在CTDNA中具有PIK3CA突变的预选患者中用PI3K抑制剂治疗癌症制造技术

本发明专利技术部分地涉及基于来自癌症患者的血液或血清样品中是否存在PI3K突变的化验的选择性癌症治疗方案。所述癌症用5‑(2,6‑二‑吗啉‑4‑基‑嘧啶‑4‑基)‑4‑三氟甲基‑吡啶‑2‑基胺或其盐酸盐，或者(S)‑吡咯烷‑1,2‑二羧酸2‑酰胺1‑({4‑甲基‑5‑[2‑(2,2,2‑三氟‑1,1‑二甲基‑乙基)‑吡啶‑4‑基]‑噻唑‑2‑基}‑酰胺)治疗。

Treatment of cancer with PI3K inhibitors in preselected patients with PIK3CA mutation in CTDNA

The invention relates in part to a selective cancer treatment scheme based on a test for the presence of a PI3K mutation in a blood or serum sample from a cancer patient. The cancer is used 5 (2,6 two), 4, three fluoromethyl, pyridine 2, 2, or its hydrochloride, or (S). Treatment.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】在CTDNA中具有PIK3CA突变的预选患者中用PI3K抑制剂治疗癌症专利
本专利技术涉及用于治疗癌症患者的新颖的个人化疗法、试剂盒、信息的可传送形式和方法。技术背景磷脂酰肌醇3-激酶(PI-3激酶或PI3K)包括一类脂质和丝氨酸/苏氨酸激酶，该激酶催化磷酸转移到肌醇脂质的D-3′位置以生成磷酸肌醇-3-磷酸(PIP)、磷酸肌醇-3,4-二磷酸(PIP2)和磷酸肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3)，从而通过使包含普列克底物蛋白-同源物、FYVE、Phox和其他磷脂结合域的蛋白入坞到常位于原生质膜的多种信号络合物中来在信号级联中起第二信使作用((Vanhaesebroeck等，Annu.Rev.Biochem70:535(2001)；Katso等，Annu.Rev.CellDev.Biol.17:615(2001))。在两种1型PI3K中，1A型PI3K是p110催化亚基(α、β、δ同种型)组成型缔合调节亚基(可以是p85α、p55α、p50α、p85β或p55γ)组成的异二聚物。1B型亚型具有一个成员，p110γ催化亚基缔合两个调节亚基p101或p84其一组成的异二聚物(Fruman等，AnnuRev.Biochem.67:481(1998)；Suire等，Curr.Biol.15:566(2005))。p85/55/50亚基的模块结构域包括Src同源物(SH2)域，其结合活化受体和细胞质酪氨酸激酶上特定序列环境中的磷酸酪氨酸残基，导致1A型PI3K活化和定位。1B型PI3K通过结合各种不同的肽和非肽配体的G蛋白偶连受体直接活化(Stephens等，Cell89:105(1997))；Katso等，Annu.Rev.CellDev.Biol.17:615-675(2001))。因此，得到的1型PI3K的磷脂产物将上游受体与下游细胞活动相连，所述细胞活动包括增殖、存活、趋化、细胞运输、运动、新陈代谢、发炎和过敏反应、转录和翻译(Cantley等，Cell64:281(1991)；Escobedo和Wiliams，Nature335:85(1988)；Fantl等，Cell69:413(1992))。PI-3激酶抑制剂是可用于治疗各种人类病症的治疗化合物。PI3K的异常调节经常通过Akt活化提高存活，这是人类癌症中的最盛行事件之一，并且已经显示以多种水平发生。在一些肿瘤中，p110α同种型PIK3CA的基因扩增并在若干人类癌症中证明了它们的基因产物的蛋白表达增大。在其他肿瘤中，PIK3CA中活化下游信号通路的体细胞错义突变已经在多种人类癌症中有相当多的描述(Kang等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA102:802(2005)；Samuels等，Science304:554(2004)；Samuels等，CancerCell7:561-573(2005))。磷酸肌醇-3激酶的失调是一种与人类癌症和增殖性疾病相关的常见失调。式(II)的特定嘧啶衍生化合物及其药物可接受盐是可用于治疗癌症的泛-PI3K抑制剂。式(II)化合物的化学名为5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺。这种化合物及其制备在WO2007/084786中公开。已证明这种嘧啶衍生物是一种有效的PI3K抑制剂，例如WO2007/084786和S.Maira等，MolecularCancerTherapeutics11:317-328(2012)，其对大范围的培养的人类癌症细胞系显示广泛活性。越来越多证据提示患者的遗传情况对患者的治疗响应性可有决定性作用。已有可用于癌症个体的许多疗法，可使用影响例如对特定药物响应的遗传因素的确定来为患者提供个人化治疗方案。这些个人化治疗方案提供了使患者的治疗收益最大化同时使可能与其他且效果较差的治疗方案相关的副作用最小化的潜能。因此，需要鉴定可用于预测患者是否有可能响应特定治疗疗法的因素。专利技术概述本专利技术基于以下发现，癌症患者的循环肿瘤DNA中存在PIK3CA突变可以预测这些患者更有可能响应PI3K抑制剂，该抑制剂选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)，尤其是5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺或其盐酸盐。在一个方面，本专利技术包括治疗癌症患者的方法，包括根据患者经确定在其循环肿瘤DNA(ctDNA)中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的PI3K抑制剂，其选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)。