蛋白质抗原及其用途制造技术

本发明专利技术的领域涉及免疫治疗肽、肽结合剂以及它们在例如癌症免疫治疗中的用途。

Protein antigen and its application

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】蛋白质抗原及其用途交叉引用本申请要求2017年4月3日提交的第62/480,593号美国临时申请、2017年4月3日提交的第62/480,596号美国临时申请和2017年4月3日提交的第62/480,597号美国临时申请的优先权，这些临时申请各自通过引用整体并入本文。
本专利技术的领域涉及免疫治疗肽、编码该肽的核酸、肽结合剂以及它们在例如癌症免疫治疗中的用途。在一个方面，本专利技术提供了在癌细胞中表达的非突变蛋白质表位，其可单独使用或与其它肿瘤相关肽、抗癌剂或免疫调节剂联合使用以治疗癌症。
技术介绍
肿瘤疫苗通常由肿瘤抗原和免疫刺激分子(例如佐剂、细胞因子或TLR配体)组成，它们共同作用以诱导识别并裂解肿瘤细胞的抗原特异性细胞毒性T细胞(CTL)。这类疫苗含有共有的组织限制性肿瘤抗原或完整肿瘤细胞制品形式的共有抗原和患者特异性抗原的混合物。共有的组织限制性肿瘤抗原是在许多个体的肿瘤中具有选择性表达的理想的免疫原性蛋白质，并且通常作为合成肽或重组蛋白递送给患者。相比之下，完整肿瘤细胞制品作为自体辐照的细胞、细胞裂解物、细胞融合物、热休克蛋白制品或总mRNA递送给患者。由于完整肿瘤细胞是从自体患者中分离的，因此该细胞可以包括患者特异性肿瘤抗原以及共有的肿瘤抗原。最后，还有第三类肿瘤抗原——新抗原，其由具有导致氨基酸序列改变的肿瘤特异性突变(可以是患者特异性的或共有的)的蛋白质组成。因此，仍然需要开发另外的癌症治疗剂。
技术实现思路
本文提供了分离的抗原肽，其包含来自表1或表2中的序列的表位。本公开还涉及长度为100个或更少氨基酸的分离的抗原肽，其包含来自表1或表2中的序列的表位。本公开还涉及分离的抗原肽，其包含来自表3或表4中的序列的表位。本公开还涉及长度为100个或更少氨基酸的分离的抗原肽，其包含来自表3或表4中的序列的表位。本公开还涉及分离的抗原肽，其包含来自表5或表6中的序列的表位。本公开还涉及长度为100个或更少氨基酸的分离的抗原肽，其包含来自表5或表6中的序列的表位。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽是逆转录病毒抗原。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽是非突变的过表达的抗原。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽是病毒抗原。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约5至约50个氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约15至约35个氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约15个或更少的氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约8至约11个氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为9或10个氨基酸。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽结合主要组织相容性复合体(MHC)I类。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽以小于约500nM的结合亲和力结合MHCI类。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约30个或更少的氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约6至约25个氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约15至约24个氨基酸。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽的长度为约9至约15个氨基酸。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽结合MHCII类。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽以小于约1000nM的结合亲和力结合MHCII类。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽进一步包含侧翼氨基酸。在另一个实施方案中，该侧翼氨基酸不是天然的侧翼氨基酸。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽与至少第二抗原肽连接。在另一个实施方案中，所述肽使用聚甘氨酸或聚丝氨酸连接体连接。在另一个实施方案中，所述第二抗原肽以小于约1000nM的结合亲和力结合MHCI类或II类。在另一个实施方案中，所述第二抗原肽以小于约500nM的结合亲和力结合MHCI类或II类。在另一个实施方案中，这两种表位均与人白细胞抗原(HLA)-A、-B、-C、-DP、-DQ或-DR结合。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽结合I类HLA，并且所述第二抗原肽结合II类HLA。在另一个实施方案中，所述分离的抗原肽结合II类HLA，并且所述第二抗原肽结合I类HLA。在一个实施方案中，所述分离的抗原肽进一步包含增加体内半衰期、细胞靶向、抗原摄取、抗原加工、MHC亲和力、MHC稳定性或抗原呈递的修饰。在另一个实施方案中，所述修饰是与载体蛋白缀合、与配体缀合、与抗体缀合、PEG化、多唾液酸化、HES化、重组PEG模拟物、Fc融合、白蛋白融合、纳米颗粒附着、纳米颗粒包封、胆固醇融合、铁融合、酰化、酰胺化、糖基化、侧链氧化、磷酸化、生物素化、添加表面活性材料、添加氨基酸模拟物或添加非天然氨基酸。在一个实施方案中，所靶向的细胞是抗原呈递细胞。在另一个实施方案中，所述抗原呈递细胞是树突细胞。在另一个实施方案中，使用DEC205、XCR1、CD197、CD80、CD86、CD123、CD209、CD273、CD283、CD289、CD184、CD85h、CD85j、CD85k、CD85d、CD85g、CD85a、CD141、CD11c、CD83、TSLP受体或CD1a标志物来靶向所述树突细胞。在另一个实施方案中，使用CD141、DEC205或XCR1标志物来靶向所述树突细胞。在一个实施方案中，本文提供了一种体内递送系统，其包含本文所述的分离的抗原肽。在另一个实施方案中，所述递送系统包括细胞穿透肽、纳米颗粒包封、病毒样颗粒或脂质体。在另一个实施方案中，所述细胞穿透肽是TAT肽、单纯疱疹病毒VP22、转运蛋白(transportan)或Antp。在一个实施方案中，本文提供了一种细胞，其包含本文所述的分离的抗原肽。在另一个实施方案中，所述细胞是抗原呈递细胞。在另一个实施方案中，所述细胞是树突细胞。在一个实施方案中，本文提供了一种组合物，其包含本文所述的分离的抗原肽。在另一个实施方案中，所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少28、至少29或至少30种分离的抗原肽，所述抗原肽包含表1或表2中限定的肿瘤特异性表位。在另一个实施方案中，所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少28、至少29或至少30种分离的抗原肽，所述抗原肽包含表3或表4中限定的肿瘤特异性表位。在另一个实施方案中，所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种免疫原性疫苗组合物，其包含肽，该肽包含表1-6任一个中的序列的至少8个连续氨基酸。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170403 US 62/480,593;20170403 US 62/480,596;20171.一种免疫原性疫苗组合物，其包含肽，该肽包含表1-6任一个中的序列的至少8个连续氨基酸。


