免疫疗法的组合物和方法技术

本发明专利技术提供用于癌症免疫疗法的生物回路系统、效应模块和组合物。还提供了用于在受试者中诱导抗癌免疫应答的方法。

Composition and method of immunotherapy

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】免疫疗法的组合物和方法相关申请的交叉引用本申请要求提交于2017年3月3日名称为CompositionsandMethodsforImmunotherapy的美国临时专利申请号62/466,601、提交于2017年4月11日名称为CompositionsandMethodsforImmunotherapy的美国临时专利申请号62/484,063以及提交于2017年8月8日名称为CompositionsandMethodsforImmunotherapy的美国临时专利申请62/542,402的优先权，每个专利的内容均以全文引用的方式并入本文。序列表本申请连同以电子格式的序列表一起提交。序列表提供为创建于2018年3月2日名称为2095_1207PCT_SL.txt的文件，所述文件的大小为1,566,189字节。电子格式的序列表中的信息以全文引用的方式并入本文。
本专利技术涉及用于免疫疗法的组合物和方法。本专利技术中所提供的包括在癌症免疫疗法中使用的生物回路系统、效应模块(effectormodule)、刺激物应答元件(SRE)和免疫治疗剂的多肽、编码所述多肽的多核苷酸、含有所述多肽和/或多核苷酸的载体和细胞。在一个实施方案中，组合物包含调整蛋白稳定性的去稳定结构域(DD)。
技术介绍
癌症免疫疗法的目的在于通过复原肿瘤反应性免疫细胞(主要是T细胞)的杀肿瘤功能来消灭癌细胞。癌症免疫疗法的策略，包括最近的检查点阻断、过继性细胞转移(ACT)和可以增加抗肿瘤免疫效应细胞的癌症疫苗的开发，已经在若干肿瘤中产生了显著的结果。宿主抗肿瘤免疫和癌症免疫疗法的影响受到三个主要障碍的阻碍：1)由克隆删除(clonaldeletion)所致的肿瘤抗原特异性T细胞数少；2)肿瘤微环境中固有免疫细胞的活化不良和致耐受性抗原呈递细胞的积累；以及3)免疫抑制性肿瘤微环境的形成。特别地，由于在免疫抑制性肿瘤微环境中缺乏有效的抗肿瘤应答，所以在实体瘤中免疫治疗方案的治疗功效仍不令人满意。肿瘤细胞常常诱导免疫耐受或抑制，并且获得此类耐受是因为即使真正的外来肿瘤抗原也将变得耐受。此类耐受还是活跃的并且占优势的，因为癌症疫苗以及预活化的免疫效应细胞(例如，T细胞)的过继性转移受到肿瘤微环境(TME)中抑制因子的抑制。此外，施用工程化的T细胞可导致在靶/脱靶毒性以及细胞因子释放综合征(由TeyClin.Transl.Immunol.,2014,3:e1710.1038综述)。在不良事件的情况下，需要开发可以打开或关闭转基因免疫治疗剂表达的可调开关。例如，过继性细胞疗法可具有非常长并且无限期的半衰期。由于毒性可以是渐进的，所以需要安全开关来消除输注的细胞。可以以高灵活性调整转基因蛋白水平和表达窗的系统和方法可以增强治疗益处，并减少潜在的副作用。为了开发可针对疾病疗法、特别是癌症免疫疗法调控的治疗剂，本专利技术提供了控制免疫治疗剂表达的生物回路系统。所述生物回路系统包含刺激物和至少一个对刺激物有应答的效应模块。效应模块可包括结合刺激物并对刺激物有应答的刺激物应答元件(SRE)和可操作地连接至SRE的免疫治疗剂。在一个实例中，SRE是去稳定结构域(DD)，其在不存在其特异性配体的情况下是去稳定的并且可通过结合至其特异性配体而稳定。
技术实现思路
本专利技术提供用于免疫疗法的组合物和方法。所述组合物涉及在细胞中或在受试者中诱导抗癌免疫应答的可调系统和剂。可调系统和剂可以是包含至少一个对至少一种刺激物有应答的效应模块的生物回路系统。生物回路系统可以是但不限于去稳定结构域(DD)生物回路系统、二聚生物回路系统、受体生物回路系统和细胞生物回路系统。这些系统进一步教导于共同拥有的提交于2016年4月11日的美国临时专利申请号62/320,864、提交于2017年3月3日的美国临时专利申请号62/466,596以及国际公布WO2017/180587(每个专利的内容均以全文引用的方式并入本文)。在一些实施方案中，用于诱导免疫应答的组合物可包含第一效应模块。在一些实施方案中，效应模块可包含可操作地连接至至少一个有效载荷的第一刺激物应答元件(SRE)。在一个方面中，有效载荷可为免疫治疗剂。在一些实施方案中，免疫治疗剂可选自但不限于细胞因子、安全开关、调控开关、嵌合抗原受体及其组合。在一个方面中，组合物的第一SRE可对至少一种刺激物有应答或与至少一种刺激物相互作用。在一些实施方案中，第一SRE可包含去稳定结构域(DD)。DD可来源于亲本蛋白或来源于与亲本蛋白相比具有一个、两个、三个或更多个氨基酸突变的突变蛋白。在一些实施方案中，亲本蛋白可选自但不限于：人蛋白FKBP，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.3；人DHFR(hDHFR)，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.2；大肠杆菌DHFR，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.1；PDE5，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.4；PPARγ，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.5；CA2，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.6；或NQO2，其包含氨基酸序列SEQ.IDNO.7。在一个方面中，亲本蛋白为hDHFR并且DD包含具有至少一个选自以下的突变的突变蛋白：M1del、V2A、C7R、I8V、V9A、A10T、A10V、Q13R、N14S、G16S、I17N、I17V、K19E、N20D、G21T、G21E、D22S、L23S、P24S、L28P、N30D、N30H、N30S、E31G、E31D、F32M、R33G、R33S、F35L、Q36R、Q36S、Q36K、Q36F、R37G、M38V、M38T、T40A、V44A、K47R、N49S、N49D、M53T、G54R、K56E、K56R、T57A、F59S、I61T、K64R、N65A、N65S、N65D、N65F、L68S、K69E、K69R、R71G、I72T、I72A、I72V、N73G、L74N、V75F、R78G、L80P、K81R、E82G、H88Y、F89L、R92G、S93G、S93R、L94A、D96G、A97T、L98S、K99G、K99R、L100P、E102G、Q103R、P104S、E105G、A107T、A107V、N108D、K109E、K109R、V110A、D111N、M112T、M112V、V113A、W114R、I115V、V116I、G117D、V121A、Y122C、Y122D、Y122I、K123R、K123E、A125F、M126I、N127R、N127S、N127Y、H128R、H128Y、H131R、L132P、K133E、L134P、F135P、F135L、F135S、F135V、V136M、T137R、R138G、R138I、I139T、I139V、M140I、M140V、Q141R、D142G、F143S、F143L、E144G、D146G、T147A、F148S、F148L、F149L、P150L、E151G、I152V、D153A、D153G、E155G、本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于在细胞或受试者中诱导免疫应答的组合物，其包含第一效应模块，所述效应模块包含可操作地连接至至少一种免疫治疗剂的第一刺激物应答元件(SRE)，其中所述至少一种免疫治疗剂选自细胞因子、安全开关、调控开关、嵌合抗原受体及其组合。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170303 US 62/466,601;20170411 US 62/484,063;20171.一种用于在细胞或受试者中诱导免疫应答的组合物，其包含第一效应模块，所述效应模块包含可操作地连接至至少一种免疫治疗剂的第一刺激物应答元件(SRE)，其中所述至少一种免疫治疗剂选自细胞因子、安全开关、调控开关、嵌合抗原受体及其组合。


