用于花生品种鉴定的SNP芯片、制备方法及其应用技术

本发明专利技术公开了用于花生品种鉴定的SNP芯片，所述SNP芯片包含725个SNP分子标记，所述SNP分子标记的编号分别为SNP001～SNP725，核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：725所示。本发明专利技术同样提供了该SNP芯片的设计及制备方法，即该芯片所包含的SNP标记是通过分析花生栽培种重测序数据，检测SNP变异；对SNP标记进行筛选；再进行设计探针制作SNP芯片。本发明专利技术还提供了该SNP芯片在花生品种鉴定中的应用。本发明专利技术设计的725个SNP标记将为花生栽培种品种鉴定提供分子技术手段，进一步提升我国花生品种鉴定水平。

SNP chip, preparation method and application for peanut variety identification

【技术实现步骤摘要】
用于花生品种鉴定的SNP芯片、制备方法及其应用
本专利技术涉及植物品种鉴定的分子标记芯片领域，具体地说，涉及一种用于花生品种鉴定的SNP芯片、制备方法及其应用。
技术介绍
花生是我国重要的油料作物之一，对保障我国食用油安全至关重要。种子作为农作物生产的源头，优良品种在提高作物产量和品质中发挥重要作用。开展农作物的品种鉴定是解决当前种子市场品种争议，授予新品种权的重要依据，也是保障我国种业有序竞争的有效手段。目前，我国花生种子经营主体数量多，存在假冒伪劣种子、套牌侵权经营等问题，种子市场比较混乱，严重影响花生产业发展。花生品种鉴定技术在建立种子管理体系，打击套牌经营，裁决植物新品种保护、知识产权纠纷，维护种子市场秩序中的作用逐步显现。目前，花生品种鉴定技术还没有统一的鉴定程序和相关文件规程。花生品种鉴定技术主要还是通过传统的田间种植，观察一些重要的形态学性状进行判定。而花生具有不同的植物学类型，如珍珠豆型、普通型、多粒型、龙生型等，属于不同植物学类型的品种，农艺性状区分比较明显，但是属于同一植物学类型内的品种则难以区分。在1992年国际植本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于花生品种鉴定的SNP芯片，其特征在于，所述SNP芯片包括725个SNP分子标记，所述SNP分子标记的编号分别为SNP001～SNP725，核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ IDNO：725所示。/n

【技术特征摘要】
1.用于花生品种鉴定的SNP芯片，其特征在于，所述SNP芯片包括725个SNP分子标记，所述SNP分子标记的编号分别为SNP001～SNP725，核苷酸序列分别如SEQIDNO：1～SEQIDNO：725所示。


2.一种如权利要求1所述的SNP芯片的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：
1)对伏花生进行全基因组重测序，获得花生栽培种参考基因组；
2)对418份花生栽培种进行10X的重测序，与步骤1)获得的参考基因组进行序列的组装比对，检测全基因组变异，获得832,949个SNP分子标记；
3)对步骤2)所获...

【专利技术属性】
技术研发人员：鲁清，梁炫强，陈小平，李少雄，洪彦彬，
申请(专利权)人：广东省农业科学院作物研究所，
类型：发明
国别省市：广东;44