2.根据权利要求1所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽是合成肽。


3.根据权利要求1所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽是重组肽。


4.根据权利要求1所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含来自内源性逆转录病毒蛋白的序列。


5.根据权利要求1所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含来自外源性病毒蛋白的序列。


6.根据权利要求1所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含由患有癌症的受试者的癌细胞表达的蛋白质的序列，其中所述蛋白质被所述癌细胞表达的水平高于被所述受试者的非癌细胞表达的水平。


7.根据权利要求1-6中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽的长度为100个或更少的氨基酸。


8.根据权利要求1-7中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽的长度为约5至约50个氨基酸或者长度为约15至约35个氨基酸。


9.根据权利要求1-8中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽的长度为约30个或更少的氨基酸，或者长度为约15个或更少的氨基酸。


10.根据权利要求1-9中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含以小于约500nM的结合亲和力结合主要组织相容性复合体(MHC)I类的序列。


11.根据权利要求1-9中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含以小于约1000nM的结合亲和力结合主要组织相容性复合体(MHC)II类的序列。


12.根据权利要求1-11中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽进一步包含在所述至少8个连续氨基酸侧翼的非天然氨基酸。


13.根据权利要求1-12中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述组合物进一步包含第二肽，所述第二肽包含表1-6任一个中的序列的至少8个连续氨基酸，其中所述第二抗原肽以小于约1000nM的结合亲和力结合MHCI类或II类。


14.根据权利要求13所述的免疫原性疫苗组合物，其中使用聚甘氨酸或聚丝氨酸连接体连接肽。


15.根据权利要求13或14所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述第二抗原肽以小于约1000nM或小于约500nM的结合亲和力结合MHCI类或II类。


16.根据权利要求1-15中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽进一步包含增加体内半衰期、细胞靶向、抗原摄取、抗原加工、MHC亲和力、MHC稳定性或抗原呈递的修饰。


17.根据权利要求16所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述修饰是与载体蛋白缀合、与配体缀合、与抗体缀合、PEG化、多唾液酸化、HES化、重组PEG模拟物、Fc融合、白蛋白融合、纳米颗粒附着、纳米颗粒包封、胆固醇融合、铁融合、酰化、酰胺化、糖基化、侧链氧化、磷酸化、生物素化、添加表面活性材料、添加氨基酸模拟物或添加非天然氨基酸。


18.根据权利要求16所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述肽包含增加抗原呈递细胞靶向的修饰。


19.根据权利要求18所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述抗原呈递细胞是树突细胞。


20.根据权利要求19所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述增加树突细胞靶向的修饰是DEC205、XCR1、CD197、CD80、CD86、CD123、CD209、CD273、CD283、CD289、CD184、CD85h、CD85j、CD85k、CD85d、CD85g、CD85a、CD141、CD11c、CD83、TSLP受体或CD1a标志物。


21.根据权利要求1-20中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述组合物包含至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24、至少25、至少26、至少27、至少28、至少29或至少30种肽，所述肽各自包含表1-6任一个中的序列的至少8个连续氨基酸。


22.根据权利要求1-20中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述组合物包含2至20种肽，所述肽各自包含表1-6任一个中的序列的至少8个连续氨基酸。


23.根据权利要求1-22中任一项所述的免疫原性疫苗组合物，其中所述组合物进一步包含至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25、至少26、至少27、至少28、至少29或至少30种附加抗原肽。


24.根据权利要求23所述的免疫原性疫苗组...

【专利技术属性】
技术研发人员：迈克尔·史蒂文·鲁尼，
申请(专利权)人：内恩疗法公司，
类型：发明
国别省市：美国;US