鉴定多倍体作物优良单倍型的方法及应用、NPC6基因在油菜种子产油量育种中的应用技术

本发明专利技术属于作物分子育种技术领域，尤其涉及鉴定多倍体作物优良单倍型的方法及应用、NPC6基因在油菜种子产油量育种中的应用。本发明专利技术首次构建了在多倍体作物中能够快速鉴定目标性状优良单倍型的方法，并以油菜产油量为例，快速鉴定到一个能够提高甘蓝型油菜种子产油量的优良单倍型；确定了NPC6基因与油菜产油量之间的关系，为甘蓝型油菜产油量育种提供有重要价值的基因信息。

The method and application of identifying excellent haplotypes of polyploid crops and the application of npc6 gene in rapeseed seed oil yield breeding

【技术实现步骤摘要】
鉴定多倍体作物优良单倍型的方法及应用、NPC6基因在油菜种子产油量育种中的应用
本专利技术属于作物分子育种
，尤其涉及鉴定多倍体作物优良单倍型的方法及应用、NPC6基因在油菜种子产油量育种中的应用。
技术介绍
目前绝大部分的作物相对其原始祖先，都经历过基因组的多倍化或者复制，因此大部分的作物为多倍体，典型的作物如：小麦、甘蓝型油菜、棉花、大豆等。作物复杂的基因组为挖掘作物本身优良变异、鉴定目标性状优良基因带来了很大的挑战与困难。甘蓝型油菜是我国也是世界上最重要的油料作物之一，其是在约7500年前由二倍体的白菜(AA；2n＝2x＝20)和甘蓝(CC；2n＝2x＝18)自然杂交形成的异源四倍体(AACC；2n＝4x＝38)。由于白菜和甘蓝同属芸薹属，因此在A基因组和C基因组间存在大量的同源片段，因此甘蓝型油菜异源四倍体的基因组内存在大量的同源染色体片段交换，其基因组高度复杂。油菜最重要的育种目标是提高其种子的产油量，产油量是由单株产量和种子含油量二个性状组成。对于大部分的作物来讲，在人类长期驯化的过程中，对作物的产量和本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种鉴定多倍体作物优良单倍型的方法，其特征在于，包括：/n获取目标作物自然群体的全基因组SNP数据，以及所述自然群体的目标表型数据；/n针对目标性状，获取可能调控目标性状的基因数据；/n鉴定可能调控目标性状的基因在目标作物中的同源基因；/n基于目标作物基因组的LD decay，获得同源基因上下游各2倍LD decay区段内的SNP数据；/n基于所述LD decay区段内的SNP数据，结合目标性状的表型数据，进行候选基因关联分析，鉴定与目标性状显著关联的SNP；/n基于显著关联的SNP信息，鉴定目标基因在自然群体中的优势单倍型。/n

【技术特征摘要】
1.一种鉴定多倍体作物优良单倍型的方法，其特征在于，包括：
获取目标作物自然群体的全基因组SNP数据，以及所述自然群体的目标表型数据；
针对目标性状，获取可能调控目标性状的基因数据；
鉴定可能调控目标性状的基因在目标作物中的同源基因；
基于目标作物基因组的LDdecay，获得同源基因上下游各2倍LDdecay区段内的SNP数据；
基于所述LDdecay区段内的SNP数据，结合目标性状的表型数据，进行候选基因关联分析，鉴定与目标性状显著关联的SNP；
基于显著关联的SNP信息，鉴定目标基因在自然群体中的优势单倍型。


2.根据权利要求1所述的一种鉴定多倍体作物优良单倍型的方法，其特征在于：获取目标作物基因组LDdecay的方法包括从发表的文献中查询或利用SNP基因型数据进行计算。


3.如权利要求1或2所述的鉴定多...

【专利技术属性】
技术研发人员：蔡光勤，周永明，王学敏，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：湖北;42