电泳解析方法、电泳解析装置以及电泳解析程序制造方法及图纸

本发明专利技术的电泳解析方法，基于与在电泳波形中的比18S峰(P1)更靠低分子侧的区域中随着RNA的劣化而出现的劣化生成物峰(P3)的位置相对应的特征量，对RNA的品质进行评价。在RNA劣化至18S峰(P1)消失的程度后，在比18S峰更靠低分子侧的区域中伴随RNA的劣化而出现劣化生成物峰(P3)，并伴随着RNA的劣化而向低分子侧移动，因此基于与该劣化生成物峰(P3)的位置相对应的特征量，即使是劣化后的RNA，也能够高精度地对其品质进行评价。

Electrophoretic analysis methods, apparatus and procedures

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】电泳解析方法、电泳解析装置以及电泳解析程序
本专利技术涉及通过对电泳波形进行波形解析来评价RNA分子的品质的电泳解析方法、电泳解析装置以及电泳解析程序。
技术介绍
在对RNA(核糖核酸)的品质进行评价时，有时使用电泳解析装置。RNA因酶(RNase)、热、紫外线等各种因素被分解而劣化。该RNA的劣化程度可以通过对RNA样品进行电泳从而得到的电泳波形(electrophoretogram：电泳图)的形状进行解析来进行评价。此外，通过对电泳波形进行波形解析而得到的RNA的劣化信息在基因表达研究中作为重要的参数来处理。作为RNA的劣化信息，提供有RIN、RINe、RQS、RQI、RQN、RIS等各种指标。这些劣化指标是使用从RNA样品得到的电泳波形中的特定的波形区域(时间范围)计算出的值，每个指标所使用的波形区域不同。图8是用于对从RNA样品得到的电泳波形中的各波形区域进行说明的图。如该图8所示，在从RNA样品得到的电泳波形中，包含18S片段的峰(18S峰P101)与28S片段的峰(28S峰P102)。如上所述的各劣化指标均使用18S峰P101以及28S峰P102来计算。作为劣化指标的一例的RIN例如是在安捷伦科技公司(AgilentTechnologies)提供的“2100BioAnalyzer”中采用的劣化指标。除了可以使用包含18S峰的波形区域以及包含28S峰的波形区域计算出该劣化指标RIN以外，还可以使用包含5S峰的波形区域等其他波形区域计算出该劣化指标RIN(例如，参照下述专利文献1以及非专利文献1)。作为劣化指标的另一例的RQI例如是在伯乐生命医学产品(Bio-Rad)公司提供的“Experion全自动电泳系统”中使用的劣化指标。除了可以使用包含18S峰的波形区域以及包含28S峰的波形区域计算出该劣化指标RQI以外，还可以使用18S峰之前的波形区域计算出该劣化指标RQI(例如，参照下述专利文献2以及非专利文献2)。作为劣化指标的其他例的RQS例如是在珀金埃尔默(PerkinElmer)公司提供的“LabChipGX自动化电泳系统”中使用的劣化指标。可以通过以18S峰以及28S峰为基础的4个特征量的线性耦合计算出该劣化指标RQS(例如，参照下述非专利文献3)。现有技术文献专利文献专利文献1：日本特许第4664280号公报专利文献2：日本特许第5620382号公报非专利文献非专利文献1：AndreasSchroeder等10人《TheRIN:anRNAint-egritynumberforassigningintegrityvaluestoRNAmeasurem-ents(RIN：RNA完整性数，用于为RNA测量指定完整性值)》(源自网络)、2006年1月31日、BioMedCentral出版社、2017年2月9日检索、网址<URL：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1413964/>非专利文献2：VladimirDenisov等5人《DevelopmentandvalidationofRQI:anRNAqualityindicatorfortheExperionautomatedelectrophoresissystem(RQI的开发和验证：Experion自动电泳系统的RNA质量指标)》(源自网络)、2008年、伯乐生命医学产品公司(Bio-RadLa-boratories，Inc.)、2017年2月9日检索、网址<URL：http://www.gene-quantification.com/Bio-Rad-bulletin-5761.pdf>非专利文献3：《RNAQualityScore(RQS)CalculationandCorrelationtoRIN(RNA质量得分(RQS)计算和与RIN的相关性)》(源自网络)、2009年11月9日、Caliper生命科学公司(CaliperLifeSciences，Inc.)、2017年2月9日检索、网址<URL：https://rtsf.na-tsci.msu.edu/genomics/tech-notes/caliper-gx-rin-calculations/>
