一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法及装置制造方法及图纸

技术编号:19448206 阅读:55 留言:0更新日期:2018-11-14 17:12
本发明专利技术公开了一种定量检测产2‑甲基异莰醇菌株的方法及装置,该方法包括:取地表水水样,经过微孔过滤后,将滤膜进行总DNA提取纯化,得到DNA样本;以获得的DNA样本为模板进行PCR扩增;对PCR扩增产物进行纯化;将纯化后的DNA进行质粒转化过程,获得转化了质粒的白色菌落;选取饱满的单菌落接种于培养液中振荡培养过夜,以用于菌液PCR鉴定和测序分析;将经过鉴定分析的白色菌落提取质粒,测定质粒浓度后梯度稀释,将稀释后的质粒作为标准样品,建立标准样品浓度与临界循环数对应的标准曲线;取之前得到的DNA样本作为模板,进行定量PCR测定获得待测样本,根据所述标准曲线确定待测样本中产2‑甲基异莰醇菌株的浓度。

【技术实现步骤摘要】
一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法及装置
本专利技术涉及分子生物学领域,特别是涉及一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法及装置。
技术介绍
2-甲基异莰醇是水中常见的嗅味物质,主要由放线菌、真菌和蓝绿藻代谢产生,其在水中的嗅味阈值极低(10ng/L)。湖泊和水库的水体富营养化会产生嗅味物质,当水体发生富营养化后,在水体中可以检测到2-甲基异莰醇。广大消费者认为嗅味问题是影响饮用水水质的关键因素,产生异味不但影响人们的感官特征,甚至能对人的健康产生危害。嗅味问题已经在全球范围内产生了严重的影响,早在上世纪80年代的瑞士、芬兰、美国、加拿大、澳大利亚、英国、日本等国家均产生了严重的嗅味问题。我国随经济的发展对供水水质的要求也日益提高,此类问题近年来也已引起广泛的关注众所周知,蓝藻水华时可产生2-甲基异莰醇,此过程在几天内就可迅速完成,因此,这就需要水质监测部门能够快速检测2-甲基异莰醇。常规条件下可通过人的感官、气相色谱和质谱联用法测定嗅味物质的含量。但这些方法都要耗费大量的时间、精力,错过了嗅味物质风险预警分析的最佳时机。因此,建立高灵敏度、高特异性的定量检测方法迫在眉睫。专利技术本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种定量检测产2‑甲基异莰醇菌株的方法,包括如下步骤:步骤一,取地表水水样,经过微孔过滤后,将滤膜进行总DNA提取纯化,得到DNA样本;步骤二,以步骤一获得的DNA样本为模板进行PCR扩增;步骤三,对PCR扩增产物进行纯化;步骤四,将纯化后的DNA进行质粒转化过程,获得转化了质粒的白色菌落;步骤五,选取饱满的单菌落接种于培养液中,并振荡培养过夜,以用于菌液PCR鉴定和测序分析;步骤六,将经过鉴定分析的白色菌落提取质粒,测定质粒浓度后,梯度稀释,将稀释后的质粒作为标准样品,建立标准样品的浓度与临界循环数对应的一元线性回归曲线,即得到标准曲线;步骤七,取步骤一中得到的DNA样本作为模板,进行定...

【技术特征摘要】
1.一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,包括如下步骤:步骤一,取地表水水样,经过微孔过滤后,将滤膜进行总DNA提取纯化,得到DNA样本;步骤二,以步骤一获得的DNA样本为模板进行PCR扩增;步骤三,对PCR扩增产物进行纯化;步骤四,将纯化后的DNA进行质粒转化过程,获得转化了质粒的白色菌落;步骤五,选取饱满的单菌落接种于培养液中,并振荡培养过夜,以用于菌液PCR鉴定和测序分析;步骤六,将经过鉴定分析的白色菌落提取质粒,测定质粒浓度后,梯度稀释,将稀释后的质粒作为标准样品,建立标准样品的浓度与临界循环数对应的一元线性回归曲线,即得到标准曲线;步骤七,取步骤一中得到的DNA样本作为模板,进行定量PCR测定获得待测样本,根据所述标准曲线确定待测样本中产2-甲基异莰醇菌株的浓度。2.如权利要求1所述的一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,其特征在于:于步骤二中,采用PCR反应体系为50μL,引物信息如下:上游引物序列为SEQIDNO.1、下游引物序列为SEQIDNO.2,反应程序为:95℃预变性5分钟,随后94℃15秒,退火温度60℃45秒和72℃延伸40秒,进行45个循环,最终72℃延伸10分钟,并通过1.5%(wt/vol)的琼脂糖凝胶电泳确认产物。3.如权利要求1所述的一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,其特征在于:于步骤三中,利用DNA胶回收试剂盒进行胶回收,对PCR扩增产物进行纯化,并通过1.5%的琼脂糖凝胶电泳确认回收是否成功。4.如权利要求1所述的一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,其特征在于:于步骤四中,将经步骤三纯化后的DNA插入质粒载体中,并进一步转化到DH5α感受态大肠杆菌溶液,然后涂布到加入Amp抗性的LB固体培养基上,通过蓝白斑筛选,挑选转化了质粒的白色菌落。5.如权利要求1所述的一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,其特征在于:于步骤五中,选取饱满的单菌落接种于含有Amp的液体LB培养液中,于37℃、180-200转/分钟振荡培养过夜,以用于菌液PCR鉴定和测序分析。6.如权利要求1所述的一种定量检测产2-甲基异莰醇菌株的方法,其特征在于,步骤七进一步包括:加入实时定量PCR所需试剂,反应体系为20μL,2μLDNA样品;进行实时定量PCR反应,进行PCR扩增;反应结束...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈蕾姜蕾
申请(专利权)人:上海城市水资源开发利用国家工程中心有限公司
类型:发明
国别省市:上海,31

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