【技术实现步骤摘要】
检测细胞质遗传的方法和设备
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种检测细胞质遗传的方法和设备。
技术介绍
细胞质遗传是指细胞核以外的遗传因子所决定的遗传现象,被称为非孟德尔遗传或核外遗传。动物中的细胞质遗传主要是线粒体遗传,而植物中的细胞质遗传包括线粒体遗传和质体遗传。植物中,最早的非孟德尔遗传现象报道与1909年,Baur等在研究天竺葵的“叶斑”遗传时,发现子代对双亲叶斑的遗传并不表现出孟德尔遗传的方式(Baur,1909)。由于细胞质遗传方式与植物细胞质雄性不育、质体或线粒体基因组突变引起的生长发育迟缓等现象密切相关。因此,深入研究细胞质遗传方式对于理解细胞质非孟德尔遗传背后的机理,甚至指导农业的生产都具有十分重要的意义。植物细胞质遗传的研究是建立在细胞学观察的基础上进行的。早期,Kuroiwa在研究衣藻的叶绿体遗传时,利用荧光显微镜结合DAPI染色的方法发现雄配子一方的叶绿体拟核(叶绿体DNA和蛋白的复合体)在合子形成后约1h内发生消失的现象(Kuroiwaetal.,1982)。这种细胞学的方法很快被用来检测被子植物花粉发育过程中生殖细胞或精细胞中细胞器 ...
【技术保护点】
1.一种检测生物材料细胞质遗传的方法,其特征在于,包括:(1)基于所述生物材料亲本样本细胞质核酸序列的多态性,在所述生物材料亲本样本中分别获得不同的多态性位点,所述亲本样本包括父本样本和母本样本;(2)基于所述不同的多态性位点,利用数字PCR技术获得子代样本细胞质核酸序列的多态性结果;(3)基于所述子代样本细胞质中的多态性结果,确定所述生物材料的细胞质遗传。
【技术特征摘要】
1.一种检测生物材料细胞质遗传的方法,其特征在于,包括:(1)基于所述生物材料亲本样本细胞质核酸序列的多态性,在所述生物材料亲本样本中分别获得不同的多态性位点,所述亲本样本包括父本样本和母本样本;(2)基于所述不同的多态性位点,利用数字PCR技术获得子代样本细胞质核酸序列的多态性结果;(3)基于所述子代样本细胞质中的多态性结果,确定所述生物材料的细胞质遗传。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞质核酸序列包括线粒体核酸序列、叶绿体核酸序列或者质粒核酸序列;任选地,所述核酸序列为DNA;任选地,所述多态性位点选自单核苷酸多态性位点、插入缺失位点、结构变异位点和拷贝数变异位点中的至少一种。3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(1)进一步包括:(1-1)对比分析所述父本样本和母本样本细胞质核酸序列的差异,以便确定所述父本样本和所述母本样本细胞质核酸序列的多态性;(1-2)基于所述父本样本和所述母本样本细胞质核酸序列的多态性,分别利用第一特异性引物和第二特异性引物在所述父本样本和所述母本样本中获得不同的多态性位点,分别利用第一探针和第二探针检测所述父本样本和所述母本样本细胞质核酸序列的多态性;其中所述第一特异性引物用来获得所述父本样本的细胞质核酸序列,所述第二特异性引物用来获得所述母本样本的细胞质核酸序列,所述第一探针用来检测所述父本样本细胞质核酸序列的多态性,所述第二探针用来检测所述母本样本细胞质核酸序列的多态性;任选地,所述第一探针和所述第二探针上均带有荧光基团和淬灭基团,所述第一探针和所述第二探针上的荧光基团不同。4.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其特征在于,步骤(2)进一步包括:(2-1)基于所述第一特异性引物和所述第二特异性引物以及所述第一探针和所述第二探针,利用数字PCR技术获得所述子代样本细胞质核酸序列的拷贝数和组成;(2-2)基于所述子代样本细胞质核酸序列的拷贝数和组成,确定所述子代样本细胞质核酸序列的多态性结果。5.根据权利要求1~4中任一项所述的方法,其特征在于,所述生物材料包括植物或动物;任选地,所述生物材料为真核生物;任选地,所述植物选自甜瓜、黄瓜、拟南芥、烟草、水稻、辣椒、番茄或玉米中的至少一种;任选地,所述植物为拟南芥,所述第一特异性引物和所述第二特异性引物相同,为SEQIDNO:3和SEQIDNO:4,所述第一探针为SEQIDNO:5,所述第二探针为SEQIDNO:6;所述植物为黄瓜,所述第一特异性引物为SEQIDNO:9和SEQIDNO:10,所述第二特异性引物为SEQIDNO:12和SEQIDNO:13,所述第一探针为SEQIDNO:11,所述第二探针为SEQIDNO:14;任选地,所述数字PCR的退火温度为53.7~56.3摄氏度;任选地,步骤(2)中所述子代样本的细胞核酸物质的使用量为10~50ng。6.一种检测...
【专利技术属性】
技术研发人员:沈佳,张跃建,寿伟松,
申请(专利权)人:浙江省农业科学院,
类型:发明
国别省市:浙江,33
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