一株产灵菌红素类色素的菌株与灵菌红素类色素合成基因簇制造技术

本发明专利技术提供了一株产灵菌红素类色素的菌株与灵菌红素类色素合成基因簇，属于微生物技术领域。产灵菌红素类色素的菌株 S2‑4‑1HMB的分类命名为：

A strain producing rhodopsin pigment and its gene cluster

【技术实现步骤摘要】
一株产灵菌红素类色素的菌株与灵菌红素类色素合成基因簇
本专利技术属于微生物
，具体涉及一株产两种灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB与灵菌红素合成基因簇及应用。
技术介绍
灵菌红素类色素，是微生物产生的一类次级代谢物，其结构中具有3个吡咯环的甲氧基骨架结构。灵菌红素类色素因具有广泛的生物活性，比如抗细菌、抗真菌、抗病原虫、肿瘤抑制、杀藻、及纺织染料而备受关注。能产生灵菌红素的微生物，主要分布在Gamma变形菌纲（Gammaproteobacteria）细菌，Alpha变形菌纲细菌（Alphaproteobacteria）及放线菌（Actinomycetes）。比如Gamma变形菌纲中的弧菌Vibrioruber,假交替单胞菌Pseudoalteromonasrubra，Zooshikellaganghwensis，Z.rubidus，Z.marina,及Hahellachejuensis；Alpha变形菌纲的Pseudovibriodenitrifican；放线菌纲的放线菌Streptomycescoelicolor,Streptoverticilliumrubrireticuli，Saccharopolysporasp.等。其中，某些微生物能同时产生两种结构的灵菌红素，即直链形式与环化形式，比如，Z.rubidusS1-1能同时产生直链的灵菌红素（prodigiosin，C20H25N3O）及其环化形式的环化灵菌红素（cycloprodigiosin，C20H23N3O）；放线菌StreptomycescoelicolorA3(2)能同时产生直链形式的十一烷基灵菌红素（undecylprodigiosin，C25H35N3O）及环化十一烷基灵菌红素（streptorubinB，C25H33N3O）。本专利技术提供了一种新的海洋细菌菌株，该菌株能同时产生直链形式的庚基灵菌红素(heptylprodigiosin，C22H29N3O)与环化形式的环化庚基灵菌红素(cycloheptylprodigiosin，C22H27N3O)，并注释这两种红色素合成的基因簇。通过抑菌实验，显示直链形式的庚基灵菌红素与环化庚基灵菌红素均具有较好的抑菌效果，表明在医药研发上具有潜在医药应用价值。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB与灵菌红素类色素合成基因簇。该菌株能同时产生直链形式的庚基灵菌红素(heptylprodigiosin，C22H29N3O)与环化庚基灵菌红素(cycloheptylprodigiosin，C22H27N3O)，并从该菌株中获得包含15个已知功能基因组成的灵菌红素类色素合成基因簇，该菌株产生的这两种灵菌红素在药物研发中具有潜在应用价值。为实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB，该菌株的分类命名为：SpartinivicinusruberS2-4-1HMB（中文名为红色米草根际细菌S2-4-1HMB），该菌株保藏于广东省微生物菌种保藏中心，保藏编号：GDMCCNO:60932，保藏日期：2019年12月11日，保藏地址：中国广州市先烈中路100号大院59号楼5楼。上述一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB在制备直链形式的庚基灵菌红素(heptylprodigiosin)与环化庚基灵菌红素(cycloheptylprodigiosin)中的应用。一种由上述一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB产生的直链形式的庚基灵菌红素(heptylprodigiosin)与环化庚基灵菌红素(cycloheptylprodigiosin)。一种含由产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB产生的直链形式的庚基灵菌红素(heptylprodigiosin)与环化庚基灵菌红素(cycloheptylprodigiosin)的药物。一种来源于产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB的灵菌红素类色素合成基因簇，所述基因簇包含15个已知功能基因组成，所述基因分别为：（1）2285基因，核苷酸序列如SEQIDNO.2所示,长度为1272bp，编码黄素腺嘌呤二核苷酸/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸结合氧化还原酶(FAD/NAD(P)-bindingoxidoreductase)；（2）2290基因，核苷酸序列如SEQIDNO.3所示，长度为1611bp，编码脱氢酶(dehydrogenase)；（3）2292基因，核苷酸序列如SEQIDNO.4所示，长度为936bp,编码转座酶(transposase)；（4）2295基因，核苷酸序列如SEQIDNO.5所示，长度为2547bp，编码2-乙酰辛醛氨基转移酶（pigE）；（5）2296基因，核苷酸序列如SEQIDNO.6所示，长度为2454bp，编码2-乙酰辛醛合酶（pigD）；（6）2297基因，核苷酸序列如SEQIDNO.7所示，长度2703bp，编码缩合酶（pigC）；（7）2298基因，核苷酸序列如SEQIDNO.8所示，长度为1704bp，编码2-氢2-甲基-3-戊基吡咯脱氢酶（pigB）；（8）2300基因，核苷酸序列如SEQIDNO.9所示，长度为1155bp,编码乙酰CoA脱氢酶(acyl-CoAdehydrogenase)；（9）2302基因，核苷酸序列如SEQIDNO.10所示，长度为273bp，编码酰基载体蛋白(acylcarrierprotein)；（10）2303基因，核苷酸序列如SEQIDNO.11所示，长度为1809bp，编码8-氨基-7-氧代壬合酶（8-amino-7-oxononanoatesynthase）；（11）2306基因，核苷酸序列如SEQIDNO.12所示，长度为1560bp，编码D-丙氨酸-聚磷酸酯连接酶（D-alanine--poly(phosphoribitol)ligase（pigI）；（12）2307基因，核苷酸序列如SEQIDNO.13所示，长度为2601bp，编码聚酮合酶（polyketidesynthase）；（13）2308基因，核苷酸序列如SEQIDNO.14所示，长度为651bp，编码甲基转移酶(methyltransferasetype12)；（14）2310基因，核苷酸序列如SEQIDNO.15所示，长度为1278bp,编码烷基甘油单加氧酶类(alkylglycerolmonooxygenase-likeenzyme)；（15）2311基因，核苷酸序列如SEQIDNO.16所示，长度为744bp，编码转录调节因子LuxR（familytranscriptionalregulator）。本专利技术的优点在于：本专利技术提供了一株海洋来源的产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB，该菌株能同时直链形式的产生庚基灵菌红素(heptylprodi本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一株产灵菌红素类色素菌株 S2-4-1HMB，其特征在于：所述菌株 S2-4-1HMB的分类命名为：

