一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其应用制造技术

技术编号:20155318 阅读:31 留言:0更新日期:2019-01-19 00:07
本发明专利技术公开了一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其应用。一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,所述的组合物由92~96%白油及1~3%NP‑10、2~5%L548组成,各组分之和为100%。本发明专利技术所述的油相组合物在制备微滴式数字PCR检测试剂中的应用。本发明专利技术提供了用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物以及在微滴式数字PCR中的应用,最终使用本发明专利技术来制备的液滴具有大小均一、热稳定性好、不易产生气泡,不融合,且对PCR扩增无抑制作用等优点。

【技术实现步骤摘要】
一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其应用
本专利技术属于分子生物学
,涉及一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物及其应用。
技术介绍
微滴式数字PCR(DropletdigitalPCR,ddPCR)是第三代PCR(PolymerasChainReaction,聚合酶链式反应)技术,是一种对核酸分子进行绝对定量的方法,具备较高的灵敏度和准确性。它的原理是利用油包水原理在PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成数万个纳升级液滴,其中每个液滴不含或者含有一至数个待检核酸靶分子。经过PCR扩增之后,通过对每个微滴荧光信号逐一收集来进行统计,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0。根据阳性微滴的个数与比例以及泊松分布原理,可以得出靶分子的起始拷贝数或浓度。微滴式数字芯片是用来产生微滴颗粒的载体,由于表面张力作用,水相试剂在油相溶液中会形成一个独立的油包水颗粒,油相成分的溶液就是生成微滴颗粒的必备条件,也为微滴颗粒进行扩增时需要提供温度的热传导介质。油包水(W/O)乳化体系是由油相、水相和表面活性剂组成的。水相是内相或分散相,油相是外相或分散介质,表明活性剂一般是由非极性、亲油的碳氢链部分和极性、亲水的基团共同构成。根据相似相溶原理,易溶于水的属于水相,不易溶于水的属于油相,表面活性剂既亲水又亲油。表面活性剂对于微滴的形成以及稳定性有重要作用,可以降低油相和水相界面的张力,并在界面吸附形成界面膜,从而保证液滴的稳定性。但是液滴只是相对的、暂时的体系,液滴的沉降、聚集及融合使液滴具有不稳定性。常用的油相为氟化油,其缺点是易挥发、易产生气泡,与其相关的表面活性剂价格较高。因此需要有一种低成本的液滴制备方法,并且可以使生成的液滴大小均一,热稳定性好。故提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的目的是针对现有技术的上述不足,提供一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物。本专利技术的另一目的是提供该油相组合物的应用。本专利技术的目的可通过以下技术方案实现:一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,所述的组合物由92~96%白油及1~3%NP-10、2~5%L548组成,各组分之和为100%。其中%表示体积百分含量。所述的组合物优选由95%白油及2%NP-10、3%L548组成。本专利技术所述的白油为5号白油,芳烃含量低,无副作用。主要为饱和的环烷烃与链烷烃混合物。一种微滴式数字PCR液滴的制备方法,包括以下步骤:(1)配置水相,包括DNA,正向引物、反向引物、ddPCRSupermix、dNTP以及ddH2O,将上述液体以一定的比例关系均匀混合,作为反应水相予以备用;(2)配置油相,将本专利技术所述的油相组合物的各成分白油、NP-10、L548按照配方量均匀混合,获得的溶液作为反应油相予以备用;(3)水相、油相混合物在QX200微滴数字PCR系统进行微滴化处理获得微滴式数字PCR液滴。本专利技术所述的油相组合物在制备微滴式数字PCR检测试剂中的应用。本专利技术所述的油相组合物在微滴式数字PCR中的应用。有益效果:本专利技术提供了用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物以及用于微滴式数字PCR液滴的制备方法,最终使用本专利技术来制备的液滴具有大小均一、热稳定性好、不易产生气泡,不融合,且对PCR扩增无抑制作用等优点。附图说明图1实施例1中(1)组合物形成的液滴图图2实施例1中(2)组合物形成的液滴图图3实施例1中(4)组合物形成的液滴图图4微滴式数字PCR对EGFR基因突变的检测分析具体实施方式实施例1对油相加入不同的表面活性剂,根据不同表面活性剂和油相成分的溶解性,设计油相组合物如下:(1)98%5号白油)+2%NP-10;其中白油为5号工业级白油(国标),苏州赛帕汉特种油品有限公司,下同(2)97%5号白油+3%L548(3)97%5号白油+3%Tween80(4)95%5号白油+2%NP-10+3%L548(5)94%5号白油+3%L548+3%Tween80(6)95%5号白油+2%NP-10+3%Tween80结果:(1)、(2)和(4)的表面活性剂与油相可以较好相溶,(3)、(5)和(6)的表面活性剂与油相不相溶。实施例2进行液滴制备和PCR扩增,具体步骤如下:1、按照实施例1中筛选到的(1)、(2)、(4)配置油相;2、配置水相。模板来自非小细胞肺癌细胞株A549,具有EGFR突变。3、将配置好的20μL水相加入微滴发生卡中间一排的孔内,将70μL的油相组合物加入最底层一排孔内,通过QX200TMDropletGenerator(Bio-Rad,USA)制备反应微滴于顶层一排孔内。将微滴转移至八连排管中进行PCR扩增,反应程序为:95℃预变性10min,94℃变性30s,57℃退火延伸1min,共45个循环。4、显微镜观察液滴形态。结果:实施例1中组合物(1)(2)形成的液滴大小不均一,稳定性较差,(4)形成的液滴大小均匀且稳定。5、数据分析:使用QX-100dropletreader(Bio-Rad)和QuantaSoftanalysissoftware(Bio-Rad)进行数据分析。如图4所示,可检测出EGFR突变。本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于所述的组合物由92~96%白油及1~3%NP‑10、2~5%L548组成。

【技术特征摘要】
1.一种用于制备微滴式数字PCR液滴的油相组合物,其特征在于所述的组合物由92~96%白油及1~3%NP-10、2~5%L548组成。2.根据权利要求1所述的油相组合物,其特征在于所述的组合物由白油及2%NP-10、3%L548组成。3.一种微滴式数字PCR液滴的制备方法,其特征在于包括以下步骤:(1)配置水相,包括DNA,正向引物、反向引物、ddPCRSupermix、dNTP以及ddH2O,将上述液体...

【专利技术属性】
技术研发人员:段小红李曼曼承康平丁蕊张磊王东亮周启明
申请(专利权)人:南京求臻基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:江苏,32

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