2.如权利要求1所述的组合物，其中所述第一SRE对至少一种刺激物有应答或与至少一种刺激物相互作用。


3.如权利要求2所述的组合物，其中所述第一SRE为去稳定结构域(DD)。


4.如权利要求3所述的组合物，其中所述DD来源于亲本蛋白或与所述亲本蛋白相比具有一个、两个、三个或更多个氨基酸突变的突变蛋白，其中所述亲本蛋白选自：
(a)包含氨基酸序列SEQIDNO.3的人蛋白FKBP，
(b)包含氨基酸序列SEQIDNO.1的人DHFR(hDHFR)，
(c)包含氨基酸序列SEQIDNO.2的大肠杆菌DHFR(ecDHFR)，
(d)包含氨基酸序列SEQIDNO.4的PDE5，
(e)包含氨基酸序列SEQIDNO.5的PPARγ，
(f)包含氨基酸序列SEQIDNO.6的CA2，
(g)包含氨基酸序列SEQIDNO.7的NQO2，和
(h)包含氨基酸序列SEQIDNO.224的人DPPIV。


5.如权利要求4所述的组合物，其中所述亲本蛋白为hDHFR并且所述DD包含具有至少一个选自以下的突变的突变蛋白：M1del、V2A、C7R、I8V、V9A、A10T、A10V、Q13R、N14S、G16S、I17N、I17V、K19E、N20D、G21T、G21E、D22S、L23S、P24S、L28P、N30D、N30H、N30S、E31G、E31D、F32M、R33G、R33S、F35L、Q36R、Q36S、Q36K、Q36F、R37G、M38V、M38T、T40A、V44A、K47R、N49S、N49D、M53T、G54R、K56E、K56R、T57A、F59S、I61T、K64R、N65A、N65S、N65D、N65F、L68S、K69E、K69R、R71G、I72T、I72A、I72V、N73G、L74N、V75F、R78G、L80P、K81R、E82G、H88Y、F89L、R92G、S93G、S93R、L94A、D96G、A97T、L98S、K99G、K99R、L100P、E102G、Q103R、P104S、E105G、A107T、A107V、N108D、K109E、K109R、V110A、D111N、M112T、M112V、V113A、W114R、I115V、V116I、G117D、V121A、Y122C、Y122D、Y122I、K123R、K123E、A125F、M126I、N127R、N127S、N127Y、H128R、H128Y、H131R、L132P、K133E、L134P、F135P、F135L、F135S、F135V、V136M、T137R、R138G、R138I、I139T、I139V、M140I、M140V、Q141R、D142G、F143S、F143L、E144G、D146G、T147A、F148S、F148L、F149L、P150L、E151G、I152V、D153A、D153G、E155G、K156R、Y157R、Y157C、K158E、K158R、L159P、L160P、E162G、Y163C、V166A、S168C、D169G、V170A、Q171R、E172G、E173G、E173A、K174R、I176A、I176F、I176T、K177E、K177R、Y178C、Y178H、F180L、E181G、V182A、Y183C、Y183H、E184R、E184G、K185R、K185del、K185E、N186S、N186D、D187G和D187N。


