一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物及其检测方法技术

技术编号:23664729 阅读:48 留言:0更新日期:2020-04-04 14:55
本发明专利技术公开一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物及其检测方法,包括重亚硫酸盐转化后GPVI基因启动子区的扩增引物对和测序引物GPVI‑S;上游引物GPVI‑F的序列为5′‑ATTAGGGAGTTTATGGGAGTACGG‑3′,下游引物GPVI‑R的序列为:5′‑Biotin‑ATTCCTCAACCCTATCCTAAACTCTAT‑3′;测序引物GPVI‑S的序列为:5′‑AATATAGATTAGGTTTTAGTAGG‑3′。本申请采用焦磷酸测序法进行测序,高效检测目标区域CpG岛甲基化和非甲基化比例,评估GPVI启动子区甲基化水平,可作为发生心肌梗死的早期指标。

A primer for detecting methylation level of promoter region of GPVI gene and its detection method

【技术实现步骤摘要】
一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物及其检测方法
本专利技术涉及生物基因检测
具体地说是一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物及其检测方法。
技术介绍
血小板过度活化会引起不必要的血小板聚集,最终导致血栓形成,引发心血管疾病。近年来,很多研究显示冠心病发生发展过程中与基因表观遗传学DNA甲基化模式絮乱有密切关系。因此,研究DNA甲基化在冠心病发病过程中的作用机制,可为冠心病的诊断和治疗提供新思路。在血小板参与冠心病发生发展过程中,血小板膜上的受体起着关键作用。糖蛋白VI(glycoproteinVI,GPVI)是血小板膜上众多受体之一,也是目前研发新型抗血栓药物的热门靶点。人GPVI基因定位于染色体19q13.4-42,DNA片段长度约为23000bp,基因组结构由8个外显子和7个内含子构成,为I型跨膜糖蛋白,属免疫球蛋白超家族的一员。GPVI只在血小板及血小板前体细胞--骨髓中的巨核细胞上表达,它是胶原的主要受体,介导血小板与胶原的黏附,并把这一黏附信号通过与其相连的FcRγ链“自外而内”传递到血小板内部,开始一本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物,其特征在于,包括重亚硫酸盐转化后GPVI基因启动子区的扩增引物对和测序引物GPVI-S;/n所述扩增引物对包括上游引物GPVI-F和下游引物GPVI-R,所述上游引物GPVI-F的序列为5′-ATTAGGGAGTTTATGGGAGTACGG-3′,所述下游引物GPVI-R的序列为:5′-Biotin-ATTCCTCAACCCTATCCTAAACTCTAT-3′;/n所述测序引物GPVI-S的序列为:5′-AATATAGATTAGGTTTTAGTAGG-3′。/n

【技术特征摘要】
1.一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的引物,其特征在于,包括重亚硫酸盐转化后GPVI基因启动子区的扩增引物对和测序引物GPVI-S;
所述扩增引物对包括上游引物GPVI-F和下游引物GPVI-R,所述上游引物GPVI-F的序列为5′-ATTAGGGAGTTTATGGGAGTACGG-3′,所述下游引物GPVI-R的序列为:5′-Biotin-ATTCCTCAACCCTATCCTAAACTCTAT-3′;
所述测序引物GPVI-S的序列为:5′-AATATAGATTAGGTTTTAGTAGG-3′。


2.一种检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,使用权利要求1所述的扩增引物对,对重亚硫酸盐转化后人血液GPVI基因启动子区进行扩增,并使用所述测序引物GPVI-S对所检测的基因区域的5个CpG位点的甲基化比例进行检测,通过检测得到的甲基化率,测定GPVI基因在血液中的表达水平。


3.根据权利要求2所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)血液样本采集;
(2)白细胞分离;
(3)基因组DNA提取;
(4)重亚硫酸盐转化;
(5)GPVI基因启动子区PCR扩增反应;
(6)琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物;
(7)焦磷酸测序反应和结果分析。


4.根据权利要求3所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,在步骤(1)中,使用EDTA抗凝管采集人静脉血2ml。


5.根据权利要求3所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,在步骤(2)中,使用Ficoll密度梯度法分离人静脉血中的白细胞。


6.根据权利要求3所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,在步骤(3)中,使用Biospin全血基因组DNA提取试剂盒提取白细胞基因组DNA。


7.根据权利要求3所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,在步骤(4)中,使用EZDNA甲基化全套试剂盒-gold中的重亚硫酸盐处理步骤(3)中基因组DNA样本。


8.根据权利要求3所述的检测GPVI基因启动子区甲基化水平的检测方法,其特征在于,在步骤(5)中,重亚硫酸盐转化后GPVI基...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴鸿韩勇军高水波王振涛雷震王新洲高海霞
申请(专利权)人:河南中医药大学
类型:发明
国别省市:河南;41

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