【技术实现步骤摘要】
电泳分离数据解析装置及方法、存储介质
本专利技术涉及一种用于对通过电泳分离获取到的分离数据进行解析的电泳分离数据解析装置、电泳分离数据解析方法以及用于使计算机执行该解析方法的计算机程序。
技术介绍
在生物化学领域存在以下情况:基于通过电泳分离得到的分离数据,求出在试样中混在一起的类似分子中的所关注的分子(核酸、蛋白质)的存在率,以在试样的解析中利用(参照专利文献1。)。例如是求出细胞集团中的野生型基因细胞和变异型基因细胞的存在率的情况、在表达解析中比较评价关注基因的表达量相对于对照基因的表达量的情况等情况。现有技术文献专利文献专利文献1:日本特开2005-69846号公报
技术实现思路
专利技术要解决的问题以往,作为求出关注分子的存在率的方法,存在以下的方法:获取通过琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳使试样分离后的凝胶的数字图像,根据该数字图像中的各分级的亮度来求出各分级的浓度,根据求出的各分级的浓度来计算关注分子的存在率。另外,在近年来的使用了毛细管、微细 ...
【技术保护点】
1.一种电泳分离数据解析装置,用于进行通过电泳分离得到的分离数据的解析,其具备:/n解析对象峰确定部,其构成为使用户输入与在所述分离数据中添加到解析对象的解析对象峰有关的解析对象峰信息,基于该解析对象峰信息来确定至少一个所述解析对象峰;/n关注峰确定部,其构成为使用户输入与所述解析对象峰中的关注峰有关的关注峰信息,基于该关注峰信息来确定所述关注峰;以及/n存在率计算部,其构成为基于所述解析对象峰的峰面积的合计值和所述关注峰的峰面积值来求出所有的所述解析对象峰中的所述关注峰的存在率。/n
【技术特征摘要】
20180803 JP 2018-1463551.一种电泳分离数据解析装置,用于进行通过电泳分离得到的分离数据的解析,其具备:
解析对象峰确定部,其构成为使用户输入与在所述分离数据中添加到解析对象的解析对象峰有关的解析对象峰信息,基于该解析对象峰信息来确定至少一个所述解析对象峰;
关注峰确定部,其构成为使用户输入与所述解析对象峰中的关注峰有关的关注峰信息,基于该关注峰信息来确定所述关注峰;以及
存在率计算部,其构成为基于所述解析对象峰的峰面积的合计值和所述关注峰的峰面积值来求出所有的所述解析对象峰中的所述关注峰的存在率。
2.根据权利要求1所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
所述存在率计算部构成为在确定了所述解析对象峰和所述关注峰时立即计算所述关注峰的存在率。
3.根据权利要求1所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
还具备存在率显示部,该存在率显示部构成为将由所述存在率计算部计算出的所述关注峰的存在率显示于显示装置。
4.根据权利要求2所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
还具备存在率显示部,该存在率显示部构成为将由所述存在率计算部计算出的所述关注峰的存在率显示于显示装置。
5.根据权利要求1至4中的任一项所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
所述解析对象峰确定部使用户输入的所述解析对象峰信息是包括添加到解析对象的峰的解析对象范围和将在所述解析对象范围中从解析对象排除的峰包括在内的解析排除范围,所述解析对象峰确定部构成为将所述解析对象范围内的除了所述解析排除范围内的峰以外的峰确定为所述解析对象峰,
所述关注峰确定部使用户输入的所述关注峰信息是包括要关注的峰的关注范围,所述关注峰确定部构成为将所述关注范围内的峰确定为所述关注峰。
6.根据权利要求5所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
还具备电泳图制作部,该电泳图制作部制作电泳图来作为所述分离数据,
所述解析对象峰确定部构成为使用户在所述电泳图上指定所述解析对象范围和所述解析排除范围,
所述关注峰确定部构成为使用户在所述电泳图上指定所述关注范围。
7.根据权利要求5所述的电泳分离数据解析装置,其特征在于,
还具备分离影像制作部,该分离影像制作部制作电泳流路上的峰的分离影像来作为所述分离数据,
所述解析对象峰确定部构成为使用户在所述分离影像上指定所述解析对象范围和所述解析排除范围。
8.一种电泳分离数据解析方法,是通过电泳分离得到的分离数据的解析方法,包括以下步骤:
...
【专利技术属性】
技术研发人员:熊谷英乡,原田亨,荻野康太,
申请(专利权)人:株式会社岛津制作所,
类型:发明
国别省市:日本;JP
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