一种肠癌生物标志物组合物及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种肠癌生物标志物组合物及其应用，所述生物标志物组合物包括梭菌科(Clostridiales Family XI)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum)和微单胞菌属(Parvimonas)。采用本发明专利技术确定的微生物的不同组合作为生物标志物组合物，用于结直肠癌和癌前病变的早期诊断和预后监测，准确性高，特异性好，灵敏度强。

A biomarker composition for colorectal cancer and its application

The invention provides a colon cancer biomarker composition and its application, the biomarker composition includes clostridia family Xi, Porphyromonas, Peptostreptococcus, Fusobacterium nucleus and parvimonas. Different combinations of microorganisms determined by the invention are used as biomarker compositions for early diagnosis and prognosis monitoring of colorectal cancer and precancerous lesions, with high accuracy, good specificity and strong sensitivity.

【技术实现步骤摘要】
一种肠癌生物标志物组合物及其应用
本专利技术属于微生物
，涉及一种肠癌生物标志物组合物及其应用，尤其涉及一种生物标志物组合物及其在结直肠癌诊断和结直肠癌早期筛查中的应用。
技术介绍
结直肠癌是消化道最常见的恶性肿瘤之一，流行病学资料显示，结直肠癌已经成为全球第三大常见癌症，致死率排名第四，在中国，随着人们生活方式和饮食习惯的改变，结直肠癌的发生率也在逐年攀升。结直肠癌也是最可预防的肿瘤之一，医学界认为，如果及早发现，结直肠癌是最容易治愈的癌症。结直肠腺瘤是常见的肠道良性肿瘤，起源于结直肠黏膜腺上皮，包括结肠腺瘤和直肠腺瘤。结直肠腺瘤与结直肠癌关系密切，研究认为，至少80％的结直肠癌由结直肠腺瘤演变而来，历时5年以上，平均10～15年。积极诊治结直肠腺瘤是控制和减少结直肠癌的重要途径。报道指出，早期发现和治疗可使结直肠癌的5年生存率提高到90％，病变非局限时期的5年生存率为58％，而晚期的5年生存率只有5％。在我国，超过80％的患者确诊时已发展到中晚期，早期诊断率只有10％。因此，重视结直肠腺瘤的筛查对于结直肠癌早期诊断和结直肠癌预后改善具有重要意义。传统的结直肠癌筛选方法主要为结肠镜检查，另外还有活体组织检查和脱落细胞学检查，这几种检查方法都是侵入式的，尤其是脱落细胞学检查取材繁琐，不易获得满意的标本，临床应用少。在没有相关症状的情况下，很多人避免进行结直肠癌的早期筛查，其过程痛苦，患者体验差。CN109576386A公开了一种鉴定肠道微生态状态的引物组合物及其应用，所述引物组合物为针对肠道细菌的16SrRNA设计的特异性引物，所述特异性引物包括随机碱基，所述随机碱基的个数为3-5个；所述肠道细菌包括共生梭菌、青春双歧杆菌、具核梭杆菌、厌氧消化链球菌或克雷伯氏菌属中的任意一种或至少两种的组合；基于所述引物组合物研发的试剂盒，检测肠道微生态失衡的特异性高达92.5％，灵敏度高达80.43％，但是对结直肠癌的早期筛查的准确性较弱。CN109680086A公开了一种检测微小微单胞菌的引物组及其检测体系和应用，通过设计并验证得到特异性的引物组，基于引物组摸索验证检测体系，各步骤各条件相互配合，协同增持，使其检测结果稳定准确，检测步骤简洁高效，具有广阔的应用前景和巨大的市场价值，但是同样存在对结直肠癌的早期筛查的准确性较弱的问题。因此，亟需一种非侵入式检测方法，能够高效准确地评估罹患结直肠癌的风险。
技术实现思路
针对现有技术的不足，本专利技术提供了一种肠癌生物标志物组合物及其应用，所述生物标志物组合物为粪便中的肠道微生物，用于评估个体罹患结直肠癌的风险，为结直肠癌的早期诊断提供了一种高灵敏度的非入侵方式。为达此目的，本专利技术采用以下技术方案：第一方面，本专利技术提供了一种肠癌生物标志物组合物，所述生物标志物组合物包括梭菌科(ClostridialesFamilyXI)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、具核梭杆菌(Fusobacteriumnucleatum)和微单胞菌属(Parvimonas)。优选地，所述卟啉单胞菌属(Porphyromonas)包括不解糖卟啉单胞菌(Porphyromonasasaccharolytica)。优选地，所述消化链球菌属(Peptostreptococcus)包括俄罗斯消化链球菌(Peptostreptococcusrussellii)和/或口炎消化链球菌(Peptostreptococcusstomatis)。优选地，所述微单胞菌属(Parvimonas)包括微小微单胞菌(Parvimonasmicra)。优选地，所述生物标志物组合物还包括肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、放线杆菌属(Actinobacillus)、丁酸弧菌属(Anaerostipes)、丹毒杆菌属(Erysipelatoclostridium)、Intestinimonas、厌氧菌属(Anaerotruncus)、唾液链球菌(Streptococcussalivarius)、Fusicatenibactersaccharivorans、副流感嗜血杆菌(Haemophilusparainfluenzae)、脆弱拟杆菌(Bacteroidesfragilis)、马赛布劳特氏菌(Blautiamassiliensis)或Dialisterpneumosintes中的任意一种或至少两种的组合。优选地，所述肠杆菌科(Enterobacteriaceae)包括肠杆菌属(Enterobacter)。优选地，所述放线杆菌属(Actinobacillus)包括猪放线杆菌(Actinobacillusporcinus)。优选地，所述丁酸弧菌属(Anaerostipes)包括丁酸产生菌(Anaerostipeshadrus)。优选地，所述丹毒杆菌属(Erysipelatoclostridium)包括多枝丹毒杆菌(Erysipelatoclostridiumramosum)。优选地，所述厌氧菌属(Anaerotruncus)包括Anaerotruncuscolihominis。优选地，所述生物标志物组合物还包括双歧杆菌属(Bifidobacterium)、蔷薇属(Roseburiaspp)、产气柯林斯菌(Collinsellaaerofaciens)、Dorealongicatena或乳杆菌长病毒(Lactonifactorlongoviformis)中的任意一种或至少两种的组合。优选地，所述双歧杆菌属(Bifidobacterium)包括假小链双歧杆菌(Bifidobacteriumpseudocatenulatum)。本专利技术中，专利技术人采集大量结直肠癌和癌前病变(结直肠腺瘤和结直肠肿瘤性息肉)患者和健康个体的粪便样本，利用高通量测序、实时荧光定量PCR、高分辨率熔解曲线法或生物芯片等方法，通过对粪便样本中微生物的丰度和相对含量差异进行对比分析和验证，确定了与结直肠癌和癌前病变相关的微生物标志物组合物；采用上述微生物的不同组合作为生物标志物组合物，用于结直肠癌和癌前病变的早期诊断和预后监测，准确性高，特异性好，灵敏度强。第二方面，本专利技术提供了一种如第一方面所述的生物标志物组合物的引物组，所述蔷薇属(Roseburiaspp)的引物如SEQIDNO:1～6所示，共包括3对引物组；SEQIDNO:1(第一上游引物)：GCGGTRCGGCAAGTCTGA；SEQIDNO:2(第一下游引物)：CCTCCGACACTCTAGTMCGAC；SEQIDNO:3(第二上游引物)：TGCGGCAAGTCTGATGTGAA；SEQIDNO:4(第二下游引物)：GTTTACGGCGTGGACTA本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种肠癌生物标志物组合物，其特征在于，所述生物标志物组合物包括梭菌科(Clostridiales Family XI)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum)和微单胞菌属(Parvimonas)。/n