6.如权利要求5所述的组合物，其中所述刺激物选自甲氧苄啶(TMP)和甲氨蝶呤(MTX)。


7.如权利要求1所述的组合物，其中所述免疫治疗剂为细胞因子。


8.如权利要求7所述的组合物，其中所述细胞因子为白介素、干扰素、肿瘤坏死因子、转化生长因子B、CC趋化因子、CXC趋化因子、CX3C趋化因子或生长因子。


9.如权利要求8所述的组合物，其中所述细胞因子为白介素，并且所述白介素选自由以下组成的组：IL1、IL1-α、IL1-β、IL1-δ、IL1-ε、IL1-η、IL1-ζ、IL-RA、IL2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL8、IL9、IL10、IL10C、IL10D、IL11a、IL11b、IL13、IL14、IL16、IL17、IL-17A、IL17B、IL17C、IL17E、IL17F、IL18、IL19、IL20、IL20L、IL21、IL22、IL23、IL23A、IL24、IL25、IL26、IL27、IL28、IL29、IL30、IL31、IL32、IL33、IL34、IL36α、IL36β、IL36γ、IL36RN、IL37、IL37a、IL37b、IL37c、Il37d、IL37e和IL38。


10.如权利要求9所述的组合物，其中所述白介素为IL2，其包含氨基酸序列SEQIDNO.51。


11.如权利要求1所述的组合物，其中所述免疫治疗剂为安全开关。


12.如权利要求11所述的组合物，其中所述安全开关选自：Caspase9、诱导型FAS(iFAS)、诱导型caspase9(icasp9)、CD20/抗CD20抗体对、蛋白标签/抗标签抗体和紧凑自杀基因(RQR8)。


13.如权利要求12所述的组合物，其中所述安全开关为Caspase9，其包含氨基酸序列SEQIDNO.65。


14.如权利要求1所述的组合物，其中所述免疫治疗剂编码调控开关。


15.如权利要求14所述的组合物，其中所述调控开关选自FOXP3、Nr4a、FOXO和NF-κB。


16.如权利要求15所述的组合物，其中所述调控开关为FOXP3，其包含氨基酸序列SEQIDNO.103-106。


17.如权利要求1所述的组合物，其中所述免疫治疗剂为嵌合抗原受体(CAR)并且选自GD2CAR、Her2CAR、BCMACAR、CD33CAR、ALKCAR、CD22CAR和CD276CAR，其每一种均包含细胞外部分、跨膜结构域、细胞内信号传导结构域和任选地一个或多个共刺激结构域。


18.如权利要求17所述的组合物，其中所述CAR被设计为标准CAR、分裂CAR、关闭开关CAR、打开开关CAR、第一代CAR、第二代CAR、第三代CAR或第四代CAR。


19.如权利要求18所述的组合物，其中所述细胞外靶部分选自以下中的任一者：
i.IgNAR，
ii.Fab片段，
iii.Fab'片段，
iv.F(ab)'2片段，
v.F(ab)'3片段，
vi.Fv，
vii.单链可变片段(scFv)，
viii.bis-scFv、(scFv)2，
ix.微抗体，
x.双功能抗体，
xi.三功能抗体，
xii.四功能抗体，
xiii.内抗体，
xiv.二硫键稳定的Fv蛋白(dsFv)，
xv.单抗体，
xvi.纳米抗体，和
xvii.来源于特异性结合至感兴趣的蛋白、配体、受体、受体片段或肽适配体中任一者的抗体的抗原结合区。


20.如权利要求17所述的组合物，其中所述细胞外靶部分选自：ALK靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.242-257和422-429；CD22靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.258-262和430-432；CD276靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.263-270和433-436；GD2靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.271-349和437-465；CD33靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.350-357；BCMA靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.358-365；以及Her2靶部分，其包含氨基酸序列SEQIDNO.366-421和466-473。


21.如权利要求17所述的组合物，其中
(a)所述CAR的所述细胞内信号传导结构域为来源于T细胞受体CD3ζ的信号传导结构域或选自由FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b和CD66d组成的组的细胞表面分子；并且
(b)所述共刺激结构域是存在的并且选自由以下组成的组：2...

【专利技术属性】
技术研发人员：V·苏瑞，K·G·埃尔佩克，M·L·奥尔斯，B·多林斯基，N·科米德，S·F·海勒，A·库尔卡尼，M·C·英尼斯，D·J·李，
申请(专利权)人：黑曜石疗法公司，
类型：发明
国别省市：美国;US