技术实现思路
专利技术要解决的技术问题如上所述的以往所使用的劣化指标虽然可以使用18S峰以及28S峰进行计算，但这些18S峰以及28S峰存在随着RNA的劣化而峰强度减少、继而消失的特性。因此，在对劣化至某种程度的RNA的品质进行评价的情况下，存在不能高精度地进行评价的问题。本专利技术是鉴于上述实际情况而完成的，目的在于提供一种即使是对劣化后的RNA也能够高精度地评价其品质的电泳解析方法、电泳解析装置以及电泳解析程序。用于解决上述技术问题的手段本申请专利技术人深入研究的结果为，发现了在RNA的电泳波形中的比18S峰更靠低分子侧的区域(第一区)中，存在随着RNA的劣化而出现的劣化生成物峰，该劣化生成物峰伴随着RNA的劣化而向低分子侧移动。更具体而言，虽然在劣化前的RNA的电泳波形中存在18S峰以及28S峰，但这些18S峰以及28S峰随着RNA的劣化而峰强度减少，28S峰消失后，18S峰消失。然后，若RNA进一步劣化，则会出现劣化生成物峰，劣化生成物峰伴随着RNA的劣化而向低分子侧移动，继而消失。(1)本专利技术的电泳解析方法，是一种通过对电泳波形的波形解析而对RNA的品质进行评价的电泳解析方法，基于与在电泳波形中的比18S峰更靠低分子侧的区域中随着RNA的劣化而出现的劣化生成物峰的位置相对应的特征量，对RNA的品质进行评价。根据这样的构成，能够基于与电泳波形中的劣化生成物峰的位置相对应的特征量，对劣化后的RNA的品质进行评价。即，在RNA劣化至18S峰消失的程度之后，在比18S峰更靠低分子侧的区域中随着RNA的劣化出现劣化生成物峰，劣化生成物峰伴随着RNA的劣化而向低分子侧移动，因此基于与该劣化生成物峰的位置相对应的特征量，即使是劣化后的RNA，也能够高精度地对其品质进行评价。(2)与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量可以是表示所述劣化生成物峰的峰顶的位置的值。根据这样的构成，能够使用劣化生成物峰的峰顶的位置，准确地表示与劣化生成物峰的位置相对应的特征量。因此，基于该特征量，即使是劣化后的RNA，也能够高精度地对其品质进行评价。(3)与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量可以是表示将所述劣化生成物峰的面积分割为低分子侧区域与高分子侧区域时的面积比的值。根据这样的构成，能够使用将劣化生成物峰的面积分割为低分子侧区域与高分子侧区域时的面积比，准确地表示与劣化生成物峰的位置相对应的特征量。因此，基于该特征量，即使是劣化后的RNA，也能够高精度地对其品质进行评价。(4)与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量可以是表示所述劣化生成物峰的重心位置的值。根据这样的构成，能够使用劣化生成物峰的重心位置，准确地表示与劣化生成物峰的位置相对应的特征量。因此，基于该特征量，即使是劣化后的RNA，也能够高精度地对其品质进行评价。(5)也可以使用与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量、以及基于18S峰或28S峰的特征量，对RNA的品本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种电泳解析方法，通过对电泳波形的波形解析而对RNA的品质进行评价，其特征在于，基于与在电泳波形中的比18S峰更靠低分子侧的区域中随着RNA的劣化而出现的劣化生成物峰的位置相对应的特征量，对RNA的品质进行评价。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2017.03.10 JP 2017-0462091.一种电泳解析方法，通过对电泳波形的波形解析而对RNA的品质进行评价，其特征在于，基于与在电泳波形中的比18S峰更靠低分子侧的区域中随着RNA的劣化而出现的劣化生成物峰的位置相对应的特征量，对RNA的品质进行评价。2.如权利要求1所述的电泳解析方法，其特征在于，与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量是表示所述劣化生成物峰的峰顶的位置的值。3.如权利要求1所述的电泳解析方法，其特征在于，与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量是表示将所述劣化生成物峰的面积分割为低分子侧区域与高分子侧区域时的面积比的值。4.如权利要求1所述的电泳解析方法，其特征在于，与所述劣化生成物峰的位置相对应的特征量是表示...

【专利技术属性】
技术研发人员：知野见健太，
申请(专利权)人：株式会社岛津制作所，
类型：发明
国别省市：日本,JP