104S


3
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101A
E102P
Q103I
Y104R


4
V52M

F55E
P95W
S98G

R101A
E102P
Q103I
Y104R


5
V52M
N53G
F55E
P95W


R101A
E102P
Q103I
Y104R


6
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101A

Q103I
Y104R


7
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101A
E102P
Q103I



8
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G
S100A
R101A
E102P
Q103I
Y104S


9
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G
S100A
R101S
E102P
Q103I
Y104R


10
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G
S100A
R101A
E102P
Q103I
Y104R


11
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G
S100A
R101S

Q103I
Y104S


12
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101A
E102P
Q103I
Y104S


13
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101S
E102P
Q103I
Y104S


14

N53G
F55E
P95W
S98G

R101A
E102P
Q103I
Y104R


15
V52M
N53G
F55E

S98G

R101A
E102P
Q103I
Y104R


16
V52M
N53G
F55E
P95W
S98G

R101S
E102P
Q103I
Y104R









10.根据权利要求8或权利要求9所述的TCR,其特征在于,所述β链CDR2具有选自以下的序列:







SQIMGDE(SEQIDNO:48)


SQIMNDE(SEQIDNO:49)


SQIVGDE(SEQIDNO:50)









11.根据权利要求8、9或10所述的TCR,其特征在于,所述β链CDR3具有选自以下的序列:

【专利技术属性】
技术研发人员:菲利普·威廉·阿迪斯尼可·乔伊·贝德克露西·宝德斯蒂芬·哈珀纳撒尼尔·利迪塔拉·马洪罗南·帕德里克·奥德怀尔
申请(专利权)人:英美偌科有限公司
类型:发明
国别省市:英国;GB

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