【技术特征摘要】
1.一种肠癌生物标志物组合物，其特征在于，所述生物标志物组合物包括梭菌科(ClostridialesFamilyXI)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、具核梭杆菌(Fusobacteriumnucleatum)和微单胞菌属(Parvimonas)。


2.根据权利要求1所述的生物标志物组合物，其特征在于，所述卟啉单胞菌属(Porphyromonas)包括不解糖卟啉单胞菌(Porphyromonasasaccharolytica)；
优选地，所述消化链球菌属(Peptostreptococcus)包括俄罗斯消化链球菌(Peptostreptococcusrussellii)和/或口炎消化链球菌(Peptostreptococcusstomatis)；
优选地，所述微单胞菌属(Parvimonas)包括微小微单胞菌(Parvimonasmicra)。


3.根据权利要求1或2所述的生物标志物组合物，其特征在于，所述生物标志物组合物还包括肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、放线杆菌属(Actinobacillus)、丁酸弧菌属(Anaerostipes)、丹毒杆菌属(Erysipelatoclostridium)、Intestinimonas、厌氧菌属(Anaerotruncus)、唾液链球菌(Streptococcussalivarius)、Fusicatenibactersaccharivorans、副流感嗜血杆菌(Haemophilusparainfluenzae)、脆弱拟杆菌(Bacteroidesfragilis)、马赛布劳特氏菌(Blautiamassiliensis)或Dialisterpneumosintes中的任意一种或至少两种的组合；
优选地，所述肠杆菌科(Enterobacteriaceae)包括肠杆菌属(Enterobacter)；
优选地，所述放线杆菌属(Actinobacillus)包括猪放线杆菌(Actinobacillusporcinus)；
优选地，所述丁酸弧菌属(Anaerostipes)包括丁酸产生菌(Anaerostipeshadrus)；
优选地，所述丹毒杆菌属(Erysipelatoclostridium)包括多枝丹毒杆菌(Erysipelatoclostridiumramosum)；
优选地，所述厌氧菌属(Anaerotruncus)包括Anaerotruncuscolihominis。


4.根据权利要求1-3任一项所述的生物标志物组合物，其特征在于，所述生物标志物组合物还包括双歧杆菌属(Bifidobacterium)、蔷薇属(Roseburiaspp)、产气柯林斯...

【专利技术属性】
技术研发人员：朱永亮，穆延召，陆敏，张水龙，
申请(专利权)人：苏州普瑞森基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏;32