【技术特征摘要】
1.一株产灵菌红素类色素菌株S2-4-1HMB，其特征在于：所述菌株S2-4-1HMB的分类命名为：SpartinivicinusruberS2-4-1HMB，该菌株保藏于广东省微生物菌种保藏中心，保藏编号：GDMCCNO：60932，保藏日期：2019年12月11日，保藏地址：中国广州市先烈中路100号大院59号楼5楼。


2.如权利要求1所述的一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB在制备直链形式的庚基灵菌红素与环化庚基灵菌红素中的应用。


3.一种由权利要求1所述一株产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB产生的直链形式的庚基灵菌红素与环化庚基灵菌红素。


4.一种含权利要求3所述由产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB产生的直链形式的庚基灵菌红素和/或环化庚基灵菌红素的药物。


5.一种来源于权利要求1所述产灵菌红素类色素的菌株S2-4-1HMB的灵菌红素类色素合成基因簇，其特征在于：所述基因簇包含15个已知功能基因，所述基因分别为：
（1）2285基因，核苷酸序列如SEQIDNO.2所示,长度为1272bp，编码黄素腺嘌呤二核苷酸/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸/烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸结合氧化还原酶；
（2）2290基因，核苷酸序列如SEQIDNO.3所示，长度为1611bp，编码脱氢酶；
（3）2292基因，核苷酸序列如SEQIDNO.4所示，长度为936bp,编码转座酶；
（4）2295基...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄兆斌，董乐，
申请(专利权)人：泉州师范学院，
类型：发明
国别省市：福建;35