在一个实例中，该方法可包括根据患者经确定在其ctDNA中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的PI3K抑制剂，该抑制剂选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)；或者，根据患者未确定出其ctDNA中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的除选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂的以外的治疗剂。除选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂的以外的治疗剂的实例是氟维司群、曲妥单抗、拉帕替尼、吉非替尼、厄洛替尼、紫杉醇、依维莫司、甲氨蝶呤、氟尿嘧啶、阿纳托唑、依西美坦、卡陪他滨、环磷酰胺、来曲唑、托瑞米芬、吉西他滨盐酸盐、戈舍瑞林乙酸盐、帕博西尼、甲地孕酮乙酸盐、他莫昔芬、帕博西尼、帕妥珠单抗、或长春碱及其组合。本专利技术方法可用于治疗任何癌症，包括以下癌症：肺和支气管、前列腺、乳房、胰腺、结肠和直肠、甲状腺、肝和肝内胆管、肝细胞、胃、神经胶质瘤/成胶质细胞瘤、子宫内膜、黑素瘤、肾脏和肾盂、膀胱、子宫体、宫颈、卵巢、头部和颈部、多发性骨髓瘤、食道、急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、淋巴细胞性白血病、骨髓性白血病、脑部、口腔和咽、喉、小肠、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、和结肠绒毛腺瘤。在一个实例中，癌症选自乳癌和头颈部癌症。在另一个实例中，癌症为乳癌，例如转移性乳癌。在另一个方面，本专利技术包括用PI3K抑制剂治疗癌症患者的方法，该抑制剂选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种治疗癌症患者的方法，其包括根据该患者经确定其循环肿瘤DNA(ctDNA)中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的PI3K抑制剂，其选自5‑(2,6‑二‑吗啉‑4‑基‑嘧啶‑4‑基)‑4‑三氟甲基‑吡啶‑2‑基胺及其盐酸盐和(S)‑吡咯烷‑1,2‑二羧酸2‑酰胺1‑({4‑甲基‑5‑[2‑(2,2,2‑三氟‑1,1‑二甲基‑乙基)‑吡啶‑4‑基]‑噻唑‑2‑基}‑酰胺)。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.12.03 US 62/262,6201.一种治疗癌症患者的方法，其包括根据该患者经确定其循环肿瘤DNA(ctDNA)中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的PI3K抑制剂，其选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)。2.一种治疗癌症患者的方法，其包括:根据该患者经确定其ctDNA中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的PI3K抑制剂，其选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)；或根据该患者未确定出其ctDNA中存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的除选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂以外的治疗剂。3.以上权利要求中任一项的方法，其中该除选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂以外的治疗剂选自氟维司群、曲妥单抗、拉帕替尼、吉非替尼、厄洛替尼、紫杉醇、依维莫司、甲氨蝶呤、氟尿嘧啶、阿纳托唑、依西美坦、卡陪他滨、环磷酰胺、来曲唑、托瑞米芬、吉西他滨盐酸盐、戈舍瑞林乙酸盐、帕博西尼、甲地孕酮乙酸盐、他莫昔芬、帕博西尼、帕妥珠单抗或长春碱及其组合。4.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述PI3K抑制剂是5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺或其盐酸盐。5.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述PI3K抑制剂是(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)。6.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述癌症选自以下的癌症：肺和支气管、前列腺、乳房、胰腺、结肠和直肠、甲状腺、肝和肝内胆管、肝细胞、胃、神经胶质瘤/成胶质细胞瘤、子宫内膜、黑素瘤、肾脏和肾盂、膀胱、子宫体、宫颈、卵巢、头颈部、多发性骨髓瘤、食道、急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、淋巴细胞性白血病、骨髓性白血病、脑部、口腔和咽、喉、小肠、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤和结肠绒毛腺瘤。7.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述癌症选自乳癌和头颈部癌症。8.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述癌症为乳癌。9.一种用选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂治疗癌症患者的方法，其包括:根据该患者经确定其循环肿瘤DNA(ctDNA)中存在PIK3CA突变，选择用所述PI3K抑制剂进行治疗的患者；和然后，向该患者给予治疗有效量的所述PI3K抑制剂。10.一种用选自5-(2,6-二-吗啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺及其盐酸盐和(S)-吡咯烷-1,2-二羧酸2-酰胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-酰胺)的PI3K抑制剂治疗癌症患者的方法，其包括:a)化验来自乳癌患者的含ctDNA的血液或血浆样品以确定ctDNA中PIK3CA突变的存在；和b)根据该患者经确定存在PIK3CA突变，向该患者给予治疗有效量的所述PI3K抑制剂。11.如以...

【专利技术属性】
技术研发人员：E·迪托玛索，
申请(专利权)人：诺华股份有限公司，
类型：发明
国别省市：瑞士,CH