一种用于早期乳腺癌诊断的生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种用于早期乳腺癌诊断的生物标志物，所述生物标志物为LINC01929，本发明专利技术通过检测在I‑II期的乳腺癌的组织样本及癌旁组织，发现了LINC01929在癌组织中的表达水平显著上调，提示LINC01929可应用早期乳腺癌的诊断和治疗。

A biomarker for the diagnosis of early breast cancer

【技术实现步骤摘要】
一种用于早期乳腺癌诊断的生物标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及一种用于早期乳腺癌诊断的生物标志物，具体的所述生物标志物为LINC01929。
技术介绍
乳腺癌(breastcancer)是女性最普遍的恶性肿瘤之一，通常发生在乳腺上皮组织。据资料统计，乳腺癌的发病率占全身各种恶性肿瘤的7-10％(Darabi,Hetal.Breastcancerriskpredictionandindividualisedscreeningbasedoncommongeneticvariationandbreastdensitymeasurement.BreastCancerRes,2012.14(1):p.R25.)。全球每年有135万新增加的乳腺癌，其中有42万死亡，每年递增是2％(Wen,W.,etal.,PredictionofbreastcancerriskbasedoncommongeneticvariantsinwomenofEastAsianancestry.BreastCancerRes,2016.18(1):p.124.)。中国每年有4万多妇女死于本病，虽然不是乳腺癌高发国家，但是其增长速度远远高于其他国家。它的发病影响因素较多，遗传易感性和基因与环境相互作用均与其发生、进展和转移密切相关(Mavaddat,Netal.,Predictionofbreastcancerriskbasedonprofilingwithcommongeneticvariants.JNatlCancerInst,2015.107(5).)。虽然通过之前的研究已经发现了多种致癌基因和抑癌基因，使乳腺癌的诊断率有所提高，治疗效果有所改善，但并不能完全解决问题。因此需要对肿瘤发生的分子机制深入了解，为乳腺癌患者的治疗提供新的有效的治疗方法。在没有完全找到乳腺癌的发病原因之前，乳腺癌的早诊断、早治疗，是降低乳腺癌死亡率的关键。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，lncRNAs)是一类缺乏蛋白编码功能的核苷酸转录本，包含200至100000核苷酸，具有高度保守的序列元件和特定的空间二级结构，存在于细胞核或胞浆内(Hajjari,M.,A.Khoshnevisan,andYK.Shin,Molecularfunctionandregulationoflongnon-codingRNAs:paradigmswithpotentialrolesincancer.TumourBiol,2014.35(11):p.10645-63.)。LncRNAs在表观遗传调控、选择性剪接、RNA衰变、细胞分化、细胞周期控制及癌细胞转移和耐药性等细胞调控过程中发挥着重要的作用(Richtig,G.,etal.,FunctionandClinicalImplicationsofLongNon-CodingRNAsinMelanoma.IntJMolSci,2017.18(4).)。随着对lncRNAs研究的深入，越来越多的证据表明lncRNAs参与各种生物过程和疾病发病机理，尤其是肿瘤发生，在多种人类肿瘤中，lncRNAs都普遍存在着差异表达的现象。到目前为止，lncRNAs在肿瘤方面已取得了不小的进展，如HOTAIR和GWS5，已经分别被确定为致癌基因和抑癌因子。然而，lncRNAs的数量十分庞大，只有少数与癌症相关的lncRNAs被报道出来，且针对lncRNAs在乳腺癌中的研究仍处于起步阶段。因此，那些对乳腺癌发生和发展至关重要的新型的lncRNAs还有待被研究者们不断发现及探索。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种与乳腺癌相关的lncRNA标志物，将其应用到临床中，从而实现乳腺癌的早期诊断和治疗，进行有效干预，提高患者的生存率和生存质量。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了LINC01929的应用，用于制备诊断早期乳腺癌的产品。进一步，所述产品包括检测样本中LINC01929表达水平的试剂。进一步，所述试剂包括通过反转录PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片技术检测LINC01929表达水平的试剂。本专利技术提供了一种诊断乳腺癌的产品，包括芯片或试剂盒，其中，所述芯片或试剂盒包括检测LINC01929表达水平的试剂。进一步，所述芯片中检测LINC01929表达水平的试剂包括特异性识别LINC01929基因的探针；所述试剂盒中检测LINC01929表达水平的试剂包括特异性扩增LINC01929基因的引物或特异性识别LINC01929基因的探针。进一步，特异性扩增LINC01929基因的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。在本专利技术中，试剂盒还包括容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂，以及附有试剂盒的使用说明书，其中记载了如何采用试剂盒进行检测，和如何利用检测结果对肿瘤发展进行判断、对治疗方案进行选择。本专利技术提供了LINC01929在构建预测早期乳腺癌的计算模型中的应用。正如熟练技术人员知道的，可以以不同方式实施和实现将标志物水平与某种可能性或风险关联起来的步骤。优选地，在数学上组合标志物和一种或多种其它标志物的测定浓度，并将组合值与根本的诊断问题关联起来。可以通过任何适宜的现有技术数学方法将标志物值的测定组合。优选地，在标志物组合中应用的数学算法是一种对数函数。优选地，应用此类数学算法或此类对数函数的结果是单一值。根据根本的诊断问题，能容易地将此类值与例如个体关于乳腺癌的风险或与有助于评估早期乳腺癌患者的其它有意诊断用途关联起来。以一种优选的方式，此类对数函数是如下获得的：a)将个体分类入组，例如正常人、有乳腺癌风险的个体、具有乳腺癌的患者等等，b)通过单变量分析来鉴定在这些组之间差异显著的标志物，c)对数回归分析以评估标志物的可用于评估这些不同组的独立差别值，并d)构建对数函数来组合独立差别值。在这种类型的分析中，标志物不再是独立的，而是代表一个标志物组合。用于将标志物组合与疾病关联起来的对数函数优选采用通过应用统计方法开发和获得的算法。例如，适宜的统计方法是判别分析(DA)(即线性、二次、规则DA)、Kernel方法(即SVM)、非参数方法(即k-最近邻居分类器)、PLS(部分最小二乘)、基于树的方法(即逻辑回归、CART、随机森林方法、助推/装袋方法)、广义线性模型(即对数回归)、基于主分量的方法(即SIMCA)、广义叠加模型、基于模糊逻辑的方法、基于神经网络和遗传算法的方法。熟练技术人员在选择适宜的统计方法来评估本专利技术的标志物组合并由此获得适宜的数学算法方面不会有问题。在一个实施方案中，用于获得评估乳腺癌中使用的数学算法的统计方法选自DA(即线性、二次、规则判别分析)、Kernel方法(即SVM)、非参数方法(即k-最近邻居分类器)、PLS(部分最小二乘)、基于树的方法(即逻辑回归、CART、随机森林方法、助推方法)、或广义线性模型(即对数回归)。本专利技术提供了LINC01929本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.LINC01929的应用，其特征在于，用于制备诊断早期乳腺癌的产品。/n

【技术特征摘要】
20190220 CN 20191012613211.LINC01929的应用，其特征在于，用于制备诊断早期乳腺癌的产品。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括检测样本中LINC01929表达水平的试剂。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过反转录PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片技术检测LINC01929表达水平的试剂。


4.一种诊断早期乳腺癌的产品，其特征在于，包括芯片或试剂盒，其中，所述芯片或试剂盒包括检测LINC01929表达水平的试剂。


5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述芯片中检测LINC01929表达水平...

【专利技术属性】
技术研发人员：罗忠兵，
申请(专利权)人：赣南医学院第一附属医院，
类型：发明
国别省市：江西;36