【技术实现步骤摘要】
一种筛选酶中与酶活力相关的氨基酸残基的方法
本专利技术涉及一种筛选酶中与酶活力相关的氨基酸残基的方法，属于蛋白质工程
技术介绍
热稳定性是酶的一个关键因素，酶的热稳定性强不仅有利于延长酶的贮藏时间、减少酶在保存、运输过程中活力的损失，而且可以使酶在较高的温度下保持较高的活力，从而提高反应效率，缩短生产周期，进而降低生产成本。酶蛋白内氨基酸之间的静电相互作用，又被称为离子键或盐桥，长期以来被认为是影响蛋白稳定性的重要因素，是决定酶蛋白结构和功能的核心内在因素之一，因此，酶蛋白内部静电相互作用对于蛋白分子整体稳定性的贡献一直以来都是研究的焦点。但是，酶蛋白内产生静电相互作用的氨基酸所处位置不同，其对酶蛋白造成的影响可能不同，现有的关于盐桥对蛋白分子稳定性的影响的研究均存在一定的争议。其中，已经有研究是针对酶蛋白内产生静电相互作用的氨基酸分布规律进行分析与统计，来得出盐桥对蛋白分子稳定性的影响，此研究虽然取得了一定的进展，但尚未得出具有普遍意义的结论，无法为精确指导酶蛋白中静电相互作用的构建提供有效指导。为较为精确的得出对酶蛋白的稳定性造成影响的氨基酸分布规律...
【技术保护点】
1.一种筛选酶中与酶活力相关的氨基酸残基的方法，其特征在于，所述方法为筛选酶中所有带电荷的氨基酸残基作为基准氨基酸残基；将与基准氨基酸残基的位点数的差值小于5的氨基酸残基筛选出来，作为与该基准氨基酸残基相应的备选氨基酸残基；基准氨基酸残基以及与该基准氨基酸残基相应的备选氨基酸残基之间的位置关系需至少满足以下要求中的一个：(1)基准氨基酸残基与备选氨基酸残基位于同一二级结构中；所述二级结构包含α‑螺旋或β‑折叠；(2)处于同一α‑螺旋结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的位点数差值在2‑10之间；或处于同一β‑折叠结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出...
【技术特征摘要】
1.一种筛选酶中与酶活力相关的氨基酸残基的方法，其特征在于，所述方法为筛选酶中所有带电荷的氨基酸残基作为基准氨基酸残基；将与基准氨基酸残基的位点数的差值小于5的氨基酸残基筛选出来，作为与该基准氨基酸残基相应的备选氨基酸残基；基准氨基酸残基以及与该基准氨基酸残基相应的备选氨基酸残基之间的位置关系需至少满足以下要求中的一个：(1)基准氨基酸残基与备选氨基酸残基位于同一二级结构中；所述二级结构包含α-螺旋或β-折叠；(2)处于同一α-螺旋结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的位点数差值在2-10之间；或处于同一β-折叠结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的位点数差值不超过4；(3)基准氨基酸残基的Cα与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的Cα之间的距离在之间；(4)基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基中至少有一个为保守氨基酸残基；满足上述要求的备选氨基酸残基即为酶中与酶活力相关的氨基酸残基；或将满足上述要求的备选氨基酸残基进行分析，筛选出突变后有形成盐桥可能性的氨基酸残基，该备选氨基酸残基即为酶中与酶活力相关的氨基酸残基。2.如权利要求1所述的一种筛选酶中与酶活力相关的氨基酸残基的方法，其特征在于，所述方法为筛选酶中所有带电荷的氨基酸残基作为基准氨基酸残基；将与不含有谷氨酸的基准氨基酸残基位点数差值为4或5的氨基酸残基筛选出来，作为备选氨基酸残基；或将与含有谷氨酸的基准氨基酸残基位点数差值为3或4的氨基酸残基筛选出来，作为备选氨基酸残基；基准氨基酸残基以及与该基准氨基酸残基相应的备选氨基酸残基之间的位置关系需至少满足以下要求中的一个：(1)基准氨基酸残基与备选氨基酸残基位于同一二级结构中；所述二级结构包含α-螺旋或β-折叠；(2)处于同一α-螺旋结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的位点数差值在2-10之间；或处于同一β-折叠结构中的基准氨基酸残基与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的位点数差值不超过4；(3)基准氨基酸残基的Cα与以其为基准删选出来的备选氨基酸残基的Cα之间的...
【专利技术属性】
技术研发人员：李兆丰，班宵逢，顾正彪，李才明，程力，洪雁，
申请(专利权)人：江南大学，
类型：发明
国别省市：江苏,32
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。