【技术实现步骤摘要】
一种高通量测序文库的测序质检方法
本申请涉及高通量测序
,特别是涉及一种高通量测序文库的测序质检方法。
技术介绍
高通量测序文库(NGS文库)的质量对于高通量测序(NGS)产出的数据质量至关重要。因此,NGS文库在进行测序之前,通常要对其进行测序质检,主要是评估其浓度或分子数,以选择适合于测序平台的NGS文库浓度进行测序。在NGS文库进行测序质检时,低估NGS文库的浓度,会导致上机测序簇生成时模板太多,最终得到的测序数据质量不高。但是,高估文库的浓度,也会有问题,例如,会导致上机测序簇生成时模板量不足,最终获得的测序数据总量过低;同时由于过高的Dup(%)值也会导致有效分析数据量偏低。因此低估或者是高估NGS文库浓度都会影响测序数据结果。目前,NGS文库的测序质检方法,即NGS文库浓度检测,有多种方案;其中QPCR的方法因其能够特异性的定量检测双端接头完整文库的分子数,检测灵敏度高,可以检测较低浓度的样本,被认为是NGS文库定量的金标准。然而,NGS文库的QPCR检测也有其比较大的弊端,例如,耗时费力、 ...
【技术保护点】
1.一种高通量测序文库的测序质检方法,其特征在于:包括以下步骤,/n(1)对待测高通量测序文库的质量浓度进行检测,标记为X,单位为ng/μL;/n(2)对所述待测高通量测序文库的片段平均长度进行检测,标记为N,单位为bp;/n(3)根据步骤(1)和步骤(2)的检测结果,采用公式一计算所述待测高通量测序文库的摩尔浓度,标记为C,单位为nmol/L;/n公式一:C=(X×10
【技术特征摘要】
1.一种高通量测序文库的测序质检方法,其特征在于:包括以下步骤,
(1)对待测高通量测序文库的质量浓度进行检测,标记为X,单位为ng/μL;
(2)对所述待测高通量测序文库的片段平均长度进行检测,标记为N,单位为bp;
(3)根据步骤(1)和步骤(2)的检测结果,采用公式一计算所述待测高通量测序文库的摩尔浓度,标记为C,单位为nmol/L;
公式一:C=(X×106)/(N×660)
根据...
【专利技术属性】
技术研发人员:许明炎,张晓妮,杨庆,
申请(专利权)人:深圳市海普洛斯生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:广东;44
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