一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法技术

本发明专利技术提供一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，包括如下步骤：（1）输入待进行二硫键预测的蛋白质序列信息，使用SWISS‑MODEL服务器获取目的蛋白质的结构信息；（2）把所有与目的蛋白相关的结构列出，选择与其序列类似度最高的蛋白结构作为目的蛋白结构；（3）围绕目的蛋白结构，列出所有半胱氨酸的硫原子的空间位置坐标；（4）根据距离临界值判断标准预测某一对半胱氨酸侧链硫原子之间是否形成二硫键，并把目的蛋白结构中所有形成二硫键的半胱氨酸对列出，包括其侧链硫原子间距。本发明专利技术直接从二硫键的化学定义出发，提供一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，其准确性与测定蛋白质空间结构的实验方法的准确性完全一致。

【技术实现步骤摘要】
一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法
本专利技术涉及生物信息学、结构生物学与计算机应用领域，具体涉及一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法。
技术介绍
二硫键是在相同或不同蛋白质多肽链上的两个半胱氨酸残基之间形成的稳定共价键，对蛋白质的正确折叠和结构稳定性起重要作用。因此，精确地预测蛋白质结构中的二硫键，有助于深入研究蛋白质结构及分子动力学属性、揭示其构象关系、注释蛋白质功能，具有重要的生物学意义。文献查询表明：一系列用于预测蛋白质二硫键的方法已被提出，如：1、DISULFIND:adisulfidebondingstateandcysteineconnectivitypredictionserver（一个二硫键连接状态和半胱氨酸连接预测服务器），于2006年出版于NucleicAcidResearch.2、DisulfideConnectivityPredictionBasedonModelledProtein3DStructuralInformationandRandomForestRegression（基于蛋白三维结构建本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，其特征在于，包括如下步骤：/n（1）输入待进行二硫键预测的蛋白质序列信息，使用SWISS-MODEL服务器获取目的蛋白质的结构信息；/n（2）把所有与目的蛋白相关的结构列出，选择与其序列类似度最高的蛋白结构作为目的蛋白结构；/n（3）围绕目的蛋白结构，列出所有半胱氨酸的硫原子的空间位置坐标；/n（4）根据距离临界值判断标准预测某一对半胱氨酸侧链硫原子之间是否形成二硫键，并把目的蛋白结构中所有形成二硫键的半胱氨酸对列出，包括其侧链硫原子间距。/n

【技术特征摘要】
1.一种基于蛋白质空间结构的二硫键预测方法，其特征在于，包括如下步骤：
（1）输入待进行二硫键预测的蛋白质序列信息，使用SWISS-MODEL服务器获取目的蛋白质的结构信息；
（2）把所有与目的蛋白相关的结构列出，选择与其序列类似度最高的蛋白结构作为目的蛋白结构；
（3）围绕目的蛋白结构，列出所有半胱氨酸的硫原子的空间位置坐标；
（4）根据距离临界值判断标准预测某一对半胱氨酸侧链...

【专利技术属性】
技术研发人员：李炜，
申请(专利权)人：南通大学，
类型：发明
国别省市：江苏;32